src/gromacs/listed-forces/pairs.h

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 2014, by the GROMACS development team, led by
   5  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   6  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   7  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
   8  *
   9  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  10  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  11  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  12  * of the License, or (at your option) any later version.
  13  *
  14  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  15  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  16  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  17  * Lesser General Public License for more details.
  18  *
  19  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  20  * License along with GROMACS; if not, see
  21  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  22  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  23  *
  24  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  25  * consider that scientific software is very special. Version
  26  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  27  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  28  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  29  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  30  * official version at http://www.gromacs.org.
  31  *
  32  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  33  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  34  */
  35 /*! \internal \file
  36  *
  37  * \brief This file declares functions for "pair" interactions
  38  * (i.e. listed non-bonded interactions, e.g. 1-4 interactions)
  39  *
  40  * \author Mark Abraham <mark.j.abraham@gmail.com>
  41  *
  42  * \ingroup module_listed-forces
  43  */
  44 #ifndef GMX_LISTED_FORCES_PAIRS_H
  45 #define GMX_LISTED_FORCES_PAIRS_H
  46
  47 #include "gromacs/legacyheaders/types/forcerec.h"
  48 #include "gromacs/legacyheaders/types/mdatom.h"
  49 #include "gromacs/math/vec.h"
  50 #include "gromacs/utility/basedefinitions.h"
  51 #include "gromacs/utility/real.h"
  52
  53 struct t_graph;
  54 struct t_pbc;
  55
  56 /*! \brief Calculate VdW/charge listed pair interactions (usually 1-4
  57  * interactions).
  58  *
  59  * global_atom_index is only passed for printing error messages.
  60  */
  61 real
  62 do_pairs(int ftype, int nbonds, const t_iatom iatoms[], const t_iparams iparams[],
  63          const rvec x[], rvec f[], rvec fshift[],
  64          const struct t_pbc *pbc, const struct t_graph *g,
  65          real *lambda, real *dvdl, const t_mdatoms *md, const t_forcerec *fr,
  66          gmx_grppairener_t *grppener, int *global_atom_index);
  67
  68 #endif