src/programs/view/manager.h

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 1991-2000, University of Groningen, The Netherlands.
   5  * Copyright (c) 2001-2004, The GROMACS development team.
   6  * Copyright (c) 2013,2014, by the GROMACS development team, led by
   7  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   8  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   9  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
  10  *
  11  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  12  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  13  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  14  * of the License, or (at your option) any later version.
  15  *
  16  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  17  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  18  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  19  * Lesser General Public License for more details.
  20  *
  21  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  22  * License along with GROMACS; if not, see
  23  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  24  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  25  *
  26  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  27  * consider that scientific software is very special. Version
  28  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  29  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  30  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  31  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  32  * official version at http://www.gromacs.org.
  33  *
  34  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  35  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  36  */
  37
  38 #ifndef _manager_h
  39 #define _manager_h
  40
  41 #include <stdio.h>
  42
  43 #include "gromacs/fileio/trxio.h"
  44 #include "gromacs/legacyheaders/typedefs.h"
  45 #include "gromacs/pbcutil/rmpbc.h"
  46
  47 #include "3dview.h"
  48 #include "buttons.h"
  49 #include "nleg.h"
  50 #include "x11.h"
  51 #include "xutil.h"
  52
  53 /* Some window sizes */
  54 #define EWIDTH      200
  55 #define EHEIGHT       0
  56 #define LDHEIGHT      0
  57 #define LEGHEIGHT    60
  58
  59 enum eObject {
  60     eOSingle, eOBond, eOHBond, eONR
  61 };
  62
  63 enum eVisible {
  64     eVNormal, eVSpecial, eVHidden, evNR
  65 };
  66
  67 enum eBwidth {
  68     eBThin, eBFat, eBVeryFat, eBSpheres, eBNR
  69 };
  70
  71 enum esBox {
  72     esbNone, esbRect, esbTri, esbTrunc, esbNR
  73 };
  74
  75 typedef struct {
  76     t_windata     wd;            /* Mol window structure                        */
  77     bool          bShowHydrogen; /* Show Hydrogens?                     */
  78     int           bond_type;     /* Show one of the above bondtypes      */
  79     int           ePBC;          /* PBC type                             */
  80     int           boxtype;       /* Rectangular, Tric, TruncOct (display)*/
  81     int           realbox;       /* Property of the real box             */
  82 } t_molwin;
  83
  84 typedef struct {
  85     eObject           eO;     /* The type of object                     */
  86     eVisible          eV;     /* Visibility status of the object        */
  87     unsigned long     color;  /* The color (only when eV==evSpecial)    */
  88     atom_id           ai, aj; /* The atom_id for i (and j if bond)      */
  89     real              z;      /* The Z-coordinate for depht cueing      */
  90 } t_object;
  91
  92 typedef struct {
  93     t_blocka    *grps;     /* Blocks with atom numbers          */
  94     char       **grpnames; /* The names of the groups           */
  95     bool        *bDisable; /* Group indexes out of natoms in TRX   */
  96     bool        *bShow;    /* Show a group ?                    */
  97 } t_filter;
  98
  99 /*
 100  * t_manager structure:
 101  *
 102  * This structure manages the display area for the gmx program.
 103  * It reads the status file and sends messages when windows need to
 104  * be updated.
 105  *
 106  */
 107 typedef struct {
 108     t_trxstatus   *status;
 109     const char    *trajfile;
 110     int            natom;    /* The number of atoms                     */
 111     t_topology     top;      /* topology                             */
 112     rvec           box_size;
 113     real           time;     /* The actual time                      */
 114     rvec          *x;        /* The coordinates                 */
 115     iv2           *ix;       /* The coordinates after projection        */
 116     real          *zz;       /* Z-coords                             */
 117     matrix         box;      /* The box                         */
 118     int            nobj;     /* The number of objects           */
 119     t_object      *obj;      /* The objects on screen           */
 120     bool          *bHydro;   /* true for hydrogen atoms         */
 121     bool          *bLabel;   /* Show a label on atom i?              */
 122     char         **szLab;    /* Array of pointers to labels          */
 123     unsigned long *col;      /* The colour of the atoms         */
 124     int           *size;     /* The size of the atoms           */
 125     real          *vdw;      /* The VDWaals radius of the atoms */
 126     bool          *bVis;     /* visibility of atoms                  */
 127     bool           bPbc;     /* Remove Periodic boundary             */
 128     bool           bAnimate; /* Animation going on?                     */
 129     bool           bEof;     /* End of file reached?                 */
 130     bool           bStop;    /* Stopped by user?                     */
 131     bool           bSort;    /* Sort the coordinates                    */
 132     bool           bPlus;    /* Draw plus for single atom               */
 133     int            nSkip;    /* Skip n steps after each frame   */
 134     int            nWait;    /* Wait n ms after each frame           */
 135     gmx_rmpbc_t    gpbc;     /* For removing peridiocity             */
 136
 137     t_windata      wd;       /* The manager subwindow                */
 138     t_windata      title;    /* Title window                            */
 139     t_3dview      *view;     /* The 3d struct                        */
 140     t_molwin      *molw;     /* The molecule window                     */
 141     t_butbox      *vbox;     /* The video box                   */
 142     t_butbox      *bbox;     /* The button box                  */
 143     t_legendwin   *legw;     /* The legend window                       */
 144
 145     output_env_t   oenv;     /* output env data */
 146 } t_manager;
 147
 148 extern t_manager *init_man(t_x11 *x11, Window Parent,
 149                            int x, int y, int width, int height,
 150                            unsigned long fg, unsigned long bg,
 151                            int ePBC, matrix box, const output_env_t oenv);
 152 /* Initiate the display manager */
 153
 154 extern void move_man(t_x11 *x11, t_manager *man, int width, int height);
 155 /* Set the right size for this window */
 156
 157 extern void step_message(t_x11 *x11, t_manager *man);
 158 /* Send a message to the manager */
 159
 160 extern void set_file(t_x11 *x11, t_manager *man, const char *trajectory,
 161                      const char *status);
 162 /* Read a new trajectory and topology */
 163
 164 extern void map_man(t_x11 *x11, t_manager *man);
 165
 166 extern void move_man(t_x11 *x11, t_manager *man, int width, int height);
 167
 168 extern bool toggle_animate (t_x11 *x11, t_manager *man);
 169
 170 extern bool toggle_pbc (t_manager *man);
 171
 172 extern void no_labels(t_x11 *x11, t_manager *man);
 173 /* Turn off all labels */
 174
 175 extern void done_man(t_x11 *x11, t_manager *man);
 176 /* Clean up man struct */
 177
 178 extern void draw_mol(t_x11 *x11, t_manager *man);
 179
 180 extern void do_filter(t_x11 *x11, t_manager *man, t_filter *filter);
 181
 182 #endif