src/gromacs/mdlib/update_constrain_gpu_internal_sycl.cpp

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 2019,2020,2021, by the GROMACS development team, led by
   5  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   6  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   7  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
   8  *
   9  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  10  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  11  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  12  * of the License, or (at your option) any later version.
  13  *
  14  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  15  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  16  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  17  * Lesser General Public License for more details.
  18  *
  19  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  20  * License along with GROMACS; if not, see
  21  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  22  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  23  *
  24  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  25  * consider that scientific software is very special. Version
  26  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  27  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  28  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  29  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  30  * official version at http://www.gromacs.org.
  31  *
  32  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  33  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  34  */
  35 /*! \internal \file
  36  *
  37  * \brief Implements backend-specific functions of the update-constraints in SYCL.
  38  *
  39  * \author Artem Zhmurov <zhmurov@gmail.com>
  40  *
  41  * \ingroup module_mdlib
  42  */
  43 #include "gmxpre.h"
  44
  45 #include "update_constrain_gpu_internal.h"
  46
  47 #include "gromacs/gpu_utils/devicebuffer_sycl.h"
  48 #include "gromacs/gpu_utils/gmxsycl.h"
  49 #include "gromacs/gpu_utils/gputraits_sycl.h"
  50 #include "gromacs/utility/gmxassert.h"
  51
  52 //! \brief Class name for scaling kernel
  53 class ScaleKernel;
  54
  55 namespace gmx
  56 {
  57
  58 //! \brief Function returning the scaling kernel lambda.
  59 static auto scaleKernel(cl::sycl::handler&                                         cgh,
  60                         DeviceAccessor<Float3, cl::sycl::access::mode::read_write> a_x,
  61                         const ScalingMatrix                                        scalingMatrix)
  62 {
  63     cgh.require(a_x);
  64
  65     return [=](cl::sycl::id<1> itemIdx) {
  66         Float3 x     = a_x[itemIdx];
  67         x[0]         = scalingMatrix.xx * x[0] + scalingMatrix.yx * x[1] + scalingMatrix.zx * x[2];
  68         x[1]         = scalingMatrix.yy * x[1] + scalingMatrix.zy * x[2];
  69         x[2]         = scalingMatrix.zz * x[2];
  70         a_x[itemIdx] = x;
  71     };
  72 }
  73
  74 void launchScaleCoordinatesKernel(const int            numAtoms,
  75                                   DeviceBuffer<Float3> d_coordinates,
  76                                   const ScalingMatrix& mu,
  77                                   const DeviceStream&  deviceStream)
  78 {
  79     const cl::sycl::range<1> rangeAllAtoms(numAtoms);
  80     cl::sycl::queue          queue = deviceStream.stream();
  81
  82     cl::sycl::event e = queue.submit([&](cl::sycl::handler& cgh) {
  83         auto kernel = scaleKernel(cgh, d_coordinates, mu);
  84         cgh.parallel_for<ScaleKernel>(rangeAllAtoms, kernel);
  85     });
  86     // TODO: Although this only happens on the pressure coupling steps, this synchronization
  87     //       can affect the performance if nstpcouple is small. See Issue #4018
  88     e.wait_and_throw();
  89 }
  90
  91 } // namespace gmx