Clean up index handing in make_bondeds_zone
[alexxy/gromacs.git] / src / gromacs / domdec /
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-rw-r--r-- 3119 CMakeLists.txt
-rw-r--r-- 3126 atomdistribution.cpp
-rw-r--r-- 3444 atomdistribution.h
-rw-r--r-- 11803 box.cpp
-rw-r--r-- 3057 box.h
-rw-r--r-- 4440 builder.h
-rw-r--r-- 36078 cellsizes.cpp
-rw-r--r-- 3564 cellsizes.h
-rw-r--r-- 12119 collect.cpp
-rw-r--r-- 2709 collect.h
-rw-r--r-- 12754 computemultibodycutoffs.cpp
-rw-r--r-- 2870 computemultibodycutoffs.h
-rw-r--r-- 21147 distribute.cpp
-rw-r--r-- 2800 distribute.h
-rw-r--r-- 5467 dlb.cpp
-rw-r--r-- 4587 dlb.h
-rw-r--r-- 7916 dlbtiming.cpp
-rw-r--r-- 8335 dlbtiming.h
-rw-r--r-- 122505 domdec.cpp
-rw-r--r-- 12936 domdec.h
-rw-r--r-- 23051 domdec_constraints.cpp
-rw-r--r-- 3136 domdec_constraints.h
-rw-r--r-- 29485 domdec_internal.h
-rw-r--r-- 11691 domdec_network.cpp
-rw-r--r-- 8852 domdec_network.h
-rw-r--r-- 34797 domdec_setup.cpp
-rw-r--r-- 6258 domdec_setup.h
-rw-r--r-- 22988 domdec_specatomcomm.cpp
-rw-r--r-- 5693 domdec_specatomcomm.h
-rw-r--r-- 8810 domdec_struct.h
-rw-r--r-- 6652 domdec_vsite.cpp
-rw-r--r-- 2655 domdec_vsite.h
-rw-r--r-- 7933 dump.cpp
-rw-r--r-- 2684 dump.h
-rw-r--r-- 3202 ga2la.cpp
-rw-r--r-- 5869 ga2la.h
-rw-r--r-- 6051 gpuhaloexchange.h
-rw-r--r-- 4467 gpuhaloexchange_impl.cpp
-rw-r--r-- 23206 gpuhaloexchange_impl.cu
-rw-r--r-- 9849 gpuhaloexchange_impl.cuh
-rw-r--r-- 11528 hashedmap.h
-rw-r--r-- 2505 localatomset.cpp
-rw-r--r-- 4451 localatomset.h
-rw-r--r-- 3553 localatomsetdata.cpp
-rw-r--r-- 5066 localatomsetdata.h
-rw-r--r-- 3348 localatomsetmanager.cpp
-rw-r--r-- 3739 localatomsetmanager.h
-rw-r--r-- 42931 localtopology.cpp
-rw-r--r-- 2964 localtopology.h
-rw-r--r-- 21863 localtopologychecker.cpp
-rw-r--r-- 4609 localtopologychecker.h
-rw-r--r-- 9672 makebondedlinks.cpp
-rw-r--r-- 2529 makebondedlinks.h
-rw-r--r-- 6664 mdsetup.cpp
-rw-r--r-- 4072 mdsetup.h
-rw-r--r-- 6192 nsgrid.cpp
-rw-r--r-- 3501 nsgrid.h
-rw-r--r-- 5182 options.h
-rw-r--r-- 124606 partition.cpp
-rw-r--r-- 5301 partition.h
-rw-r--r-- 37010 redistribute.cpp
-rw-r--r-- 2533 redistribute.h
-rw-r--r-- 17037 reversetopology.cpp
-rw-r--r-- 7907 reversetopology.h
drwxr-xr-x - tests
-rw-r--r-- 3463 utility.cpp
-rw-r--r-- 4965 utility.h