src/gromacs/mdlib/nbnxn_kernels/simd_2xnn/nbnxn_kernel_simd_2xnn_common.h

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 2012,2013,2014, by the GROMACS development team, led by
   5  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   6  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   7  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
   8  *
   9  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  10  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  11  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  12  * of the License, or (at your option) any later version.
  13  *
  14  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  15  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  16  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  17  * Lesser General Public License for more details.
  18  *
  19  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  20  * License along with GROMACS; if not, see
  21  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  22  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  23  *
  24  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  25  * consider that scientific software is very special. Version
  26  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  27  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  28  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  29  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  30  * official version at http://www.gromacs.org.
  31  *
  32  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  33  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  34  */
  35 #include "gromacs/mdlib/nbnxn_consts.h"
  36 #include "gromacs/pbcutil/ishift.h"
  37 #include "gromacs/simd/simd.h"
  38 #include "gromacs/simd/simd_math.h"
  39 #include "gromacs/simd/vector_operations.h"
  40 #ifdef CALC_COUL_EWALD
  41 #include "gromacs/math/utilities.h"
  42 #endif
  43
  44 #ifndef GMX_SIMD_J_UNROLL_SIZE
  45 #error "Need to define GMX_SIMD_J_UNROLL_SIZE before including the 2xnn kernel common header file"
  46 #endif
  47
  48 #define UNROLLI    NBNXN_CPU_CLUSTER_I_SIZE
  49 #define UNROLLJ    (GMX_SIMD_REAL_WIDTH/GMX_SIMD_J_UNROLL_SIZE)
  50
  51 /* The stride of all the atom data arrays is equal to half the SIMD width */
  52 #define STRIDE     UNROLLJ
  53
  54 #include "gromacs/mdlib/nbnxn_kernels/nbnxn_kernel_simd_utils.h"
  55
  56 static gmx_inline void gmx_simdcall
  57 gmx_load_simd_2xnn_interactions(int                  excl,
  58                                 gmx_exclfilter       filter_S0,
  59                                 gmx_exclfilter       filter_S2,
  60                                 gmx_simd_bool_t     *interact_S0,
  61                                 gmx_simd_bool_t     *interact_S2)
  62 {
  63     /* Load integer interaction mask */
  64     gmx_exclfilter mask_pr_S = gmx_load1_exclfilter(excl);
  65     *interact_S0  = gmx_checkbitmask_pb(mask_pr_S, filter_S0);
  66     *interact_S2  = gmx_checkbitmask_pb(mask_pr_S, filter_S2);
  67 }
  68
  69 /* All functionality defines are set here, except for:
  70  * CALC_ENERGIES, ENERGY_GROUPS which are defined before.
  71  * CHECK_EXCLS, which is set just before including the inner loop contents.
  72  * The combination rule defines, LJ_COMB_GEOM or LJ_COMB_LB are currently
  73  * set before calling the kernel function. We might want to move that
  74  * to inside the n-loop and have a different combination rule for different
  75  * ci's, as no combination rule gives a 50% performance hit for LJ.
  76  */
  77
  78 /* We always calculate shift forces, because it's cheap anyhow */
  79 #define CALC_SHIFTFORCES
  80
  81 /* Assumes all LJ parameters are identical */
  82 /* #define FIX_LJ_C */