src/programs/mdrun/tests/compressed_x_output.cpp

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 2014, by the GROMACS development team, led by
   5  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   6  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   7  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
   8  *
   9  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  10  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  11  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  12  * of the License, or (at your option) any later version.
  13  *
  14  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  15  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  16  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  17  * Lesser General Public License for more details.
  18  *
  19  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  20  * License along with GROMACS; if not, see
  21  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  22  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  23  *
  24  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  25  * consider that scientific software is very special. Version
  26  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  27  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  28  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  29  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  30  * official version at http://www.gromacs.org.
  31  *
  32  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  33  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  34  */
  35
  36 /*! \internal \file
  37  * \brief
  38  * Tests for the mdrun -x functionality
  39  *
  40  * \author Mark Abraham <mark.j.abraham@gmail.com>
  41  * \ingroup module_mdrun
  42  */
  43 #include "gmxpre.h"
  44
  45 #include "moduletest.h"
  46 #include <gtest/gtest.h>
  47 #include <string>
  48 #include "gromacs/options/filenameoption.h"
  49 #include "gromacs/tools/check.h"
  50 #include "testutils/cmdlinetest.h"
  51
  52 namespace
  53 {
  54
  55 //! Test fixture for mdrun -x
  56 class CompressedXOutputTest : public gmx::test::MdrunTestFixture,
  57                               public testing::WithParamInterface<const char*>
  58 {
  59 };
  60
  61 /* Among other things, this test ensures mdrun can write a compressed trajectory. */
  62 TEST_P(CompressedXOutputTest, ExitsNormally)
  63 {
  64     std::string mdpFile("cutoff-scheme = Group\n"
  65                         "nsteps = 1\n"
  66                         "nstxout-compressed = 1\n");
  67     mdpFile += GetParam();
  68     useStringAsMdpFile(mdpFile.c_str());
  69     useTopGroAndNdxFromDatabase("spc2");
  70     ASSERT_EQ(0, callGrompp());
  71
  72     reducedPrecisionTrajectoryFileName = fileManager_.getTemporaryFilePath(".xtc");
  73     ASSERT_EQ(0, callMdrun());
  74
  75     ::gmx::test::CommandLine checkCaller;
  76     checkCaller.append("check");
  77     checkCaller.addOption("-f", reducedPrecisionTrajectoryFileName);
  78     ASSERT_EQ(0, gmx_check(checkCaller.argc(), checkCaller.argv()));
  79 }
  80
  81 #ifdef __INTEL_COMPILER
  82 /* If we learn why this invocation triggers the "declared but not
  83    referenced" warning with ICC 12 on Windows and the case in
  84    gromacs/fft/tests/fft.cpp does not, then we can consider a more
  85    general solution. The pragma works also on MSVC, but so far is not
  86    required. */
  87 #pragma warning( disable : 177 )
  88 #endif
  89
  90 INSTANTIATE_TEST_CASE_P(WithDifferentMdpOptions, CompressedXOutputTest,
  91                             ::testing::Values
  92                             ( // Test writing the whole system via
  93                               // the default behaviour
  94                             "",
  95
  96                             // Test writing the whole system
  97                             // explicitly
  98                             "compressed-x-grps = System\n",
  99
 100                             // Test writing only part of the system.
 101                             // It would be nice to check that this test
 102                             // writes 3 atoms and the others write 6, but
 103                             // that's not yet easy.
 104                             "compressed-x-grps = SecondWaterMolecule\n"
 105                             ));
 106
 107 } // namespace