Added note about make_edi and flooding in ED paragraph
authorCarsten Kutzner <ckutzne@gwdg.de>
Thu, 17 Jan 2013 12:39:35 +0000 (13:39 +0100)
committerCarsten Kutzner <ckutzne@gwdg.de>
Thu, 17 Jan 2013 12:39:35 +0000 (13:39 +0100)
Change-Id: I735c75194aeaa76570d211e51665ec89cfc3ef82

src/kernel/mdrun.c

index 5c6a23b9c30e80b7e69335b2b1c633faea93f381..52f65300eda772720bd7f0e52efcabd28dc25e3a 100644 (file)
@@ -243,10 +243,11 @@ int cmain(int argc,char *argv[])
     "forces and energies will be (re)calculated. Neighbor searching will be",
     "performed for every frame, unless [TT]nstlist[tt] is zero",
     "(see the [TT].mdp[tt] file).[PAR]",
-    "ED (essential dynamics) sampling is switched on by using the [TT]-ei[tt]",
-    "flag followed by an [TT].edi[tt] file.",
-    "The [TT].edi[tt] file can be produced using options in the essdyn",
-    "menu of the WHAT IF program. [TT]mdrun[tt] produces a [TT].xvg[tt] output file that",
+    "ED (essential dynamics) sampling and/or additional flooding potentials",
+    "are switched on by using the [TT]-ei[tt] flag followed by an [TT].edi[tt]",
+    "file. The [TT].edi[tt] file can be produced with the [TT]make_edi[tt] tool",
+    "or by using options in the essdyn menu of the WHAT IF program.",
+    "[TT]mdrun[tt] produces a [TT].xvg[tt] output file that",
     "contains projections of positions, velocities and forces onto selected",
     "eigenvectors.[PAR]",
     "When user-defined potential functions have been selected in the",