src/gromacs/utility/datafilefinder.cpp

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 2014,2015, by the GROMACS development team, led by
   5  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   6  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   7  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
   8  *
   9  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  10  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  11  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  12  * of the License, or (at your option) any later version.
  13  *
  14  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  15  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  16  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  17  * Lesser General Public License for more details.
  18  *
  19  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  20  * License along with GROMACS; if not, see
  21  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  22  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  23  *
  24  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  25  * consider that scientific software is very special. Version
  26  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  27  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  28  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  29  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  30  * official version at http://www.gromacs.org.
  31  *
  32  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  33  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  34  */
  35 /*! \internal \file
  36  * \brief
  37  * Implements gmx::DataFileFinder.
  38  *
  39  * \author Teemu Murtola <teemu.murtola@gmail.com>
  40  * \ingroup module_utility
  41  */
  42 #include "gmxpre.h"
  43
  44 #include "datafilefinder.h"
  45
  46 #include <cstdlib>
  47
  48 #include <string>
  49 #include <vector>
  50
  51 #include "buildinfo.h"
  52 #include "gromacs/utility/directoryenumerator.h"
  53 #include "gromacs/utility/exceptions.h"
  54 #include "gromacs/utility/filestream.h"
  55 #include "gromacs/utility/path.h"
  56 #include "gromacs/utility/programcontext.h"
  57 #include "gromacs/utility/stringutil.h"
  58
  59 namespace gmx
  60 {
  61
  62 /********************************************************************
  63  * DataFileFinder::Impl
  64  */
  65
  66 class DataFileFinder::Impl
  67 {
  68     public:
  69         static std::string getDefaultPath();
  70
  71         Impl() : envName_(NULL), bEnvIsSet_(false) {}
  72
  73         const char               *envName_;
  74         bool                      bEnvIsSet_;
  75         std::vector<std::string>  searchPath_;
  76 };
  77
  78 std::string DataFileFinder::Impl::getDefaultPath()
  79 {
  80     const InstallationPrefixInfo installPrefix
  81         = getProgramContext().installationPrefix();
  82     if (!isNullOrEmpty(installPrefix.path))
  83     {
  84         const char *const dataPath
  85             = installPrefix.bSourceLayout ? "share" : DATA_INSTALL_DIR;
  86         return Path::join(installPrefix.path, dataPath, "top");
  87     }
  88     return std::string();
  89 }
  90
  91 /********************************************************************
  92  * DataFileFinder
  93  */
  94
  95 DataFileFinder::DataFileFinder()
  96     : impl_(NULL)
  97 {
  98 }
  99
 100 DataFileFinder::~DataFileFinder()
 101 {
 102 }
 103
 104 void DataFileFinder::setSearchPathFromEnv(const char *envVarName)
 105 {
 106     if (!impl_.get())
 107     {
 108         impl_.reset(new Impl());
 109     }
 110     impl_->envName_ = envVarName;
 111     const char *const lib = getenv(envVarName);
 112     if (lib != NULL)
 113     {
 114         impl_->bEnvIsSet_ = true;
 115         Path::splitPathEnvironment(lib, &impl_->searchPath_);
 116     }
 117 }
 118
 119 FILE *DataFileFinder::openFile(const DataFileOptions &options) const
 120 {
 121     // TODO: There is a small race here, since there is some time between
 122     // the exists() calls and actually opening the file.  It would be better
 123     // to leave the file open after a successful exists() if the desire is to
 124     // actually open the file.
 125     std::string filename = findFile(options);
 126     if (filename.empty())
 127     {
 128         return NULL;
 129     }
 130 #if 0
 131     if (debug)
 132     {
 133         fprintf(debug, "Opening library file %s\n", fn);
 134     }
 135 #endif
 136     return TextInputFile::openRawHandle(filename);
 137 }
 138
 139 std::string DataFileFinder::findFile(const DataFileOptions &options) const
 140 {
 141     if (options.bCurrentDir_ && Path::exists(options.filename_))
 142     {
 143         return options.filename_;
 144     }
 145     if (impl_.get())
 146     {
 147         std::vector<std::string>::const_iterator i;
 148         for (i = impl_->searchPath_.begin(); i != impl_->searchPath_.end(); ++i)
 149         {
 150             // TODO: Deal with an empty search path entry more reasonably.
 151             std::string testPath = Path::join(*i, options.filename_);
 152             // TODO: Consider skipping directories.
 153             if (Path::exists(testPath))
 154             {
 155                 return testPath;
 156             }
 157         }
 158     }
 159     const std::string &defaultPath = Impl::getDefaultPath();
 160     if (!defaultPath.empty())
 161     {
 162         std::string testPath = Path::join(defaultPath, options.filename_);
 163         if (Path::exists(testPath))
 164         {
 165             return testPath;
 166         }
 167     }
 168     if (options.bThrow_)
 169     {
 170         const char *const envName   = (impl_.get() ? impl_->envName_ : NULL);
 171         const bool        bEnvIsSet = (impl_.get() ? impl_->bEnvIsSet_ : false);
 172         std::string       message(
 173                 formatString("Library file '%s' not found", options.filename_));
 174         if (options.bCurrentDir_)
 175         {
 176             message.append(" in current dir nor");
 177         }
 178         if (bEnvIsSet)
 179         {
 180             message.append(formatString(" in your %s path nor", envName));
 181         }
 182         message.append(" in the default directories.\nThe following paths were searched:");
 183         if (options.bCurrentDir_)
 184         {
 185             message.append("\n  ");
 186             message.append(Path::getWorkingDirectory());
 187             message.append(" (current dir)");
 188         }
 189         if (impl_.get())
 190         {
 191             std::vector<std::string>::const_iterator i;
 192             for (i = impl_->searchPath_.begin(); i != impl_->searchPath_.end(); ++i)
 193             {
 194                 message.append("\n  ");
 195                 message.append(*i);
 196             }
 197         }
 198         if (!defaultPath.empty())
 199         {
 200             message.append("\n  ");
 201             message.append(defaultPath);
 202             message.append(" (default)");
 203         }
 204         if (!bEnvIsSet && envName != NULL)
 205         {
 206             message.append(
 207                     formatString("\nYou can set additional directories to search "
 208                                  "with the %s path variable.", envName));
 209         }
 210         GMX_THROW(FileIOError(message));
 211     }
 212     return std::string();
 213 }
 214
 215 std::vector<DataFileInfo>
 216 DataFileFinder::enumerateFiles(const DataFileOptions &options) const
 217 {
 218     // TODO: Consider if not being able to list one of the directories should
 219     // really be a fatal error. Or alternatively, check somewhere else that
 220     // paths in GMXLIB are valid.
 221     std::vector<DataFileInfo>                result;
 222     std::vector<std::string>::const_iterator i;
 223     if (options.bCurrentDir_)
 224     {
 225         std::vector<std::string> files
 226             = DirectoryEnumerator::enumerateFilesWithExtension(
 227                         ".", options.filename_, false);
 228         for (i = files.begin(); i != files.end(); ++i)
 229         {
 230             result.push_back(DataFileInfo(".", *i, false));
 231         }
 232     }
 233     if (impl_.get())
 234     {
 235         std::vector<std::string>::const_iterator j;
 236         for (j = impl_->searchPath_.begin(); j != impl_->searchPath_.end(); ++j)
 237         {
 238             std::vector<std::string> files
 239                 = DirectoryEnumerator::enumerateFilesWithExtension(
 240                             j->c_str(), options.filename_, false);
 241             for (i = files.begin(); i != files.end(); ++i)
 242             {
 243                 result.push_back(DataFileInfo(*j, *i, false));
 244             }
 245         }
 246     }
 247     const std::string &defaultPath = Impl::getDefaultPath();
 248     if (!defaultPath.empty())
 249     {
 250         std::vector<std::string> files
 251             = DirectoryEnumerator::enumerateFilesWithExtension(
 252                         defaultPath.c_str(), options.filename_, false);
 253         for (i = files.begin(); i != files.end(); ++i)
 254         {
 255             result.push_back(DataFileInfo(defaultPath, *i, true));
 256         }
 257     }
 258     if (result.empty() && options.bThrow_)
 259     {
 260         // TODO: Print the search path as is done in findFile().
 261         std::string message(
 262                 formatString("Could not find any files ending on '%s' in the "
 263                              "current directory or the GROMACS library search path",
 264                              options.filename_));
 265         GMX_THROW(FileIOError(message));
 266     }
 267     return result;
 268 }
 269
 270 } // namespace gmx