src/gromacs/gmxpreprocess/gen_vsite.h

   1 /*
   2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
   3  *
   4  * Copyright (c) 1991-2000, University of Groningen, The Netherlands.
   5  * Copyright (c) 2001-2004, The GROMACS development team.
   6  * Copyright (c) 2013,2014, by the GROMACS development team, led by
   7  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
   8  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
   9  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
  10  *
  11  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
  12  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
  13  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
  14  * of the License, or (at your option) any later version.
  15  *
  16  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
  17  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
  18  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
  19  * Lesser General Public License for more details.
  20  *
  21  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
  22  * License along with GROMACS; if not, see
  23  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
  24  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
  25  *
  26  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
  27  * consider that scientific software is very special. Version
  28  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
  29  * consider code for inclusion in the official distribution, but
  30  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
  31  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
  32  * official version at http://www.gromacs.org.
  33  *
  34  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  35  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  36  */
  37
  38 #ifndef GMX_GMXPREPROCESS_GEN_VSITE_H
  39 #define GMX_GMXPREPROCESS_GEN_VSITE_H
  40
  41 #include "gromacs/legacyheaders/typedefs.h"
  42 #include "grompp-impl.h"
  43 #include "gpp_atomtype.h"
  44 #include "hackblock.h"
  45
  46 #ifdef __cplusplus
  47 extern "C"
  48 {
  49 #endif
  50
  51 /* stuff for pdb2gmx */
  52
  53 void do_vsites(int nrtp, t_restp rtp[], gpp_atomtype_t atype,
  54                t_atoms *at, struct t_symtab *symtab, rvec *x[],
  55                t_params plist[], int *dummy_type[], int *cgnr[],
  56                real mHmult, gmx_bool bVSiteAromatics,
  57                const char *ffdir);
  58
  59 void do_h_mass(t_params *psb, int vsite_type[], t_atoms *at, real mHmult,
  60                gmx_bool bDeuterate);
  61
  62 #ifdef __cplusplus
  63 }
  64 #endif
  65
  66 #endif