Sort all includes in src/gromacs
[alexxy/gromacs.git] / src / gromacs / gmxpreprocess / tests / insert-molecules.cpp
1 /*
2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
3  *
4  * Copyright (c) 2013,2014, by the GROMACS development team, led by
5  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
6  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
7  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
8  *
9  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
10  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
11  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
12  * of the License, or (at your option) any later version.
13  *
14  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
15  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
16  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
17  * Lesser General Public License for more details.
18  *
19  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
20  * License along with GROMACS; if not, see
21  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
22  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
23  *
24  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
25  * consider that scientific software is very special. Version
26  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
27  * consider code for inclusion in the official distribution, but
28  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
29  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
30  * official version at http://www.gromacs.org.
31  *
32  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
33  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
34  */
35 /*! \internal \file
36  * \brief
37  * Tests for insertion of molecules.
38  *
39  * \author Mark Abraham <mark.j.abraham@gmail.com>
40  */
41
42 #include "gmxpre.h"
43
44 #include "gromacs/gmxpreprocess/insert-molecules.h"
45
46 #include "gromacs/utility/futil.h"
47
48 #include "testutils/cmdlinetest.h"
49 #include "testutils/integrationtests.h"
50
51 namespace
52 {
53
54 //! Helper typedef
55 typedef int (*CMainFunction)(int argc, char *argv[]);
56
57 //! Test fixture for insert-molecules
58 class InsertMoleculesTest : public gmx::test::IntegrationTestFixture
59 {
60     public:
61         //! Constructor
62         InsertMoleculesTest()
63             : ciFileName(fileManager_.getInputFilePath("x.gro")),
64               outputFileName(fileManager_.getTemporaryFilePath("out.gro")),
65               theFunction(gmx_insert_molecules)
66         {
67             caller.append("insert-molecules");
68             caller.addOption("-o", outputFileName);
69         }
70
71     public:
72         //! Name of file to use for -ci
73         std::string            ciFileName;
74         //! Name of output file to use for -o
75         std::string            outputFileName;
76         //! Helper object for managing the call to gmx_insert_molecules
77         gmx::test::CommandLine caller;
78         //! Points to the function to be tested
79         CMainFunction          theFunction;
80 };
81
82 TEST_F(InsertMoleculesTest, f_ci_Works)
83 {
84     caller.addOption("-f", fileManager_.getInputFilePath("spc-and-methanol.gro"));
85     caller.addOption("-nmol", "1");
86     caller.addOption("-ci", ciFileName);
87
88     ASSERT_EQ(0, theFunction(caller.argc(), caller.argv()));
89 }
90
91 TEST_F(InsertMoleculesTest, box_ci_Works)
92 {
93     caller.addOption("-box", "4");
94     caller.addOption("-nmol", "5");
95     caller.addOption("-ci", ciFileName);
96
97     ASSERT_EQ(0, theFunction(caller.argc(), caller.argv()));
98 }
99
100 TEST_F(InsertMoleculesTest, f_box_ci_Works)
101 {
102     caller.addOption("-f", fileManager_.getInputFilePath("spc-and-methanol.gro"));
103     caller.addOption("-box", "4");
104     caller.addOption("-nmol", "2");
105     caller.addOption("-ci", ciFileName);
106
107     ASSERT_EQ(0, theFunction(caller.argc(), caller.argv()));
108 }
109
110 // TODO Someone who knows what -ip is good for should write something
111 // to test it
112
113 } // namespace