Add initial support for python bindings
[alexxy/gromacs.git] / src / gmxpre.h
1 /*
2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
3  *
4  * Copyright (c) 2014, by the GROMACS development team, led by
5  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
6  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
7  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
8  *
9  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
10  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
11  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
12  * of the License, or (at your option) any later version.
13  *
14  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
15  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
16  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
17  * Lesser General Public License for more details.
18  *
19  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
20  * License along with GROMACS; if not, see
21  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
22  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
23  *
24  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
25  * consider that scientific software is very special. Version
26  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
27  * consider code for inclusion in the official distribution, but
28  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
29  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
30  * official version at http://www.gromacs.org.
31  *
32  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
33  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
34  */
35 /*! \libinternal \file
36  * \brief
37  * Prerequisite header file for \Gromacs build.
38  *
39  * This header should be included as the first header in all source files, but
40  * not in header files.  It is intended to contain definitions that must appear
41  * before any other code to work properly (e.g., macro definitions that
42  * influence behavior of system headers).  This frees other code from include
43  * order dependencies that may raise from requirements of getting these
44  * definitions from some header.
45  *
46  * The definitions here should be kept to a minimum, and should be as static as
47  * possible (typically not change as a result of user choices in the build
48  * system), as any change will trigger a full rebuild.  Avoid including any
49  * actual headers to not hide problems with include-what-you-use, and to keep
50  * build times to a minimum.  Also, installer headers should avoid relying on
51  * the definitions from here (if possible), as this header will not be
52  * available to the user.
53  *
54  * \inlibraryapi
55  */
56 //! \cond
57 #ifdef HAVE_CONFIG_H
58 #include "gmxpre-config.h"
59 #endif
60
61 /* We use a few GNU functions for thread affinity and other low-level stuff.
62  * However, all such uses should be accompanied by #ifdefs and a feature test
63  * at CMake level, so that the actual uses will be compiled only when available.
64  * But since the define affects system headers, it should be defined before
65  * including any system headers, and this is a robust location to do that.
66  * If this were defined only in source files that needed it, it would clutter
67  * the list of includes somewhere close to the beginning and make automatic
68  * sorting of the includes more difficult.
69  */
70 #ifndef _GNU_SOURCE
71 #define _GNU_SOURCE 1
72 #endif
73
74 /* Some C++(?) compilers require these to be defined to get the integer limits
75  * and format specifier macros from stdint.h and inttypes.h, respectively.
76  * The macros are in C99 and C++11, but not in C++98...
77  * As with _GNU_SOURCE, these need to be defined before these headers get first
78  * included.  Unlike _GNU_SOURCE, these headers are included indirectly in most
79  * header and source files (even though the macros are not used that often), so
80  * there is no easy alternative to defining them here, either.
81  * If someone happens to use such a compiler to compile against the installed
82  * Gromacs headers, they need for now take care to define the macros themselves
83  * (as there is no way Gromacs can do that consistently).
84  */
85 #define __STDC_LIMIT_MACROS
86 #define __STDC_FORMAT_MACROS
87
88 #ifdef GMX_FAHCORE
89 #define FULLINDIRECT 1
90 #define USE_FAH_XDR  1
91 #include "swindirect.h"
92 #endif
93 //! \endcond