Removed information about obsolete .edo file format
authorCarsten Kutzner <ckutzne@gwdg.de>
Wed, 15 Jul 2015 13:31:59 +0000 (15:31 +0200)
committerGerrit Code Review <gerrit@gerrit.gromacs.org>
Wed, 15 Jul 2015 19:19:30 +0000 (21:19 +0200)
Essential dynamics output is written to edsam.xvg file since version 4.6

Change-Id: I0daca58fab1ebc953e8799de7e1667c4956b460e

docs/links.dat
docs/user-guide/file-formats.rst

index 01ee831cccefe0f468669db7165cbe30d930ec25..0c34fad9bbdeb7ac4d7d150d9c8d1bdc14436f2e 100644 (file)
@@ -2,7 +2,6 @@ cpt
 dat
 dlg
 edi
-edo
 edr
 ene
 eps
index 14585262ce77afa583707075a0bc36c44a67541b..e85910ab9a70d500bd92906cdc81f9e516e8cca2 100644 (file)
@@ -83,8 +83,6 @@ Other files
     generic, preferred for input
 :ref:`edi`
     essential dynamics constraints input for :ref:`gmx mdrun`
-:ref:`edo`
-    essential dynamics constraints output for :ref:`gmx mdrun`
 :ref:`eps`
     Encapsulated Postscript
 :ref:`log`
@@ -177,20 +175,6 @@ to run Molecular Dynamics with Essential Dynamics constraints.
    output from the programs in the <tt>ESSDYN</tt> menu of the
    <A HREF="http://www.sander.embl-heidelberg.de/whatif/">WHAT IF</A> program.
 
-.. _edo:
-
-edo
----
-
-Files with the edo file extension are generated by :ref:`gmx mdrun`
-if Molecular Dynamics is performed with Essential Dynamics
-constraints. Depending on the parameters set in the :ref:`edi`:
-file, edo files may contain projections of positions,
-velocities and forces onto selected eigenvectors during the run as well
-as RMSD values, or information about specific types of constraints.
-Specific results can be extracted from the edo files with standard Unix
-utilities like ``awk``.
-
 .. _edr:
 
 edr