src/gromacs/utility/gmxomp.cpp

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 2012,2013,2014, by the GROMACS development team, led by
   5  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   6  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   7  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
   8  *
   9  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  10  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  11  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  12  * of the License, or (at your option) any later version.
  13  *
  14  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  15  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  16  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  17  * Lesser General Public License for more details.
  18  *
  19  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  20  * License along with GROMACS; if not, see
  21  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  22  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  23  *
  24  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  25  * consider that scientific software is very special. Version
  26  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  27  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  28  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  29  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  30  * official version at http://www.gromacs.org.
  31  *
  32  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  33  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  34  */
  35 /*! \internal \file
  36  * \brief
  37  * Implements functions from gmxomp.h.
  38  *
  39  * \ingroup module_utility
  40  */
  41 #include "gmxpre.h"
  42
  43 #include "gmxomp.h"
  44
  45 #include "config.h"
  46
  47 #include <stdio.h>
  48 #include <stdlib.h>
  49
  50 #ifdef GMX_OPENMP
  51 #include <omp.h>
  52 #endif
  53
  54 #include "gromacs/utility/common.h"
  55 #include "gromacs/utility/cstringutil.h"
  56 #include "gromacs/utility/exceptions.h"
  57 #include "gromacs/utility/fatalerror.h"
  58 #include "gromacs/utility/programcontext.h"
  59 #include "gromacs/utility/stringutil.h"
  60
  61 int gmx_omp_get_max_threads(void)
  62 {
  63 #ifdef GMX_OPENMP
  64     return omp_get_max_threads();
  65 #else
  66     return 1;
  67 #endif
  68 }
  69
  70 int gmx_omp_get_num_procs(void)
  71 {
  72 #ifdef GMX_OPENMP
  73     return omp_get_num_procs();
  74 #else
  75     return 1;
  76 #endif
  77 }
  78
  79 int gmx_omp_get_thread_num(void)
  80 {
  81 #ifdef GMX_OPENMP
  82     return omp_get_thread_num();
  83 #else
  84     return 0;
  85 #endif
  86 }
  87
  88 void gmx_omp_set_num_threads(int num_threads)
  89 {
  90 #ifdef GMX_OPENMP
  91     omp_set_num_threads(num_threads);
  92 #else
  93     GMX_UNUSED_VALUE(num_threads);
  94 #endif
  95 }
  96
  97 gmx_bool gmx_omp_check_thread_affinity(char **message)
  98 {
  99     bool shouldSetAffinity = true;
 100
 101     *message = NULL;
 102 #ifdef GMX_OPENMP
 103     /* We assume that the affinity setting is available on all platforms
 104      * gcc supports. Even if this is not the case (e.g. Mac OS) the user
 105      * will only get a warning. */
 106 #if defined(__GNUC__) || defined(__INTEL_COMPILER)
 107     const char *programName;
 108     try
 109     {
 110         programName = gmx::getProgramContext().displayName();
 111     }
 112     GMX_CATCH_ALL_AND_EXIT_WITH_FATAL_ERROR;
 113
 114     const char *const gomp_env            = getenv("GOMP_CPU_AFFINITY");
 115     const bool        bGompCpuAffinitySet = (gomp_env != NULL);
 116
 117     /* turn off internal pinning if GOMP_CPU_AFFINITY is set & non-empty */
 118     if (bGompCpuAffinitySet && *gomp_env != '\0')
 119     {
 120         try
 121         {
 122             std::string buf = gmx::formatString(
 123                         "NOTE: GOMP_CPU_AFFINITY set, will turn off %s internal affinity\n"
 124                         "      setting as the two can conflict and cause performance degradation.\n"
 125                         "      To keep using the %s internal affinity setting, unset the\n"
 126                         "      GOMP_CPU_AFFINITY environment variable.",
 127                         programName, programName);
 128             *message = gmx_strdup(buf.c_str());
 129         }
 130         GMX_CATCH_ALL_AND_EXIT_WITH_FATAL_ERROR;
 131         shouldSetAffinity = false;
 132     }
 133 #endif /* __GNUC__ || __INTEL_COMPILER */
 134
 135 #if defined(__INTEL_COMPILER)
 136     const char *const kmp_env         = getenv("KMP_AFFINITY");
 137     const bool        bKmpAffinitySet = (kmp_env != NULL);
 138
 139     /* disable Intel OpenMP affinity if neither KMP_AFFINITY nor
 140      * GOMP_CPU_AFFINITY is set (Intel uses the GNU env. var as well) */
 141     if (!bKmpAffinitySet && !bGompCpuAffinitySet)
 142     {
 143         int retval;
 144
 145 #ifdef _MSC_VER
 146         /* Windows not POSIX */
 147         retval = _putenv_s("KMP_AFFINITY", "disabled");
 148 #else
 149         /* POSIX */
 150         retval = setenv("KMP_AFFINITY", "disabled", 0);
 151 #endif  /* _MSC_VER */
 152
 153         if (debug)
 154         {
 155             fprintf(debug, "Disabling Intel OpenMP affinity by setting the KMP_AFFINITY=disabled env. var.\n");
 156         }
 157
 158         if (retval != 0)
 159         {
 160             gmx_warning("Disabling Intel OpenMp affinity setting failed!");
 161         }
 162     }
 163
 164     /* turn off internal pinning KMP_AFFINITY != "disabled" */
 165     if (bKmpAffinitySet && (gmx_strncasecmp(kmp_env, "disabled", 8) != 0))
 166     {
 167         try
 168         {
 169             std::string buf = gmx::formatString(
 170                         "NOTE: KMP_AFFINITY set, will turn off %s internal affinity\n"
 171                         "      setting as the two can conflict and cause performance degradation.\n"
 172                         "      To keep using the %s internal affinity setting, set the\n"
 173                         "      KMP_AFFINITY=disabled environment variable.",
 174                         programName, programName);
 175             *message = gmx_strdup(buf.c_str());
 176         }
 177         GMX_CATCH_ALL_AND_EXIT_WITH_FATAL_ERROR;
 178         shouldSetAffinity = false;
 179     }
 180 #endif /* __INTEL_COMPILER */
 181
 182 #endif /* GMX_OPENMP */
 183     return shouldSetAffinity;
 184 }