Sort includes outside src/gromacs
[alexxy/gromacs.git] / src / programs / mdrun / membed.h
1 /*
2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
3  *
4  * Copyright (c) 2012,2014, by the GROMACS development team, led by
5  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
6  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
7  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
8  *
9  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
10  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
11  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
12  * of the License, or (at your option) any later version.
13  *
14  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
15  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
16  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
17  * Lesser General Public License for more details.
18  *
19  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
20  * License along with GROMACS; if not, see
21  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
22  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
23  *
24  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
25  * consider that scientific software is very special. Version
26  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
27  * consider code for inclusion in the official distribution, but
28  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
29  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
30  * official version at http://www.gromacs.org.
31  *
32  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
33  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
34  */
35
36 #ifndef _gmx_membed_h
37 #define _gmx_membed_h
38
39 #include "gromacs/fileio/filenm.h"
40 #include "gromacs/legacyheaders/typedefs.h"
41 #include "gromacs/legacyheaders/types/membedt.h"
42
43 #ifdef __cplusplus
44 extern "C" {
45 #endif
46
47 /* initialisation of membed code */
48 gmx_membed_t init_membed(FILE *fplog, int nfile, const t_filenm fnm[], gmx_mtop_t *mtop,
49                          t_inputrec *inputrec, t_state *state, t_commrec *cr, real *cpt);
50
51 /* rescaling the coordinates voor de membed code */
52 void rescale_membed(int step_rel, gmx_membed_t membed, rvec *x);
53
54 #ifdef __cplusplus
55 }
56 #endif
57
58 #endif