Unite code for handling listed pairs
[alexxy/gromacs.git] / src / gromacs / legacyheaders / nonbonded.h
1 /*
2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
3  *
4  * Copyright (c) 1991-2000, University of Groningen, The Netherlands.
5  * Copyright (c) 2001-2004, The GROMACS development team.
6  * Copyright (c) 2013,2014, by the GROMACS development team, led by
7  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
8  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
9  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
10  *
11  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
12  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
13  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
14  * of the License, or (at your option) any later version.
15  *
16  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
17  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
18  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
19  * Lesser General Public License for more details.
20  *
21  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
22  * License along with GROMACS; if not, see
23  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
24  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
25  *
26  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
27  * consider that scientific software is very special. Version
28  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
29  * consider code for inclusion in the official distribution, but
30  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
31  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
32  * official version at http://www.gromacs.org.
33  *
34  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
35  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
36  */
37
38 #ifndef _nonbonded_h
39 #define _nonbonded_h
40
41 #include "gromacs/legacyheaders/typedefs.h"
42
43 #ifdef __cplusplus
44 extern "C" {
45 #endif
46 #if 0
47 } /* fixes auto-indentation problems */
48 #endif
49
50 void
51 gmx_nonbonded_setup(t_forcerec *   fr,
52                     gmx_bool       bGenericKernelOnly);
53
54
55
56
57
58 void
59 gmx_nonbonded_set_kernel_pointers(FILE *       fplog,
60                                   t_nblist *   nl,
61                                   gmx_bool     bElecAndVdwSwitchDiffers);
62
63
64
65 #define GMX_NONBONDED_DO_LR             (1<<0)
66 #define GMX_NONBONDED_DO_FORCE          (1<<1)
67 #define GMX_NONBONDED_DO_SHIFTFORCE     (1<<2)
68 #define GMX_NONBONDED_DO_FOREIGNLAMBDA  (1<<3)
69 #define GMX_NONBONDED_DO_POTENTIAL      (1<<4)
70 #define GMX_NONBONDED_DO_SR             (1<<5)
71
72 void
73 do_nonbonded(t_forcerec *fr,
74              rvec x[], rvec f_shortrange[], rvec f_longrange[], t_mdatoms *md, t_blocka *excl,
75              gmx_grppairener_t *grppener,
76              t_nrnb *nrnb, real *lambda, real dvdlambda[],
77              int nls, int eNL, int flags);
78
79 #ifdef __cplusplus
80 }
81 #endif
82
83 #endif