python_packaging/sample_restraint/.travis.yml

   1 # Recipe for build and integration testing on Travis-CI
   2
   3 # Try beta version of new travis-yml checker
   4 version: "= 0"
   5 # For extra debugging of failed jobs, see
   6 # https://docs.travis-ci.com/user/common-build-problems/#Troubleshooting-Locally-in-a-Docker-Image
   7
   8 os: linux
   9 dist: xenial
  10 language: cpp
  11
  12 # If we set 'ccache: true', Travis installs replacement ccache wrappers of system compilers, which we don't want,
  13 # so we'll do our own ccache management.
  14 # Note the heuristics for whether cache is shared or distinct:
  15 # https://docs.travis-ci.com/user/caching/#Caches-and-build-matrices
  16 cache:
  17   pip: true
  18   directories:
  19     # Note: if a cache store forks due to a stage with parallel jobs that Travis identifies as part of the same flow,
  20     # we must make sure that the parallel jobs do not write to any of the same caches. Also note that all stages use the
  21     # same cache, so early stage jobs may see caches from later stages from previous builds in the same branch.
  22     - $HOME/.ccache_gromacs
  23     - $HOME/.ccache_py
  24 # Allows us to build and install GROMACS in one CI stage, then use the installation in a subsequent stage
  25 #    - $HOME/install
  26
  27 compiler: gcc
  28
  29 env:
  30 # Python 2.7 and 3.6 are the only generations provided by pyenv on Travis-CI out-of-the-box
  31   - PY=2.7
  32   - PY=3.6
  33
  34 addons:
  35   apt:
  36     sources:
  37     - sourceline: 'ppa:ubuntu-toolchain-r/test'
  38     packages:
  39     - cmake
  40     - cmake-data
  41     - doxygen
  42     - libblas-dev
  43     - libcr-dev
  44     - libfftw3-dev
  45     - liblapack-dev
  46     - libmpich-dev
  47     - libxml2-dev
  48     - mpich
  49
  50 # Set up for all jobs
  51 before_install:
  52   - pyenv versions
  53   # get exactly one Python version: the last listed patch version for the selected minor version
  54   - pyenv whence python${PY} && export PY_VER=`pyenv whence python${PY} | tail -1`
  55   - pyenv shell $PY_VER && pyenv shell
  56 #  - python-config --includes
  57   - pyenv prefix ${PY_VER} && export PYTHON_PREFIX=`pyenv prefix ${PY_VER}`
  58   - pyenv which python && export PYTHON=`pyenv which python`
  59   - source ./ci_scripts/set_compilers
  60
  61 install:
  62   - export CCACHE_DIR=$HOME/.ccache_gromacs
  63   - ccache -s
  64   - ./ci_scripts/install_gromacs_2019.sh
  65 # Need to update infrastructure for new CMake version requirements to build against devel.
  66 #  - if [ "${TRAVIS_BRANCH}" != "master" ] ; then ./ci_scripts/install_gromacs_devel.sh ; fi
  67
  68 before_script:
  69   - export CCACHE_DIR=$HOME/.ccache_py
  70   - ccache -s
  71   - pip install --upgrade pip setuptools
  72   - pip install --upgrade packaging
  73   - pip install --no-cache-dir --upgrade --no-binary ":all:" --force-reinstall networkx mpi4py MarkupSafe
  74   - pip install pytest numpy networkx sphinx sphinx_rtd_theme
  75
  76 script:
  77   - source $HOME/install/gromacs_2019/bin/GMXRC && ./ci_scripts/pygmx_0_0_7.sh
  78   - ./ci_scripts/sample_restraint.sh
  79 # Need to update infrastructure for new CMake version requirements to build against devel.
  80 #  - |
  81 #    if [ "${TRAVIS_BRANCH}" != master ] ; then
  82 #      source $HOME/install/gromacs_devel/bin/GMXRC
  83 #      ./ci_scripts/pygmx_devel.sh
  84 #      ./ci_scripts/sample_restraint.sh
  85 #    fi