src/gromacs/gmxpreprocess/tests/solvate.cpp

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 2013,2014, by the GROMACS development team, led by
   5  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   6  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   7  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
   8  *
   9  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  10  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  11  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  12  * of the License, or (at your option) any later version.
  13  *
  14  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  15  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  16  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  17  * Lesser General Public License for more details.
  18  *
  19  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  20  * License along with GROMACS; if not, see
  21  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  22  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  23  *
  24  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  25  * consider that scientific software is very special. Version
  26  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  27  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  28  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  29  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  30  * official version at http://www.gromacs.org.
  31  *
  32  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  33  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  34  */
  35 /*! \internal \file
  36  * \brief
  37  * Tests for solvation.
  38  *
  39  * \author Mark Abraham <mark.j.abraham@gmail.com>
  40  */
  41
  42 #include "gmxpre.h"
  43
  44 #include "gromacs/gmxpreprocess/solvate.h"
  45
  46 #include "gromacs/utility/futil.h"
  47
  48 #include "testutils/cmdlinetest.h"
  49 #include "testutils/integrationtests.h"
  50
  51 namespace
  52 {
  53
  54 //! Helper typedef
  55 typedef int (*CMainFunction)(int argc, char *argv[]);
  56
  57 //! Test fixture for gmx solvate
  58 class SolvateTest : public gmx::test::IntegrationTestFixture
  59 {
  60     public:
  61         //! Constructor
  62         SolvateTest()
  63             : cpFileName(fileManager_.getInputFilePath("spc-and-methanol.gro")),
  64               topFileName(fileManager_.getInputFilePath("spc-and-methanol.top")),
  65               outputFileName(fileManager_.getTemporaryFilePath("out.gro")),
  66               theFunction(gmx_solvate)
  67         {
  68             caller.append("solvate");
  69             caller.addOption("-o", outputFileName);
  70         }
  71
  72     public:
  73         //! Name of file to use for -cp
  74         std::string            cpFileName;
  75         //! Name of input file to use for -p (if used)
  76         std::string            topFileName;
  77         //! Name of output file to use for -o
  78         std::string            outputFileName;
  79         //! Helper object for managing the call to gmx_solvate
  80         gmx::test::CommandLine caller;
  81         //! Points to the function to be tested
  82         CMainFunction          theFunction;
  83 };
  84
  85 TEST_F(SolvateTest, cs_box_Works)
  86 {
  87     caller.append("-cs"); // use default solvent box
  88     caller.addOption("-box", "1.1");
  89
  90     ASSERT_EQ(0, theFunction(caller.argc(), caller.argv()));
  91 }
  92
  93 TEST_F(SolvateTest, cs_cp_Works)
  94 {
  95     caller.append("-cs"); // use default solvent box
  96     caller.addOption("-cp", cpFileName);
  97
  98     ASSERT_EQ(0, theFunction(caller.argc(), caller.argv()));
  99 }
 100
 101 TEST_F(SolvateTest, cs_cp_p_Works)
 102 {
 103     caller.append("-cs"); // use default solvent box
 104     caller.addOption("-cp", cpFileName);
 105
 106     std::string modifiableTopFileName = fileManager_.getTemporaryFilePath(".top");
 107     gmx_file_copy(topFileName.c_str(), modifiableTopFileName.c_str(), true);
 108     caller.addOption("-p", modifiableTopFileName);
 109
 110     ASSERT_EQ(0, theFunction(caller.argc(), caller.argv()));
 111 }
 112
 113 } // namespace