Add initial support for python bindings
[alexxy/gromacs.git] / cmake / gmxBuildTypeTSAN.cmake
1 #
2 # This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
3 #
4 # Copyright (c) 2014, by the GROMACS development team, led by
5 # Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
6 # and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
7 # top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
8 #
9 # GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
10 # modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
11 # as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
12 # of the License, or (at your option) any later version.
13 #
14 # GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
15 # but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
16 # MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
17 # Lesser General Public License for more details.
18 #
19 # You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
20 # License along with GROMACS; if not, see
21 # http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
22 # Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
23 #
24 # If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
25 # consider that scientific software is very special. Version
26 # control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
27 # consider code for inclusion in the official distribution, but
28 # derived work must not be called official GROMACS. Details are found
29 # in the README & COPYING files - if they are missing, get the
30 # official version at http://www.gromacs.org.
31 #
32 # To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
33 # the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
34
35 # Custom build type "TSAN", to be used for compiling GROMACS 
36 # with clang 3.4 or gcc 4.8 (currently pre-release) with ThreadSanitizer
37 # (aka "TSan") turned on, so that the tests can be run to detect data races.
38 #
39 # The main advantage of the clang version is that there can be a
40 # suppressions file that acts at compile time, though there is no use of 
41 # that yet. The main advantage of the gcc version is that it can be used
42 # with a OpenMP (if gomp is compiled with --disable-linux-futex).
43 #
44 # Unfortunately, out of the box Thread-MPI provokes several false
45 # positives. One example is that tMPI_Event_t contains an atomic int
46 # field "sync" that is initialized before thread spawn. During a
47 # collective, this is atomically updated by the source thread, and the
48 # update is observed by sink threads in tMPI_Event_wait, which do a
49 # yield wait when no change has occured. This means the read can
50 # happen before the write (by design, whether or not the read is
51 # atomic), but the surrounding logic prevents action until the write
52 # has happened. There is no way for the sink thread(s) to avoid
53 # reading until the write has happened - that is the point of the
54 # implementation.
55 #
56 # This ought to be able to be suppressed, but my attempts to apply
57 # suppressions on individual functions don't suppress reporting of the
58 # race event. Applying the suppression to the whole thread-MPI library
59 # might work, but seems to defeat the point. We want to be able to
60 # detect mis-use of the primitives provided by thread-MPI.
61 #
62 # This means there needs to be a way for this build type to trigger
63 # the use of the generic mutex-based fallback implementation within
64 # thread-MPI.
65 #
66 # Later, if a blacklist is needed, use something like
67 # "-fsanitize-blacklist=${CMAKE_SOURCE_DIR}/cmake/thread-sanitizer.supp"
68 # TODO find a better home for this and other suppression files
69 set(_flags "-O1 -g -fsanitize=thread")
70
71 foreach(_language C CXX)
72
73     string(REPLACE "X" "+" _human_readable_language ${_language})
74
75     if (CMAKE_${_language}_COMPILER_ID MATCHES "GNU")
76         set(CMAKE_${_language}_FLAGS_TSAN "${_flags} -pie -fPIE" CACHE STRING "${_human_readable_language} flags for thread sanitizer")
77     else()
78         set(CMAKE_${_language}_FLAGS_TSAN ${_flags} CACHE STRING "${_human_readable_language} flags for thread sanitizer")
79     endif()
80     mark_as_advanced(CMAKE_${_language}_FLAGS_TSAN)
81     string(TOUPPER "${CMAKE_BUILD_TYPE}" _cmake_build_type)
82     if (_cmake_build_type STREQUAL TSAN)
83         set(TMPI_ATOMICS_DISABLED 1)
84         set(TMPI_ATOMICS 0)
85         if (NOT((CMAKE_${_language}_COMPILER_ID MATCHES "Clang" AND
86                     CMAKE_${_language}_COMPILER_VERSION VERSION_GREATER 3.2.999)
87              OR (CMAKE_${_language}_COMPILER_ID MATCHES "GNU" AND
88                     CMAKE_${_language}_COMPILER_VERSION VERSION_GREATER 4.7.999)))
89             message(FATAL_ERROR "The ThreadSanitizer build is only available with clang ${_human_readable_language} >=3.3 and gnu ${_human_readable_language} >=4.8.")
90         endif()
91     endif()
92
93 endforeach()