Add initial support for python bindings
[alexxy/gromacs.git] / src / config.h.cmakein
1 /*
2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
3  *
4  * Copyright (c) 2009,2010,2011,2012,2013,2014, by the GROMACS development team, led by
5  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
6  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
7  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
8  *
9  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
10  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
11  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
12  * of the License, or (at your option) any later version.
13  *
14  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
15  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
16  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
17  * Lesser General Public License for more details.
18  *
19  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
20  * License along with GROMACS; if not, see
21  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
22  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
23  *
24  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
25  * consider that scientific software is very special. Version
26  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
27  * consider code for inclusion in the official distribution, but
28  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
29  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
30  * official version at http://www.gromacs.org.
31  *
32  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
33  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
34  */
35 /*! \libinternal \file
36  * \brief
37  * Include file for configuration macros from the build system.
38  *
39  * This header is not installed, so headers must not reference macros defined
40  * here.
41  *
42  * \inlibraryapi
43  */
44 #ifndef GMX_CONFIG_H
45 #define GMX_CONFIG_H
46
47 #include "gromacs/utility/gmx_header_config.h"
48
49 /* TODO: For now, disable Doxygen warnings from here */
50 /*! \cond */
51
52 /* Default location of data files */
53 #define GMXLIB_SEARCH_DIR "@GMXLIB_SEARCH_DIR@"
54
55 /* Default location of data files */
56 #define GMXLIB_FALLBACK "@GMXLIB_FALLBACK@"
57
58 /* Binary suffix for the created binaries */
59 #define GMX_BINARY_SUFFIX "@GMX_BINARY_SUFFIX@"
60
61 /* Source directory for the build */
62 #cmakedefine CMAKE_SOURCE_DIR "@CMAKE_SOURCE_DIR@"
63
64 /* Binary directory for the build */
65 #cmakedefine CMAKE_BINARY_DIR "@CMAKE_BINARY_DIR@"
66
67 /* IEEE754 floating-point format. Memory layout is defined by macros
68  * GMX_IEEE754_BIG_ENDIAN_BYTE_ORDER and GMX_IEEE754_BIG_ENDIAN_WORD_ORDER. 
69  */
70 #cmakedefine GMX_FLOAT_FORMAT_IEEE754
71
72 /* Work around broken calloc() */
73 #cmakedefine GMX_BROKEN_CALLOC
74
75 /* Do not optimize FFTW setups (not needed with SSE FFT kernels) */
76 #cmakedefine GMX_DISABLE_FFTW_MEASURE
77
78 /* Use Built-in FFTPACK FFT library */
79 #cmakedefine GMX_FFT_FFTPACK
80
81 /* Use FFTW3 FFT library */
82 #cmakedefine GMX_FFT_FFTW3
83
84 /* Use Intel MKL FFT library */
85 #cmakedefine GMX_FFT_MKL
86
87 /* Target platform is x86 or x86_64 */
88 #cmakedefine GMX_TARGET_X86
89
90 /* Target platform is BlueGene/Q */
91 #cmakedefine GMX_TARGET_BGQ
92
93 /** Define if we are building for Cygwin */
94 #cmakedefine GMX_CYGWIN
95
96 /** Define if we have sufficient C++11 support */
97 #cmakedefine GMX_CXX11
98
99 /* GCC bug in AVX maskload/maskstore arguments - worked around internally */
100 #cmakedefine GMX_SIMD_X86_AVX_GCC_MASKLOAD_BUG
101
102 /* SSE2 was selected for SIMD instruction set level */
103 #cmakedefine GMX_SIMD_X86_SSE2
104
105 /* SSE4.1 was selected as SIMD instructions */
106 #cmakedefine GMX_SIMD_X86_SSE4_1
107
108 /* AVX 128-bit FMA was selected as SIMD instructions */
109 #cmakedefine GMX_SIMD_X86_AVX_128_FMA
110
111 /* AVX 256-bit was selected as SIMD instructions */
112 #cmakedefine GMX_SIMD_X86_AVX_256
113
114 /* AVX2 256-bit SIMD instruction set level was selected */
115 #cmakedefine GMX_SIMD_X86_AVX2_256
116
117 /* 32-bit ARM NEON SIMD instruction set level was selected */
118 #cmakedefine GMX_SIMD_ARM_NEON
119
120 /* ARM (AArch64) NEON Advanced SIMD instruction set level was selected */
121 #cmakedefine GMX_SIMD_ARM_NEON_ASIMD
122
123 /* IBM QPX was selected as SIMD instructions (e.g. BlueGene/Q) */
124 #cmakedefine GMX_SIMD_IBM_QPX
125
126 /* IBM VMX was selected as SIMD instructions (Power 6 and later) */
127 #cmakedefine GMX_SIMD_IBM_VMX
128
129 /* IBM VSX was selected as SIMD instructions (Power 7 and later) */
130 #cmakedefine GMX_SIMD_IBM_VSX
131  
132 /* Fujitsu Sparc64 HPC-ACE SIMD acceleration */
133 #cmakedefine GMX_SIMD_SPARC64_HPC_ACE
134
135 /* Reference SIMD implementation for testing */
136 #cmakedefine GMX_SIMD_REFERENCE
137
138 /* String for SIMD instruction choice (for writing to log files and stdout) */
139 #define GMX_SIMD_STRING "@GMX_SIMD@"
140
141 /* Calling convention string (if any) for routines with SIMD variable args */
142 #define gmx_simdcall @GMX_SIMD_CALLING_CONVENTION@
143
144 /* Integer byte order is big endian. */
145 #cmakedefine GMX_INTEGER_BIG_ENDIAN
146
147 /* Use our own instead of system XDR libraries */
148 #cmakedefine GMX_INTERNAL_XDR
149
150 /* Compile to use TNG library */
151 #cmakedefine GMX_USE_TNG
152
153 /* Add support for tracing using Extrae */
154 #cmakedefine HAVE_EXTRAE
155
156 /* Use MPI (with mpicc) for parallelization */
157 #cmakedefine GMX_LIB_MPI
158
159 /* MPI_IN_PLACE exists for collective operations */
160 #cmakedefine MPI_IN_PLACE_EXISTS
161
162 /* Make a parallel version of GROMACS using message passing
163    (MPI or thread_mpi) */
164 #cmakedefine GMX_MPI
165
166 /* Use threads_mpi for parallelization */
167 #cmakedefine GMX_THREAD_MPI
168
169 /* Use OpenMP multithreading */
170 #cmakedefine GMX_OPENMP
171
172 /* Ignore calls to nice(3) */
173 #cmakedefine GMX_NO_NICE
174
175 /* Use if can't rename checkpoints */
176 #cmakedefine GMX_NO_RENAME
177
178 /* Ignore calls to system(3) */
179 #cmakedefine GMX_NO_SYSTEM
180
181 /* Use (modified) Gamess-UK for QM-MM calculations */
182 #cmakedefine GMX_QMMM_GAMESS
183
184 /* Use (modified) Gaussian0x for QM-MM calculations */
185 #cmakedefine GMX_QMMM_GAUSSIAN
186
187 /* Use (modified) Mopac 7 for QM-MM calculations */
188 #cmakedefine GMX_QMMM_MOPAC
189
190 /* Use ORCA for QM-MM calculations */
191 #cmakedefine GMX_QMMM_ORCA
192
193 /* Use the GROMACS software 1/sqrt(x) */
194 #cmakedefine GMX_SOFTWARE_INVSQRT
195
196 /* Use sub-counters */
197 #cmakedefine GMX_CYCLE_SUBCOUNTERS
198
199 /* Compile with plugin support */
200 #cmakedefine GMX_USE_PLUGINS
201
202 /* Fallback path for VMD plug-ins */
203 #define GMX_VMD_PLUGIN_PATH "@GMX_VMD_PLUGIN_PATH@"
204
205 /* Define when pthreads are used */
206 #cmakedefine THREAD_PTHREADS
207
208 /* Define when Windows threads are used */
209 #cmakedefine THREAD_WINDOWS
210
211 /* Define native atomic operations are found */
212 #cmakedefine TMPI_ATOMICS
213
214 /* Define for busy wait option  */
215 /* See gmxpre-config.h.cmakein for explanation for the #ifdef */
216 #ifndef TMPI_WAIT_FOR_NO_ONE
217 #cmakedefine TMPI_WAIT_FOR_NO_ONE
218 #endif
219
220 /* Define for copy buffer option */
221 #cmakedefine TMPI_COPY_BUFFER
222
223 /* Define for tmpi warnings option */
224 #cmakedefine TMPI_WARNINGS
225
226 /* Define for profiling option */
227 #cmakedefine TMPI_PROFILE
228
229 /* Define for Linux pthread_setaffinity_np */
230 #cmakedefine HAVE_PTHREAD_SETAFFINITY
231
232 /* Define for X-Windows */
233 #cmakedefine GMX_X11
234
235 /* Enable x86 gcc inline assembly */
236 #cmakedefine GMX_X86_GCC_INLINE_ASM
237
238 /* Use GPU native acceleration */
239 #cmakedefine GMX_GPU
240
241 /* Define to 1 if fseeko (and presumably ftello) exists and is declared. */
242 #cmakedefine HAVE_FSEEKO
243
244 /* Define to 1 if _fseeki64 (and presumably _fseeki64) exists and is declared. */
245 #cmakedefine HAVE__FSEEKI64
246
247 /* Have io.h (windows)*/
248 #cmakedefine HAVE_IO_H
249
250 /* Define to 1 if you have the posix_memalign() function. */
251 #cmakedefine HAVE_POSIX_MEMALIGN
252
253 /* Define to 1 if you have the memalign() function. */
254 #cmakedefine HAVE_MEMALIGN
255
256 /* Define to 1 if you have the MSVC _aligned_malloc() function. */
257 #cmakedefine HAVE__ALIGNED_MALLOC
258
259 /* Define to 1 if you have the clock_gettime() function. */
260 #cmakedefine HAVE_CLOCK_GETTIME
261
262 /* Define to 1 if you have the gettimeofday() function. */
263 #cmakedefine HAVE_GETTIMEOFDAY
264
265 /* Define to 1 if you have the rdtscp instruction. */
266 #cmakedefine HAVE_RDTSCP
267
268 /* Define to 1 if you have the isfinite() function. */
269 #cmakedefine HAVE_ISFINITE
270
271 /* Define to 1 if you have the _isfinite() function. */
272 #cmakedefine HAVE__ISFINITE
273
274 /* Define to 1 if you have the _finite() function. */
275 #cmakedefine HAVE__FINITE
276
277 /* Define to 1 if you have the fsync() function. */
278 #cmakedefine HAVE_FSYNC
279
280 /* Define to 1 if you have the Windows _commit() function. */
281 #cmakedefine HAVE__COMMIT
282
283 /* Define to 1 if you have the fileno() function. */
284 #cmakedefine HAVE_FILENO
285
286 /* Define to 1 if you have the _fileno() function. */
287 #cmakedefine HAVE__FILENO
288
289 /* Define to 1 if you have the sigaction() function. */
290 #cmakedefine HAVE_SIGACTION
291
292 /* Define to 1 if you have the rsqrt() function. */
293 #cmakedefine HAVE_RSQRT
294
295 /* Define to 1 if you have the rsqrtf() function. */
296 #cmakedefine HAVE_RSQRTF
297
298 /* Define to 1 if you have the sqrtf() function. */
299 #cmakedefine HAVE_SQRTF
300
301 /* Define to 1 if yo have the <unistd.h> header file. */
302 #cmakedefine HAVE_UNISTD_H
303
304 /* Define to 1 if yo have the <pwd.h> header file. */
305 #cmakedefine HAVE_PWD_H
306
307 /* Define to 1 if yo have the <dirent.h> header file. */
308 #cmakedefine HAVE_DIRENT_H
309
310 /* Define to 1 if you have the <sys/time.h> header file. */
311 #cmakedefine HAVE_SYS_TIME_H
312
313 /* Define to 1 if you have the <x86intrin.h> header file */
314 #cmakedefine HAVE_X86INTRIN_H
315
316 /* Define to 1 if you have the <intrin.h> header file */
317 #cmakedefine HAVE_INTRIN_H
318
319 /* Define to 1 if you have the <sched.h> header */
320 #cmakedefine HAVE_SCHED_H
321
322 /* Define to 1 if you have the POSIX <regex.h> header file. */
323 #cmakedefine HAVE_POSIX_REGEX
324
325 /* Define to 1 if you have the C++11 <regex> header file. */
326 #cmakedefine HAVE_CXX11_REGEX
327
328 /* Define to 1 if you have the sysconf() function */
329 #cmakedefine HAVE_SYSCONF
330
331 /* Define to 1 if you have the all the affinity functions in sched.h */
332 #cmakedefine HAVE_SCHED_AFFINITY
333
334 /* Bytes in IEEE fp word are in big-endian order if set, little-endian if not.
335    Only relevant when FLOAT_FORMAT_IEEE754 is defined. */
336 #cmakedefine GMX_IEEE754_BIG_ENDIAN_BYTE_ORDER
337
338 /* The two words in a double precision variable are in b ig-endian order if
339    set, little-endian if not. Do NOT assume this is the same as the byte
340    order! Only relevant when FLOAT_FORMAT_IEEE754 is defined. */
341 #cmakedefine GMX_IEEE754_BIG_ENDIAN_WORD_ORDER
342
343 /* Define if SIGUSR1 is present */
344 #cmakedefine HAVE_SIGUSR1
345
346 /* Enable gromacs quotes */
347 #cmakedefine GMX_COOL_QUOTES
348
349 /* default name mangling maybe wrong on exotic plattforms */
350 #define F77_FUNC(name,NAME) name ## _
351
352 /* Define if we have pipes */
353 #cmakedefine HAVE_PIPES
354
355 /* Define if we have zlib */
356 #cmakedefine HAVE_ZLIB
357
358 /*! \endcond */
359
360 #endif