src/gromacs/utility/exceptions.cpp

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 2011,2012,2013,2014,2015, by the GROMACS development team, led by
   5  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   6  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   7  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
   8  *
   9  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  10  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  11  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  12  * of the License, or (at your option) any later version.
  13  *
  14  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  15  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  16  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  17  * Lesser General Public License for more details.
  18  *
  19  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  20  * License along with GROMACS; if not, see
  21  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  22  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  23  *
  24  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  25  * consider that scientific software is very special. Version
  26  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  27  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  28  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  29  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  30  * official version at http://www.gromacs.org.
  31  *
  32  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  33  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  34  */
  35 /*! \internal \file
  36  * \brief
  37  * Implements classes and functions in exceptions.h.
  38  *
  39  * \author Teemu Murtola <teemu.murtola@gmail.com>
  40  * \ingroup module_utility
  41  */
  42 #include "gmxpre.h"
  43
  44 #include "exceptions.h"
  45
  46 #include "config.h"
  47
  48 #include <cstring>
  49
  50 #include <new>
  51 #include <stdexcept>
  52 #include <typeinfo>
  53
  54 #include <boost/shared_ptr.hpp>
  55 #include <boost/exception/get_error_info.hpp>
  56
  57 #include "thread_mpi/system_error.h"
  58
  59 #include "gromacs/utility/basenetwork.h"
  60 #include "gromacs/utility/errorcodes.h"
  61 #include "gromacs/utility/gmxassert.h"
  62 #include "gromacs/utility/stringutil.h"
  63 #include "gromacs/utility/textwriter.h"
  64
  65 #include "errorformat.h"
  66
  67 namespace gmx
  68 {
  69
  70 namespace
  71 {
  72
  73 /********************************************************************
  74  * ErrorMessage
  75  */
  76
  77 /*! \brief
  78  * Error message or error context text item.
  79  *
  80  * Error messages for an exception are represented as a chain of ErrorMessage
  81  * objects: the elements at the bottom of the chain (with no children) is the
  82  * error message, and other elements are the context strings added.
  83  *
  84  * \ingroup module_utility
  85  */
  86 class ErrorMessage
  87 {
  88     public:
  89         /*! \brief
  90          * Creates an error message object with the specified text.
  91          *
  92          * \param[in] text  Text for the message.
  93          */
  94         explicit ErrorMessage(const std::string &text);
  95
  96         //! Whether this object is a context string.
  97         bool isContext() const { return static_cast<bool>(child_); }
  98         //! Returns the text for this object.
  99         const std::string &text() const { return text_; }
 100         /*! \brief
 101          * Returns the child object for a context object.
 102          *
 103          * Must not be called if isContext() returns false.
 104          */
 105         const ErrorMessage &child() const
 106         {
 107             GMX_ASSERT(isContext(),
 108                        "Attempting to access nonexistent message object");
 109             return *child_;
 110         }
 111
 112         /*! \brief
 113          * Creates a new message object with context prepended.
 114          *
 115          * \param[in] context  Context string to add.
 116          * \returns   New error message object that has \p context as its text
 117          *      and \c this as its child.
 118          * \throws    std::bad_alloc if out of memory.
 119          */
 120         ErrorMessage prependContext(const std::string &context) const;
 121
 122     private:
 123         std::string                     text_;
 124         boost::shared_ptr<ErrorMessage> child_;
 125 };
 126
 127 /*! \internal \brief
 128  * Stores a reason or the top-most context string of an exception.
 129  *
 130  * \ingroup module_utility
 131  */
 132 typedef boost::error_info<struct errinfo_message_, ErrorMessage>
 133     errinfo_message;
 134
 135 ErrorMessage::ErrorMessage(const std::string &text)
 136     : text_(text)
 137 {
 138     size_t length = text_.find_last_not_of(" \n");
 139     if (length == std::string::npos)
 140     {
 141         length = text_.length() - 1;
 142     }
 143     text_.resize(length + 1);
 144 }
 145
 146 ErrorMessage
 147 ErrorMessage::prependContext(const std::string &context) const
 148 {
 149     ErrorMessage newMessage(context);
 150     newMessage.child_.reset(new ErrorMessage(*this));
 151     return newMessage;
 152 }
 153
 154 /*! \brief
 155  * Stores list of nested exceptions for Gromacs exceptions.
 156  *
 157  * \ingroup module_utility
 158  */
 159 typedef boost::error_info<struct errinfo_message_, internal::NestedExceptionList>
 160     errinfo_nested_exceptions;
 161
 162 }   // namespace
 163
 164 /********************************************************************
 165  * GromacsException
 166  */
 167
 168 GromacsException::GromacsException(const ExceptionInitializer &details)
 169 {
 170     *this << errinfo_message(ErrorMessage(details.reason_));
 171     if (details.hasNestedExceptions())
 172     {
 173         *this << errinfo_nested_exceptions(details.nested_);
 174     }
 175 }
 176
 177 const char *GromacsException::what() const throw()
 178 {
 179     const ErrorMessage *msg = boost::get_error_info<errinfo_message>(*this);
 180     if (msg == NULL)
 181     {
 182         return "No reason provided";
 183     }
 184     while (msg->isContext())
 185     {
 186         msg = &msg->child();
 187     }
 188     return msg->text().c_str();
 189 }
 190
 191 void GromacsException::prependContext(const std::string &context)
 192 {
 193     const ErrorMessage *msg = boost::get_error_info<errinfo_message>(*this);
 194     GMX_RELEASE_ASSERT(msg != NULL, "Message should always be set");
 195     *this << errinfo_message(msg->prependContext(context));
 196 }
 197
 198 /********************************************************************
 199  * Derived exception classes
 200  */
 201
 202 int FileIOError::errorCode() const
 203 {
 204     return eeFileIO;
 205 }
 206
 207 int InvalidInputError::errorCode() const
 208 {
 209     return eeInvalidInput;
 210 }
 211
 212 int InconsistentInputError::errorCode() const
 213 {
 214     return eeInconsistentInput;
 215 }
 216
 217 int SimulationInstabilityError::errorCode() const
 218 {
 219     return eeInstability;
 220 }
 221
 222 int InternalError::errorCode() const
 223 {
 224     return eeInternalError;
 225 }
 226
 227 int APIError::errorCode() const
 228 {
 229     return eeAPIError;
 230 }
 231
 232 int NotImplementedError::errorCode() const
 233 {
 234     return eeNotImplemented;
 235 }
 236
 237
 238 /********************************************************************
 239  * Global functions
 240  */
 241
 242 namespace
 243 {
 244
 245 //! \addtogroup module_utility
 246 //! \{
 247
 248 /*! \brief
 249  * Abstracts actual output from the other logic in exception formatting.
 250  *
 251  * Object that implements this interface is passed to
 252  * formatExceptionMessageInternal(), and is responsible for composing the
 253  * output.  This allows using the same implementation of interpreting the
 254  * exceptions while still supporting output to different formats (e.g., to a
 255  * string or to \c stderr).
 256  */
 257 class IMessageWriter
 258 {
 259     public:
 260         virtual ~IMessageWriter() {}
 261
 262         /*! \brief
 263          * Writes a single line of text into the output.
 264          *
 265          * \param[in] text    Text to write on the line.
 266          * \param[in] indent  Suggested number of spaces to indent the line.
 267          */
 268         virtual void writeLine(const char *text, int indent) = 0;
 269         /*! \brief
 270          * Writes information about a system error (errno-based).
 271          *
 272          * \param[in] errorNumber  errno value
 273          * \param[in] funcName     Name of the system call (can be NULL).
 274          * \param[in] indent       Suggested number of spaces to indent the output.
 275          */
 276         virtual void writeErrNoInfo(int errorNumber, const char *funcName,
 277                                     int indent) = 0;
 278 };
 279
 280 /*! \brief
 281  * Exception information writer for cases where exceptions should be avoided.
 282  *
 283  * Formats the messages into the provided FILE handle without checking for
 284  * errors in std::fprintf() calls.
 285  */
 286 class MessageWriterFileNoThrow : public IMessageWriter
 287 {
 288     public:
 289         //! Initializes a writer that writes to the given file handle.
 290         explicit MessageWriterFileNoThrow(FILE *fp) : fp_(fp) {}
 291
 292         virtual void writeLine(const char *text, int indent)
 293         {
 294             internal::printFatalErrorMessageLine(fp_, text, indent);
 295         }
 296         virtual void writeErrNoInfo(int errorNumber, const char *funcName,
 297                                     int indent)
 298         {
 299             std::fprintf(fp_, "%*sReason: %s\n", indent, "",
 300                          std::strerror(errorNumber));
 301             if (funcName != NULL)
 302             {
 303                 std::fprintf(fp_, "%*s(call to %s() returned error code %d)\n",
 304                              indent, "", funcName, errorNumber);
 305             }
 306         }
 307
 308     private:
 309         FILE                   *fp_;
 310 };
 311
 312 /*! \brief
 313  * Exception information writer to format into a TextOutputStream.
 314  */
 315 class MessageWriterTextWriter : public IMessageWriter
 316 {
 317     public:
 318         //! Initializes a writer that writes to the given stream.
 319         explicit MessageWriterTextWriter(TextWriter *writer) : writer_(writer)
 320         {
 321         }
 322
 323         virtual void writeLine(const char *text, int indent)
 324         {
 325             writer_->wrapperSettings().setIndent(indent);
 326             writer_->writeLine(text);
 327         }
 328         virtual void writeErrNoInfo(int errorNumber, const char *funcName,
 329                                     int indent)
 330         {
 331             writer_->wrapperSettings().setIndent(indent);
 332             writer_->writeLine(formatString("Reason: %s", std::strerror(errorNumber)));
 333             if (funcName != NULL)
 334             {
 335                 writer_->writeLine(
 336                         formatString("(call to %s() returned error code %d)",
 337                                      funcName, errorNumber));
 338             }
 339         }
 340
 341     private:
 342         TextWriter     *writer_;
 343 };
 344
 345 /*! \brief
 346  * Exception information writer to format into an std::string.
 347  */
 348 class MessageWriterString : public IMessageWriter
 349 {
 350     public:
 351         //! Post-processes the output string to not end in a line feed.
 352         void removeTerminatingLineFeed()
 353         {
 354             if (result_.size() > 0U)
 355             {
 356                 result_.erase(result_.size() - 1);
 357             }
 358         }
 359         //! Returns the constructed string.
 360         const std::string &result() const { return result_; }
 361
 362         virtual void writeLine(const char *text, int indent)
 363         {
 364             result_.append(indent, ' ');
 365             result_.append(text);
 366             result_.append("\n");
 367         }
 368         virtual void writeErrNoInfo(int errorNumber, const char *funcName,
 369                                     int indent)
 370         {
 371             writeLine(formatString("Reason: %s", std::strerror(errorNumber)).c_str(),
 372                       indent);
 373             if (funcName != NULL)
 374             {
 375                 writeLine(formatString("(call to %s() returned error code %d)",
 376                                        funcName, errorNumber).c_str(),
 377                           indent);
 378             }
 379         }
 380
 381     private:
 382         std::string             result_;
 383 };
 384
 385 /*! \brief
 386  * Prints error information for an exception object.
 387  *
 388  * \param[in] writer  Writer to write out the information.
 389  * \param[in] ex      Exception object to print.
 390  * \param[in] indent  Indentation for the information.
 391  *
 392  * If the exception contains nested exceptions, information from them is
 393  * recursively printed.
 394  *
 395  * Does not throw unless the writer throws.
 396  */
 397 void formatExceptionMessageInternal(IMessageWriter *writer,
 398                                     const std::exception &ex, int indent)
 399 {
 400     const boost::exception *boostEx = dynamic_cast<const boost::exception *>(&ex);
 401     if (boostEx != NULL)
 402     {
 403         // TODO: Add an option to print this information for the tests
 404         // const char *const *funcPtr =
 405         //     boost::get_error_info<boost::throw_function>(*boostEx);
 406         // const char *const *filePtr =
 407         //     boost::get_error_info<boost::throw_file>(*boostEx);
 408         // const int         *linePtr =
 409         //     boost::get_error_info<boost::throw_line>(*boostEx);
 410
 411         // std::string        result;
 412         // if (filePtr != NULL && linePtr != NULL)
 413         // {
 414         //     result = formatString("%s:%d: %s\n", *filePtr, *linePtr,
 415         //                           funcPtr != NULL ? *funcPtr : "");
 416         // }
 417
 418         bool                bAnythingWritten = false;
 419         // TODO: Remove duplicate context if present in multiple nested exceptions.
 420         const ErrorMessage *msg = boost::get_error_info<errinfo_message>(*boostEx);
 421         if (msg != NULL)
 422         {
 423             while (msg != NULL && msg->isContext())
 424             {
 425                 writer->writeLine(msg->text().c_str(), indent*2);
 426                 ++indent;
 427                 msg = &msg->child();
 428             }
 429             if (msg != NULL && !msg->text().empty())
 430             {
 431                 writer->writeLine(msg->text().c_str(), indent*2);
 432                 bAnythingWritten = true;
 433             }
 434         }
 435         else
 436         {
 437             writer->writeLine(ex.what(), indent*2);
 438             bAnythingWritten = true;
 439         }
 440
 441         const int *errorNumber
 442             = boost::get_error_info<boost::errinfo_errno>(*boostEx);
 443         if (errorNumber != NULL)
 444         {
 445             const char * const *funcName
 446                 = boost::get_error_info<boost::errinfo_api_function>(*boostEx);
 447             writer->writeErrNoInfo(*errorNumber,
 448                                    funcName != NULL ? *funcName : NULL,
 449                                    (indent+1)*2);
 450             bAnythingWritten = true;
 451         }
 452
 453         // TODO: Treat also boost::nested_exception (not currently used, though)
 454
 455         const internal::NestedExceptionList *nested
 456             = boost::get_error_info<errinfo_nested_exceptions>(*boostEx);
 457         if (nested != NULL)
 458         {
 459             internal::NestedExceptionList::const_iterator ni;
 460             for (ni = nested->begin(); ni != nested->end(); ++ni)
 461             {
 462                 try
 463                 {
 464                     rethrow_exception(*ni);
 465                 }
 466                 catch (const std::exception &nestedEx)
 467                 {
 468                     const int newIndent = indent + (bAnythingWritten ? 1 : 0);
 469                     formatExceptionMessageInternal(writer, nestedEx, newIndent);
 470                 }
 471             }
 472         }
 473     }
 474     else
 475     {
 476         writer->writeLine(ex.what(), indent*2);
 477     }
 478 }
 479
 480 //! \}
 481
 482 }   // namespace
 483
 484 void printFatalErrorMessage(FILE *fp, const std::exception &ex)
 485 {
 486     const char             *title      = "Unknown exception";
 487     bool                    bPrintType = false;
 488     const GromacsException *gmxEx      = dynamic_cast<const GromacsException *>(&ex);
 489     // TODO: Treat more of the standard exceptions
 490     if (gmxEx != NULL)
 491     {
 492         title = getErrorCodeString(gmxEx->errorCode());
 493     }
 494     else if (dynamic_cast<const tMPI::system_error *>(&ex) != NULL)
 495     {
 496         title = "System error in thread synchronization";
 497     }
 498     else if (dynamic_cast<const std::bad_alloc *>(&ex) != NULL)
 499     {
 500         title = "Memory allocation failed";
 501     }
 502     else if (dynamic_cast<const std::logic_error *>(&ex) != NULL)
 503     {
 504         title      = "Standard library logic error (bug)";
 505         bPrintType = true;
 506     }
 507     else if (dynamic_cast<const std::runtime_error *>(&ex) != NULL)
 508     {
 509         title      = "Standard library runtime error (possible bug)";
 510         bPrintType = true;
 511     }
 512     else
 513     {
 514         bPrintType = true;
 515     }
 516     // We can't call get_error_info directly on ex since our internal boost
 517     // needs to be compiled with BOOST_NO_RTTI. So we do the dynamic_cast
 518     // here instead.
 519     const char *const      *funcPtr = NULL;
 520     const char *const      *filePtr = NULL;
 521     const int              *linePtr = NULL;
 522     const boost::exception *boostEx = dynamic_cast<const boost::exception *>(&ex);
 523     if (boostEx != NULL)
 524     {
 525         funcPtr = boost::get_error_info<boost::throw_function>(*boostEx);
 526         filePtr = boost::get_error_info<boost::throw_file>(*boostEx);
 527         linePtr = boost::get_error_info<boost::throw_line>(*boostEx);
 528     }
 529     internal::printFatalErrorHeader(fp, title,
 530                                     funcPtr != NULL ? *funcPtr : NULL,
 531                                     filePtr != NULL ? *filePtr : NULL,
 532                                     linePtr != NULL ? *linePtr : 0);
 533     if (bPrintType)
 534     {
 535         std::fprintf(fp, "(exception type: %s)\n", typeid(ex).name());
 536     }
 537     MessageWriterFileNoThrow writer(fp);
 538     formatExceptionMessageInternal(&writer, ex, 0);
 539     internal::printFatalErrorFooter(fp);
 540 }
 541
 542 std::string formatExceptionMessageToString(const std::exception &ex)
 543 {
 544     MessageWriterString writer;
 545     formatExceptionMessageInternal(&writer, ex, 0);
 546     writer.removeTerminatingLineFeed();
 547     return writer.result();
 548 }
 549
 550 void formatExceptionMessageToFile(FILE *fp, const std::exception &ex)
 551 {
 552     MessageWriterFileNoThrow writer(fp);
 553     formatExceptionMessageInternal(&writer, ex, 0);
 554 }
 555
 556 void formatExceptionMessageToWriter(TextWriter           *writer,
 557                                     const std::exception &ex)
 558 {
 559     MessageWriterTextWriter messageWriter(writer);
 560     formatExceptionMessageInternal(&messageWriter, ex, 0);
 561 }
 562
 563 int processExceptionAtExit(const std::exception & /*ex*/)
 564 {
 565     int returnCode = 1;
 566 #ifdef GMX_LIB_MPI
 567     // TODO: Consider moving the output done in gmx_abort() into the message
 568     // printing routine above, so that this could become a simple MPI_Abort().
 569     gmx_abort(returnCode);
 570 #endif
 571     return returnCode;
 572 }
 573
 574 } // namespace gmx