0077a8ed0175a45e21bd3152b72224fdedec0e60
[alexxy/gromacs.git] / docs / old-html / online / trj.html
1 <title>trj file format</title>
2 <h3>Description</h3>
3 Files with the trj file extension contain the trajectory of a simulation. 
4 In this file all the coordinates, velocities, forces and energies are 
5 printed as you told GROMACS in your mdp file. This file is in binary 
6 format an can be read with <a href="../programs/gmx-dump.html">gmx dump</a>.
7 <PRE>
8 % <a href="../programs/gmx-dump.html">gmx dump</a> -f traj.trj
9 </PRE>
10 or if you're not such a fast reader:
11 <PRE>
12 % gmxdump -f traj.trj | more
13 </PRE>
14
15 <p>
16 You can also get a quick look in the contents of the file (number of 
17 frames etc.) using:
18 <PRE>
19 % <a href="../programs/gmx-check.html">gmx check</a> -f traj.trj
20 </PRE>