docs/release-notes/2022/major/portability.rst

   1 Portability
   2 ^^^^^^^^^^^
   3
   4 Intel classic compiler (icc/icpc) no longer supported
   5 """"""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""
   6
   7 We now support the Intel clang-based compiler from oneAPI (icx/icpx)
   8 instead. Please use it, or gcc.
   9
  10 :issue:`3893`
  11
  12 Provisional: Initialize GMX_INSTALL_NBLIB_API and GMXAPI build options from BUILD_SHARED_LIBS
  13 """""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""""
  14
  15 CMake options ``GMXAPI`` and ``GMX_INSTALL_NBLIB_API`` produce shared object libraries,
  16 so their default values are now initialized from ``BUILD_SHARED_LIBS``.
  17 Pending movement on :issue:`3605` and related issues, the coupling between these
  18 options is subject to change, but users generally should not need to manually set
  19 ``GMXAPI`` and ``GMX_INSTALL_NBLIB_API``.
  20
  21 :issue:`4053`
  22
  23 Updates to pybind11 dependency
  24 """"""""""""""""""""""""""""""
  25
  26 pybind11 is no longer bundled with |Gromacs|.
  27
  28 The gmxapi 0.3 Python package build system relies on PEP 517/518 build requirements to get pybind11 header
  29 dependencies through the Python packaging system. Package managers like ``pip`` will download dependencies
  30 automatically. Package managers that do not automatically fulfill dependencies should still report the missing
  31 dependency to the user.
  32
  33 The ``sample_restraint`` sample project
  34 (bundled in ``python_packaging/sample_restraint``)
  35 still has a primitive CMake-only build procedure.
  36 If you fork a project from this source, you may choose to modernize the build system (similarly to that of
  37 ``gmxapi``) or to bundle the pybind11 sources.
  38 Within the GROMACS repository, the ``sample_restraint`` option default is now ``GMXAPI_EXTENSION_DOWNLOAD_PYBIND=ON``.
  39
  40 :issue:`4092`
  41
  42 Bundle muparser
  43 """""""""""""""
  44
  45 |Gromacs| now bundles MuParser version 2.3. It is also possible
  46 to link to an external provided library.