src/programs/mdrun/tests/compressed_x_output.cpp

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 2014, by the GROMACS development team, led by
   5  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   6  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   7  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
   8  *
   9  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  10  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  11  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  12  * of the License, or (at your option) any later version.
  13  *
  14  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  15  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  16  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  17  * Lesser General Public License for more details.
  18  *
  19  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  20  * License along with GROMACS; if not, see
  21  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  22  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  23  *
  24  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  25  * consider that scientific software is very special. Version
  26  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  27  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  28  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  29  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  30  * official version at http://www.gromacs.org.
  31  *
  32  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  33  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  34  */
  35
  36 /*! \internal \file
  37  * \brief
  38  * Tests for the mdrun -x functionality
  39  *
  40  * \author Mark Abraham <mark.j.abraham@gmail.com>
  41  * \ingroup module_mdrun
  42  */
  43 #include "gmxpre.h"
  44
  45 #include <string>
  46
  47 #include <gtest/gtest.h>
  48
  49 #include "gromacs/options/filenameoption.h"
  50 #include "gromacs/tools/check.h"
  51
  52 #include "testutils/cmdlinetest.h"
  53
  54 #include "moduletest.h"
  55
  56 namespace
  57 {
  58
  59 //! Test fixture for mdrun -x
  60 class CompressedXOutputTest : public gmx::test::MdrunTestFixture,
  61                               public testing::WithParamInterface<const char*>
  62 {
  63 };
  64
  65 /* Among other things, this test ensures mdrun can write a compressed trajectory. */
  66 TEST_P(CompressedXOutputTest, ExitsNormally)
  67 {
  68     std::string mdpFile("cutoff-scheme = Group\n"
  69                         "nsteps = 1\n"
  70                         "nstxout-compressed = 1\n");
  71     mdpFile += GetParam();
  72     useStringAsMdpFile(mdpFile.c_str());
  73     useTopGroAndNdxFromDatabase("spc2");
  74     ASSERT_EQ(0, callGrompp());
  75
  76     reducedPrecisionTrajectoryFileName = fileManager_.getTemporaryFilePath(".xtc");
  77     ASSERT_EQ(0, callMdrun());
  78
  79     ::gmx::test::CommandLine checkCaller;
  80     checkCaller.append("check");
  81     checkCaller.addOption("-f", reducedPrecisionTrajectoryFileName);
  82     ASSERT_EQ(0, gmx_check(checkCaller.argc(), checkCaller.argv()));
  83 }
  84
  85 #ifdef __INTEL_COMPILER
  86 /* If we learn why this invocation triggers the "declared but not
  87    referenced" warning with ICC 12 on Windows and the case in
  88    gromacs/fft/tests/fft.cpp does not, then we can consider a more
  89    general solution. The pragma works also on MSVC, but so far is not
  90    required. */
  91 #pragma warning( disable : 177 )
  92 #endif
  93
  94 INSTANTIATE_TEST_CASE_P(WithDifferentMdpOptions, CompressedXOutputTest,
  95                             ::testing::Values
  96                             ( // Test writing the whole system via
  97                               // the default behaviour
  98                             "",
  99
 100                             // Test writing the whole system
 101                             // explicitly
 102                             "compressed-x-grps = System\n",
 103
 104                             // Test writing only part of the system.
 105                             // It would be nice to check that this test
 106                             // writes 3 atoms and the others write 6, but
 107                             // that's not yet easy.
 108                             "compressed-x-grps = SecondWaterMolecule\n"
 109                             ));
 110
 111 } // namespace