src/programs/mdrun/tests/grompp.cpp

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 2015,2019, by the GROMACS development team, led by
   5  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   6  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   7  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
   8  *
   9  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  10  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  11  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  12  * of the License, or (at your option) any later version.
  13  *
  14  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  15  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  16  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  17  * Lesser General Public License for more details.
  18  *
  19  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  20  * License along with GROMACS; if not, see
  21  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  22  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  23  *
  24  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  25  * consider that scientific software is very special. Version
  26  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  27  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  28  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  29  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  30  * official version at http://www.gromacs.org.
  31  *
  32  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  33  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  34  */
  35
  36 /*! \internal \file
  37  * \brief
  38  * Tests for basic grompp functionality
  39  *
  40  * \todo Refactor SimulationRunner to split off SimulationPreparer, so
  41  * that integration tests of grompp can stand apart from tests of
  42  * mdrun.
  43  *
  44  * \author Mark Abraham <mark.j.abraham@gmail.com>
  45  * \ingroup module_mdrun_integration_tests
  46  */
  47 #include "gmxpre.h"
  48
  49 #include <gtest/gtest.h>
  50
  51 #include "moduletest.h"
  52
  53 namespace
  54 {
  55
  56 //! Test fixture for grompp
  57 class GromppTest : public gmx::test::MdrunTestFixture
  58 {
  59 public:
  60     //! Execute the trajectory writing test
  61     void runTest()
  62     {
  63         runner_.useTopGroAndNdxFromDatabase("spc-and-methanol");
  64         EXPECT_EQ(0, runner_.callGrompp());
  65     }
  66 };
  67
  68 /* This test ensures that an empty .mdp file (ie. all default values) works. */
  69 TEST_F(GromppTest, EmptyMdpFileWorks)
  70 {
  71     runner_.useEmptyMdpFile();
  72     runTest();
  73 }
  74
  75 /* Test for making sure grompp can handle simulated annealing data */
  76 TEST_F(GromppTest, SimulatedAnnealingWorks)
  77 {
  78     runner_.useStringAsMdpFile(
  79             "annealing = periodic\n"
  80             "annealing-npoints = 4\n"
  81             "annealing-time = 0 2 4 6\n"
  82             "annealing-temp = 298 320 320 298\n");
  83     runTest();
  84 }
  85
  86 TEST_F(GromppTest, SimulatedAnnealingWorksWithMultipleGroups)
  87 {
  88     runner_.useStringAsMdpFile(
  89             "tc-grps = Methanol SOL\n"
  90             "tau-t = 0.1 0.1\n"
  91             "ref_t = 298 298\n"
  92             "annealing = single periodic\n"
  93             "annealing-npoints = 3 4\n"
  94             "annealing-time = 0 3 6 0 2 4 6\n"
  95             "annealing-temp = 298 280 270 298 320 320 298\n");
  96     runTest();
  97 }
  98
  99
 100 } // namespace