src/gromacs/legacyheaders/chargegroup.h

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 1991-2000, University of Groningen, The Netherlands.
   5  * Copyright (c) 2001-2004, The GROMACS development team.
   6  * Copyright (c) 2010,2014, by the GROMACS development team, led by
   7  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   8  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   9  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
  10  *
  11  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  12  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  13  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  14  * of the License, or (at your option) any later version.
  15  *
  16  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  17  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  18  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  19  * Lesser General Public License for more details.
  20  *
  21  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  22  * License along with GROMACS; if not, see
  23  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  24  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  25  *
  26  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  27  * consider that scientific software is very special. Version
  28  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  29  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  30  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  31  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  32  * official version at http://www.gromacs.org.
  33  *
  34  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  35  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  36  */
  37
  38 #ifndef _chargegroup_h
  39 #define _chargegroup_h
  40
  41 #include <stdio.h>
  42
  43 #include "../math/vectypes.h"
  44 #include "../utility/real.h"
  45
  46 #ifdef __cplusplus
  47 extern "C" {
  48 #endif
  49
  50 struct gmx_mtop_t;
  51 struct t_block;
  52
  53 void calc_chargegroup_radii(const struct gmx_mtop_t *mtop, rvec *x,
  54                             real *rvdw1, real *rvdw2,
  55                             real *rcoul1, real *rcoul2);
  56 /* This routine calculates the two largest charge group radii in x,
  57  * separately for VdW and Coulomb interactions.
  58  */
  59
  60 void calc_cgcm(FILE *log, int cg0, int cg1, struct t_block *cgs,
  61                rvec pos[], rvec cg_cm[]);
  62 /* Routine to compute centers of geometry of charge groups. No periodicity
  63  * is used.
  64  */
  65
  66 void put_charge_groups_in_box (FILE *log, int cg0, int cg1,
  67                                int ePBC, matrix box, struct t_block *cgs,
  68                                rvec pos[],
  69                                rvec cg_cm[]);
  70 /* This routine puts charge groups in the periodic box, keeping them
  71  * together.
  72  */
  73
  74 #ifdef __cplusplus
  75 }
  76 #endif
  77
  78 #endif  /* _chargegroup_h */