src/gromacs/commandline/cmdlinehelpmodule.cpp

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 2012,2013,2014, by the GROMACS development team, led by
   5  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   6  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   7  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
   8  *
   9  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  10  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  11  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  12  * of the License, or (at your option) any later version.
  13  *
  14  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  15  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  16  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  17  * Lesser General Public License for more details.
  18  *
  19  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  20  * License along with GROMACS; if not, see
  21  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  22  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  23  *
  24  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  25  * consider that scientific software is very special. Version
  26  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  27  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  28  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  29  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  30  * official version at http://www.gromacs.org.
  31  *
  32  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  33  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  34  */
  35 /*! \internal \file
  36  * \brief
  37  * Implements gmx::CommandLineHelpModule.
  38  *
  39  * \author Teemu Murtola <teemu.murtola@gmail.com>
  40  * \ingroup module_commandline
  41  */
  42 #include "gmxpre.h"
  43
  44 #include "cmdlinehelpmodule.h"
  45
  46 #include <string>
  47 #include <vector>
  48
  49 #include <boost/scoped_ptr.hpp>
  50
  51 #include "gromacs/commandline/cmdlinehelpcontext.h"
  52 #include "gromacs/commandline/cmdlinehelpwriter.h"
  53 #include "gromacs/commandline/cmdlineparser.h"
  54 #include "gromacs/onlinehelp/helpformat.h"
  55 #include "gromacs/onlinehelp/helpmanager.h"
  56 #include "gromacs/onlinehelp/helptopic.h"
  57 #include "gromacs/onlinehelp/helpwritercontext.h"
  58 #include "gromacs/options/basicoptions.h"
  59 #include "gromacs/options/options.h"
  60 #include "gromacs/utility/baseversion.h"
  61 #include "gromacs/utility/exceptions.h"
  62 #include "gromacs/utility/file.h"
  63 #include "gromacs/utility/gmxassert.h"
  64 #include "gromacs/utility/programcontext.h"
  65 #include "gromacs/utility/stringutil.h"
  66
  67 #include "shellcompletions.h"
  68
  69 namespace gmx
  70 {
  71
  72 namespace
  73 {
  74 class HelpExportInterface;
  75 class RootHelpTopic;
  76 }   // namespace
  77
  78 /********************************************************************
  79  * CommandLineHelpModuleImpl declaration
  80  */
  81
  82 class CommandLineHelpModuleImpl
  83 {
  84     public:
  85         CommandLineHelpModuleImpl(const ProgramContextInterface    &programContext,
  86                                   const std::string                &binaryName,
  87                                   const CommandLineModuleMap       &modules,
  88                                   const CommandLineModuleGroupList &groups);
  89
  90         void exportHelp(HelpExportInterface *exporter) const;
  91
  92         boost::scoped_ptr<RootHelpTopic>  rootTopic_;
  93         const ProgramContextInterface    &programContext_;
  94         std::string                       binaryName_;
  95         const CommandLineModuleMap       &modules_;
  96         const CommandLineModuleGroupList &groups_;
  97
  98         CommandLineHelpContext           *context_;
  99         const CommandLineModuleInterface *moduleOverride_;
 100         bool                              bHidden_;
 101
 102         File                             *outputOverride_;
 103
 104         GMX_DISALLOW_COPY_AND_ASSIGN(CommandLineHelpModuleImpl);
 105 };
 106
 107 namespace
 108 {
 109
 110 /********************************************************************
 111  * RootHelpTopic
 112  */
 113
 114 struct RootHelpText
 115 {
 116     static const char        name[];
 117     static const char        title[];
 118     static const char *const text[];
 119 };
 120
 121 // The first two are not used.
 122 const char        RootHelpText::name[]  = "";
 123 const char        RootHelpText::title[] = "";
 124 const char *const RootHelpText::text[]  = { "" };
 125
 126 /*! \brief
 127  * Help topic that forms the root of the help tree for the help subcommand.
 128  *
 129  * \ingroup module_commandline
 130  */
 131 class RootHelpTopic : public CompositeHelpTopic<RootHelpText>
 132 {
 133     public:
 134         /*! \brief
 135          * Creates a root help topic.
 136          *
 137          * Does not throw.
 138          */
 139         explicit RootHelpTopic(const CommandLineHelpModuleImpl &helpModule)
 140             : helpModule_(helpModule)
 141         {
 142         }
 143
 144         virtual void writeHelp(const HelpWriterContext &context) const;
 145
 146     private:
 147         const CommandLineHelpModuleImpl  &helpModule_;
 148
 149         GMX_DISALLOW_COPY_AND_ASSIGN(RootHelpTopic);
 150 };
 151
 152 void RootHelpTopic::writeHelp(const HelpWriterContext &context) const
 153 {
 154     if (context.outputFormat() != eHelpOutputFormat_Console)
 155     {
 156         // TODO: Implement once the situation with Redmine issue #969 is more
 157         // clear.
 158         GMX_THROW(NotImplementedError(
 159                           "Root help is not implemented for this output format"));
 160     }
 161     {
 162         CommandLineCommonOptionsHolder optionsHolder;
 163         CommandLineHelpContext         cmdlineContext(*helpModule_.context_);
 164         cmdlineContext.setModuleDisplayName(helpModule_.binaryName_);
 165         optionsHolder.initOptions();
 166         // TODO: Add <command> [<args>] into the synopsis.
 167         CommandLineHelpWriter(*optionsHolder.options())
 168             .writeHelp(cmdlineContext);
 169     }
 170     // TODO: Consider printing a list of "core" commands. Would require someone
 171     // to determine such a set...
 172     writeSubTopicList(context,
 173                       "Additional help is available on the following topics:");
 174     context.writeTextBlock(
 175             "To access the help, use '[PROGRAM] help <topic>'.[BR]"
 176             "For help on a command, use '[PROGRAM] help <command>'.");
 177 }
 178
 179 /********************************************************************
 180  * CommandsHelpTopic
 181  */
 182
 183 /*! \brief
 184  * Help topic for listing the commands.
 185  *
 186  * \ingroup module_commandline
 187  */
 188 class CommandsHelpTopic : public HelpTopicInterface
 189 {
 190     public:
 191         /*! \brief
 192          * Creates a command list help topic.
 193          *
 194          * \param[in]     helpModule Help module to get module information from.
 195          *
 196          * Does not throw.
 197          */
 198         explicit CommandsHelpTopic(const CommandLineHelpModuleImpl &helpModule)
 199             : helpModule_(helpModule)
 200         {
 201         }
 202
 203         virtual const char *name() const { return "commands"; }
 204         virtual const char *title() const { return "List of available commands"; }
 205         virtual bool hasSubTopics() const { return false; }
 206         virtual const HelpTopicInterface *findSubTopic(const char * /*name*/) const
 207         {
 208             return NULL;
 209         }
 210
 211         virtual void writeHelp(const HelpWriterContext &context) const;
 212
 213     private:
 214         const CommandLineHelpModuleImpl &helpModule_;
 215
 216         GMX_DISALLOW_COPY_AND_ASSIGN(CommandsHelpTopic);
 217 };
 218
 219 void CommandsHelpTopic::writeHelp(const HelpWriterContext &context) const
 220 {
 221     if (context.outputFormat() != eHelpOutputFormat_Console)
 222     {
 223         GMX_THROW(NotImplementedError(
 224                           "Module list is not implemented for this output format"));
 225     }
 226     int maxNameLength = 0;
 227     const CommandLineModuleMap           &modules = helpModule_.modules_;
 228     CommandLineModuleMap::const_iterator  module;
 229     for (module = modules.begin(); module != modules.end(); ++module)
 230     {
 231         int nameLength = static_cast<int>(module->first.length());
 232         if (module->second->shortDescription() != NULL
 233             && nameLength > maxNameLength)
 234         {
 235             maxNameLength = nameLength;
 236         }
 237     }
 238     context.writeTextBlock(
 239             "Usage: [PROGRAM] [<options>] <command> [<args>][PAR]"
 240             "Available commands:");
 241     File              &file = context.outputFile();
 242     TextTableFormatter formatter;
 243     formatter.addColumn(NULL, maxNameLength + 1, false);
 244     formatter.addColumn(NULL, 72 - maxNameLength, true);
 245     formatter.setFirstColumnIndent(4);
 246     for (module = modules.begin(); module != modules.end(); ++module)
 247     {
 248         const char *name        = module->first.c_str();
 249         const char *description = module->second->shortDescription();
 250         if (description != NULL)
 251         {
 252             formatter.clear();
 253             formatter.addColumnLine(0, name);
 254             formatter.addColumnLine(1, description);
 255             file.writeString(formatter.formatRow());
 256         }
 257     }
 258     context.writeTextBlock(
 259             "For help on a command, use '[PROGRAM] help <command>'.");
 260 }
 261
 262 /********************************************************************
 263  * ModuleHelpTopic
 264  */
 265
 266 /*! \brief
 267  * Help topic wrapper for a command-line module.
 268  *
 269  * This class implements HelpTopicInterface such that it wraps a
 270  * CommandLineModuleInterface, allowing subcommand "help <command>"
 271  * to produce the help for "<command>".
 272  *
 273  * \ingroup module_commandline
 274  */
 275 class ModuleHelpTopic : public HelpTopicInterface
 276 {
 277     public:
 278         //! Constructs a help topic for a specific module.
 279         ModuleHelpTopic(const CommandLineModuleInterface &module,
 280                         const CommandLineHelpModuleImpl  &helpModule)
 281             : module_(module), helpModule_(helpModule)
 282         {
 283         }
 284
 285         virtual const char *name() const { return module_.name(); }
 286         virtual const char *title() const { return NULL; }
 287         virtual bool hasSubTopics() const { return false; }
 288         virtual const HelpTopicInterface *findSubTopic(const char * /*name*/) const
 289         {
 290             return NULL;
 291         }
 292         virtual void writeHelp(const HelpWriterContext &context) const;
 293
 294     private:
 295         const CommandLineModuleInterface &module_;
 296         const CommandLineHelpModuleImpl  &helpModule_;
 297
 298         GMX_DISALLOW_COPY_AND_ASSIGN(ModuleHelpTopic);
 299 };
 300
 301 void ModuleHelpTopic::writeHelp(const HelpWriterContext & /*context*/) const
 302 {
 303     CommandLineHelpContext context(*helpModule_.context_);
 304     const char *const      program = helpModule_.binaryName_.c_str();
 305     context.setModuleDisplayName(formatString("%s %s", program, module_.name()));
 306     module_.writeHelp(context);
 307 }
 308
 309 /********************************************************************
 310  * HelpExportInterface
 311  */
 312
 313 /*! \brief
 314  * Callbacks for exporting help information for command-line modules.
 315  *
 316  * \ingroup module_commandline
 317  */
 318 class HelpExportInterface
 319 {
 320     public:
 321         //! Shorthand for a list of modules contained in a group.
 322         typedef CommandLineModuleGroupData::ModuleList ModuleGroupContents;
 323
 324         virtual ~HelpExportInterface() {};
 325
 326         /*! \brief
 327          * Called once before exporting individual modules.
 328          *
 329          * Can, e.g., open shared output files (e.g., if the output is written
 330          * into a single file, or if a separate index is required) and write
 331          * headers into them.
 332          */
 333         virtual void startModuleExport() = 0;
 334         /*! \brief
 335          * Called to export the help for each module.
 336          *
 337          * \param[in] module      Module for which the help should be exported.
 338          * \param[in] tag         Unique tag for the module (gmx-something).
 339          * \param[in] displayName Display name for the module (gmx something).
 340          */
 341         virtual void exportModuleHelp(
 342             const CommandLineModuleInterface &module,
 343             const std::string                &tag,
 344             const std::string                &displayName) = 0;
 345         /*! \brief
 346          * Called after all modules have been exported.
 347          *
 348          * Can close files opened in startModuleExport(), write footers to them
 349          * etc.
 350          */
 351         virtual void finishModuleExport() = 0;
 352
 353         /*! \brief
 354          * Called once before exporting module groups.
 355          *
 356          * Can, e.g., open a single output file for listing all the groups.
 357          */
 358         virtual void startModuleGroupExport() = 0;
 359         /*! \brief
 360          * Called to export the help for each module group.
 361          *
 362          * \param[in] title    Title for the group.
 363          * \param[in] modules  List of modules in the group.
 364          */
 365         virtual void exportModuleGroup(const char                *title,
 366                                        const ModuleGroupContents &modules) = 0;
 367         /*! \brief
 368          * Called after all module groups have been exported.
 369          *
 370          * Can close files opened in startModuleGroupExport(), write footers to them
 371          * etc.
 372          */
 373         virtual void finishModuleGroupExport() = 0;
 374 };
 375
 376 /*! \internal \brief
 377  * Adds hyperlinks to modules within this binary.
 378  *
 379  * \param[in,out] links      Links are added here.
 380  * \param[in]     helpModule Help module to get module information from.
 381  * \throws        std::bad_alloc if out of memory.
 382  *
 383  * Initializes a HelpLinks object with links to modules defined in
 384  * \p helpModule.
 385  *
 386  * \ingroup module_commandline
 387  */
 388 void initProgramLinks(HelpLinks *links, const CommandLineHelpModuleImpl &helpModule)
 389 {
 390     const char *const                    program = helpModule.binaryName_.c_str();
 391     CommandLineModuleMap::const_iterator module;
 392     for (module = helpModule.modules_.begin();
 393          module != helpModule.modules_.end();
 394          ++module)
 395     {
 396         if (module->second->shortDescription() != NULL)
 397         {
 398             std::string linkName("[gmx-" + module->first + "]");
 399             std::string targetName(
 400                     formatString("%s-%s", program, module->first.c_str()));
 401             std::string displayName(
 402                     formatString("[TT]%s %s[tt]", program, module->first.c_str()));
 403             links->addLink(linkName, targetName, displayName);
 404         }
 405     }
 406 }
 407
 408 /********************************************************************
 409  * HelpExportMan
 410  */
 411
 412 /*! \internal \brief
 413  * Implements export for man pages.
 414  *
 415  * \ingroup module_commandline
 416  */
 417 class HelpExportMan : public HelpExportInterface
 418 {
 419     public:
 420         //! Initializes man page exporter.
 421         explicit HelpExportMan(const CommandLineHelpModuleImpl &helpModule)
 422             : links_(eHelpOutputFormat_Man)
 423         {
 424             initProgramLinks(&links_, helpModule);
 425         }
 426
 427         virtual void startModuleExport() {}
 428         virtual void exportModuleHelp(
 429             const CommandLineModuleInterface &module,
 430             const std::string                &tag,
 431             const std::string                &displayName);
 432         virtual void finishModuleExport() {}
 433
 434         virtual void startModuleGroupExport();
 435         virtual void exportModuleGroup(const char                *title,
 436                                        const ModuleGroupContents &modules);
 437         virtual void finishModuleGroupExport();
 438
 439     private:
 440         HelpLinks                links_;
 441         boost::scoped_ptr<File>  man7File_;
 442         std::string              man7Footer_;
 443 };
 444
 445 void HelpExportMan::exportModuleHelp(
 446         const CommandLineModuleInterface &module,
 447         const std::string                &tag,
 448         const std::string                &displayName)
 449 {
 450     File file("man1/" + tag + ".1", "w");
 451
 452     // TODO: It would be nice to remove the VERSION prefix from the version
 453     // string to make it shorter.
 454     file.writeLine(formatString(".TH %s 1 \"\" \"%s\" \"GROMACS Manual\"\n",
 455                                 tag.c_str(), gmx_version()));
 456     file.writeLine(".SH NAME");
 457     file.writeLine(formatString("%s - %s", tag.c_str(),
 458                                 module.shortDescription()));
 459     file.writeLine();
 460
 461     CommandLineHelpContext context(&file, eHelpOutputFormat_Man, &links_);
 462     context.setModuleDisplayName(displayName);
 463     module.writeHelp(context);
 464
 465     file.writeLine(".SH SEE ALSO");
 466     file.writeLine(".BR gromacs(7)");
 467     file.writeLine();
 468     file.writeLine("More information about \\fBGROMACS\\fR is available at <\\fIhttp://www.gromacs.org/\\fR>.");
 469 }
 470
 471 void HelpExportMan::startModuleGroupExport()
 472 {
 473     const char *const programListPlaceholder = "@PROGMANPAGES@";
 474
 475     const std::string man7Template = gmx::File::readToString("man7/gromacs.7.in");
 476     const size_t      index        = man7Template.find(programListPlaceholder);
 477     GMX_RELEASE_ASSERT(index != std::string::npos,
 478                        "gromacs.7.in must contain a @PROGMANPAGES@ line");
 479     std::string header = man7Template.substr(0, index);
 480     man7Footer_ = man7Template.substr(index + std::strlen(programListPlaceholder));
 481     header      = replaceAll(header, "@VERSION@", gmx_version());
 482     man7File_.reset(new File("man7/gromacs.7", "w"));
 483     man7File_->writeLine(header);
 484 }
 485
 486 void HelpExportMan::exportModuleGroup(const char                *title,
 487                                       const ModuleGroupContents &modules)
 488 {
 489     man7File_->writeLine(formatString(".Sh \"%s\"", title));
 490     man7File_->writeLine(formatString(".IX Subsection \"%s\"", title));
 491     man7File_->writeLine(".Vb");
 492     man7File_->writeLine(".ta 16n");
 493
 494     ModuleGroupContents::const_iterator module;
 495     for (module = modules.begin(); module != modules.end(); ++module)
 496     {
 497         const std::string &tag(module->first);
 498         man7File_->writeLine(formatString("\\&  %s\t%s",
 499                                           tag.c_str(), module->second));
 500     }
 501
 502     man7File_->writeLine(".Ve");
 503 }
 504
 505 void HelpExportMan::finishModuleGroupExport()
 506 {
 507     man7File_->writeLine(man7Footer_);
 508     man7File_->close();
 509 }
 510
 511 /********************************************************************
 512  * HelpExportHtml
 513  */
 514
 515 /*! \internal \brief
 516  * Implements export for HTML help.
 517  *
 518  * \ingroup module_commandline
 519  */
 520 class HelpExportHtml : public HelpExportInterface
 521 {
 522     public:
 523         //! Initializes HTML exporter.
 524         explicit HelpExportHtml(const CommandLineHelpModuleImpl &helpModule);
 525
 526         virtual void startModuleExport();
 527         virtual void exportModuleHelp(
 528             const CommandLineModuleInterface &module,
 529             const std::string                &tag,
 530             const std::string                &displayName);
 531         virtual void finishModuleExport();
 532
 533         virtual void startModuleGroupExport();
 534         virtual void exportModuleGroup(const char                *title,
 535                                        const ModuleGroupContents &modules);
 536         virtual void finishModuleGroupExport();
 537
 538     private:
 539         void setupHeaderAndFooter();
 540
 541         void writeHtmlHeader(File *file, const std::string &title) const;
 542         void writeHtmlFooter(File *file) const;
 543
 544         HelpLinks                links_;
 545         boost::scoped_ptr<File>  indexFile_;
 546         std::string              header_;
 547         std::string              footer_;
 548 };
 549
 550 HelpExportHtml::HelpExportHtml(const CommandLineHelpModuleImpl &helpModule)
 551     : links_(eHelpOutputFormat_Html)
 552 {
 553     File             linksFile("links.dat", "r");
 554     std::string      line;
 555     while (linksFile.readLine(&line))
 556     {
 557         links_.addLink(line, "../online/" + line, line);
 558     }
 559     linksFile.close();
 560     initProgramLinks(&links_, helpModule);
 561     setupHeaderAndFooter();
 562 }
 563
 564 void HelpExportHtml::setupHeaderAndFooter()
 565 {
 566     header_ = gmx::File::readToString("header.html.in");
 567     header_ = replaceAll(header_, "@VERSION@", gmx_version());
 568     gmx::File::writeFileFromString("header.html", header_);
 569     header_ = replaceAll(header_, "@ROOTPATH@", "../");
 570     footer_ = gmx::File::readToString("footer.html");
 571 }
 572
 573 void HelpExportHtml::startModuleExport()
 574 {
 575     indexFile_.reset(new File("final/programs/byname.html", "w"));
 576     writeHtmlHeader(indexFile_.get(), "GROMACS Programs by Name");
 577     indexFile_->writeLine("<H3>GROMACS Programs Alphabetically</H3>");
 578 }
 579
 580 void HelpExportHtml::exportModuleHelp(
 581         const CommandLineModuleInterface &module,
 582         const std::string                &tag,
 583         const std::string                &displayName)
 584 {
 585     File file("final/programs/" + tag + ".html", "w");
 586     writeHtmlHeader(&file, displayName);
 587
 588     CommandLineHelpContext context(&file, eHelpOutputFormat_Html, &links_);
 589     context.setModuleDisplayName(displayName);
 590     module.writeHelp(context);
 591
 592     writeHtmlFooter(&file);
 593     file.close();
 594
 595     indexFile_->writeLine(formatString("<a href=\"%s.html\">%s</a> - %s<br>",
 596                                        tag.c_str(), displayName.c_str(),
 597                                        module.shortDescription()));
 598 }
 599
 600 void HelpExportHtml::finishModuleExport()
 601 {
 602     writeHtmlFooter(indexFile_.get());
 603     indexFile_->close();
 604 }
 605
 606 void HelpExportHtml::startModuleGroupExport()
 607 {
 608     indexFile_.reset(new File("final/programs/bytopic.html", "w"));
 609     writeHtmlHeader(indexFile_.get(), "GROMACS Programs by Topic");
 610     indexFile_->writeLine("<H3>GROMACS Programs by Topic</H3>");
 611 }
 612
 613 void HelpExportHtml::exportModuleGroup(const char                *title,
 614                                        const ModuleGroupContents &modules)
 615 {
 616     indexFile_->writeLine(formatString("<H4>%s</H4>", title));
 617
 618     ModuleGroupContents::const_iterator module;
 619     for (module = modules.begin(); module != modules.end(); ++module)
 620     {
 621         const std::string     &tag(module->first);
 622         std::string            displayName(tag);
 623         // TODO: This does not work if the binary name would contain a dash,
 624         // but that is not currently the case.
 625         size_t                 dashPos = displayName.find('-');
 626         GMX_RELEASE_ASSERT(dashPos != std::string::npos,
 627                            "There should always be at least one dash in the tag");
 628         displayName[dashPos] = ' ';
 629         indexFile_->writeLine(formatString("<a href=\"%s.html\">%s</a> - %s<br>",
 630                                            tag.c_str(), displayName.c_str(),
 631                                            module->second));
 632     }
 633 }
 634
 635 void HelpExportHtml::finishModuleGroupExport()
 636 {
 637     writeHtmlFooter(indexFile_.get());
 638     indexFile_->close();
 639 }
 640
 641 void HelpExportHtml::writeHtmlHeader(File *file, const std::string &title) const
 642 {
 643     file->writeLine(replaceAll(header_, "@TITLE@", title));
 644 }
 645
 646 void HelpExportHtml::writeHtmlFooter(File *file) const
 647 {
 648     file->writeLine(footer_);
 649 }
 650
 651 /********************************************************************
 652  * HelpExportCompletion
 653  */
 654
 655 /*! \internal \brief
 656  * Implements export for command-line completion.
 657  *
 658  * \ingroup module_commandline
 659  */
 660 class HelpExportCompletion : public HelpExportInterface
 661 {
 662     public:
 663         //! Initializes completion exporter.
 664         explicit HelpExportCompletion(const CommandLineHelpModuleImpl &helpModule);
 665
 666         virtual void startModuleExport();
 667         virtual void exportModuleHelp(
 668             const CommandLineModuleInterface &module,
 669             const std::string                &tag,
 670             const std::string                &displayName);
 671         virtual void finishModuleExport();
 672
 673         virtual void startModuleGroupExport() {}
 674         virtual void exportModuleGroup(const char                * /*title*/,
 675                                        const ModuleGroupContents & /*modules*/) {}
 676         virtual void finishModuleGroupExport() {}
 677
 678     private:
 679         ShellCompletionWriter    bashWriter_;
 680         std::vector<std::string> modules_;
 681 };
 682
 683 HelpExportCompletion::HelpExportCompletion(
 684         const CommandLineHelpModuleImpl &helpModule)
 685     : bashWriter_(helpModule.binaryName_, eShellCompletionFormat_Bash)
 686 {
 687 }
 688
 689 void HelpExportCompletion::startModuleExport()
 690 {
 691     bashWriter_.startCompletions();
 692 }
 693
 694 void HelpExportCompletion::exportModuleHelp(
 695         const CommandLineModuleInterface &module,
 696         const std::string                 & /*tag*/,
 697         const std::string                 & /*displayName*/)
 698 {
 699     modules_.push_back(module.name());
 700     {
 701         CommandLineHelpContext context(&bashWriter_);
 702         // We use the display name to pass the name of the module to the
 703         // completion writer.
 704         context.setModuleDisplayName(module.name());
 705         module.writeHelp(context);
 706     }
 707 }
 708
 709 void HelpExportCompletion::finishModuleExport()
 710 {
 711     CommandLineCommonOptionsHolder optionsHolder;
 712     optionsHolder.initOptions();
 713     bashWriter_.writeWrapperCompletions(modules_, *optionsHolder.options());
 714     bashWriter_.finishCompletions();
 715 }
 716
 717 }   // namespace
 718
 719 /********************************************************************
 720  * CommandLineHelpModuleImpl implementation
 721  */
 722 CommandLineHelpModuleImpl::CommandLineHelpModuleImpl(
 723         const ProgramContextInterface    &programContext,
 724         const std::string                &binaryName,
 725         const CommandLineModuleMap       &modules,
 726         const CommandLineModuleGroupList &groups)
 727     : rootTopic_(new RootHelpTopic(*this)), programContext_(programContext),
 728       binaryName_(binaryName), modules_(modules), groups_(groups),
 729       context_(NULL), moduleOverride_(NULL), bHidden_(false),
 730       outputOverride_(NULL)
 731 {
 732 }
 733
 734 void CommandLineHelpModuleImpl::exportHelp(HelpExportInterface *exporter) const
 735 {
 736     // TODO: Would be nicer to have the file names supplied by the build system
 737     // and/or export a list of files from here.
 738     const char *const program = binaryName_.c_str();
 739
 740     exporter->startModuleExport();
 741     CommandLineModuleMap::const_iterator module;
 742     for (module = modules_.begin(); module != modules_.end(); ++module)
 743     {
 744         if (module->second->shortDescription() != NULL)
 745         {
 746             const char *const moduleName = module->first.c_str();
 747             std::string       tag(formatString("%s-%s", program, moduleName));
 748             std::string       displayName(formatString("%s %s", program, moduleName));
 749             exporter->exportModuleHelp(*module->second, tag, displayName);
 750         }
 751     }
 752     exporter->finishModuleExport();
 753
 754     exporter->startModuleGroupExport();
 755     CommandLineModuleGroupList::const_iterator group;
 756     for (group = groups_.begin(); group != groups_.end(); ++group)
 757     {
 758         exporter->exportModuleGroup((*group)->title(), (*group)->modules());
 759     }
 760     exporter->finishModuleGroupExport();
 761 }
 762
 763 /********************************************************************
 764  * CommandLineHelpModule
 765  */
 766
 767 CommandLineHelpModule::CommandLineHelpModule(
 768         const ProgramContextInterface    &programContext,
 769         const std::string                &binaryName,
 770         const CommandLineModuleMap       &modules,
 771         const CommandLineModuleGroupList &groups)
 772     : impl_(new Impl(programContext, binaryName, modules, groups))
 773 {
 774 }
 775
 776 CommandLineHelpModule::~CommandLineHelpModule()
 777 {
 778 }
 779
 780 HelpTopicPointer CommandLineHelpModule::createModuleHelpTopic(
 781         const CommandLineModuleInterface &module) const
 782 {
 783     return HelpTopicPointer(new ModuleHelpTopic(module, *impl_));
 784 }
 785
 786 void CommandLineHelpModule::addTopic(HelpTopicPointer topic)
 787 {
 788     impl_->rootTopic_->addSubTopic(move(topic));
 789 }
 790
 791 void CommandLineHelpModule::setShowHidden(bool bHidden)
 792 {
 793     impl_->bHidden_ = bHidden;
 794 }
 795
 796 void CommandLineHelpModule::setModuleOverride(
 797         const CommandLineModuleInterface &module)
 798 {
 799     impl_->moduleOverride_ = &module;
 800 }
 801
 802 void CommandLineHelpModule::setOutputRedirect(File *output)
 803 {
 804     impl_->outputOverride_ = output;
 805 }
 806
 807 int CommandLineHelpModule::run(int argc, char *argv[])
 808 {
 809     // Add internal topics lazily here.
 810     addTopic(HelpTopicPointer(new CommandsHelpTopic(*impl_)));
 811
 812     const char *const exportFormats[] = { "man", "html", "completion" };
 813     std::string       exportFormat;
 814     Options           options(NULL, NULL);
 815     options.addOption(StringOption("export").store(&exportFormat)
 816                           .enumValue(exportFormats));
 817     CommandLineParser(&options).parse(&argc, argv);
 818     if (!exportFormat.empty())
 819     {
 820         boost::scoped_ptr<HelpExportInterface> exporter;
 821         if (exportFormat == "man")
 822         {
 823             exporter.reset(new HelpExportMan(*impl_));
 824         }
 825         else if (exportFormat == "html")
 826         {
 827             exporter.reset(new HelpExportHtml(*impl_));
 828         }
 829         else if (exportFormat == "completion")
 830         {
 831             exporter.reset(new HelpExportCompletion(*impl_));
 832         }
 833         else
 834         {
 835             GMX_THROW(NotImplementedError("This help format is not implemented"));
 836         }
 837         impl_->exportHelp(exporter.get());
 838         return 0;
 839     }
 840
 841     File *outputFile = &File::standardOutput();
 842     if (impl_->outputOverride_ != NULL)
 843     {
 844         outputFile = impl_->outputOverride_;
 845     }
 846     HelpLinks                                 links(eHelpOutputFormat_Console);
 847     initProgramLinks(&links, *impl_);
 848     boost::scoped_ptr<CommandLineHelpContext> context(
 849             new CommandLineHelpContext(outputFile,
 850                                        eHelpOutputFormat_Console, &links));
 851     context->setShowHidden(impl_->bHidden_);
 852     if (impl_->moduleOverride_ != NULL)
 853     {
 854         context->setModuleDisplayName(impl_->programContext_.displayName());
 855         impl_->moduleOverride_->writeHelp(*context);
 856         return 0;
 857     }
 858     impl_->context_ = context.get();
 859
 860     HelpManager helpManager(*impl_->rootTopic_, context->writerContext());
 861     try
 862     {
 863         for (int i = 1; i < argc; ++i)
 864         {
 865             helpManager.enterTopic(argv[i]);
 866         }
 867     }
 868     catch (const InvalidInputError &ex)
 869     {
 870         fprintf(stderr, "%s\n", ex.what());
 871         return 2;
 872     }
 873     helpManager.writeCurrentTopic();
 874     return 0;
 875 }
 876
 877 void CommandLineHelpModule::writeHelp(const CommandLineHelpContext &context) const
 878 {
 879     const HelpWriterContext &writerContext = context.writerContext();
 880     // TODO: Implement.
 881     if (writerContext.outputFormat() != eHelpOutputFormat_Console)
 882     {
 883         return;
 884     }
 885     writerContext.writeTextBlock(
 886             "Usage: [PROGRAM] help [<command>|<topic> [<subtopic> [...]]]");
 887     // TODO: More information.
 888 }
 889
 890 } // namespace gmx