c7bd01ab359d85347b799473abe79849377a5cd9
[alexxy/gromacs.git] / docs / doxygen / directories.cpp
1 /*!
2 \internal \file
3 \brief
4 Doxygen documentation file for directories in the source tree.
5
6 \author Teemu Murtola <teemu.murtola@gmail.com>
7 */
8
9 /*!
10 \libinternal
11 \dir doxygen
12 \brief Doxygen build system and general documentation content.
13  */
14
15 /*!
16 \dir src
17 \brief Main source code directory.
18  */
19
20 /*!
21 \dir src/gromacs
22 \brief Source code for building the `libgromacs` library.
23  */
24
25 /*!
26 \dir src/gromacs/analysisdata
27 \brief \ref module_analysisdata
28
29 \ingroup module_analysisdata
30  */
31 /*! \libinternal
32 \dir src/gromacs/analysisdata/tests
33 \brief Unit tests for \ref module_analysisdata
34
35 \ingroup module_analysisdata
36  */
37
38 /*!
39 \dir src/gromacs/commandline
40 \brief \ref module_commandline
41
42 \ingroup module_commandline
43  */
44 /*! \libinternal
45 \dir src/gromacs/commandline/tests
46 \brief Unit tests for \ref module_commandline
47
48 \ingroup module_commandline
49  */
50
51 /*! \libinternal
52 \dir src/gromacs/onlinehelp
53 \brief \ref module_onlinehelp
54
55 \ingroup module_onlinehelp
56  */
57 /*! \libinternal
58 \dir src/gromacs/onlinehelp/tests
59 \brief Unit tests for \ref module_onlinehelp
60
61 \ingroup module_onlinehelp
62  */
63
64 /*!
65 \dir src/gromacs/options
66 \brief \ref module_options
67
68 \ingroup module_options
69  */
70 /*! \libinternal
71 \dir src/gromacs/options/tests
72 \brief Unit tests for \ref module_options
73
74 \ingroup module_options
75  */
76
77 /*!
78 \dir src/gromacs/selection
79 \brief \ref module_selection
80
81 \ingroup module_selection
82  */
83 /*! \libinternal
84 \dir src/gromacs/selection/tests
85 \brief Unit tests for \ref module_selection
86
87 \ingroup module_selection
88  */
89
90 /*! \libinternal
91 \dir src/gromacs/simd
92 \brief \ref module_simd
93
94 \ingroup module_simd
95  */
96 /*! \libinternal
97 \dir src/gromacs/simd/tests
98 \brief Unit tests for \ref module_simd
99
100 \ingroup module_simd
101  */
102
103 /*!
104 \dir src/gromacs/trajectoryanalysis
105 \brief \ref module_trajectoryanalysis
106
107 \ingroup module_trajectoryanalysis
108  */
109 /*! \libinternal
110 \dir src/gromacs/trajectoryanalysis/tests
111 \brief Unit tests for \ref module_trajectoryanalysis
112
113 \ingroup module_trajectoryanalysis
114  */
115
116 /*!
117 \dir src/gromacs/utility
118 \brief \ref module_utility
119
120 \ingroup module_utility
121  */
122 /*! \libinternal
123 \dir src/gromacs/utility/tests
124 \brief Unit tests for \ref module_utility
125
126 \ingroup module_utility
127  */
128
129 /*!
130 \libinternal
131 \dir src/programs
132 \brief Source code for building executables, see \ref page_wrapperbinary.
133  */
134 /*!
135 \libinternal
136 \dir src/programs/mdrun
137 \brief Source code specific to `mdrun`.
138  */
139 /*!
140 \libinternal
141 \dir src/programs/view
142 \brief Source code specific to `gmx view`, including all X11-dependent code.
143  */
144
145 /*!
146 \libinternal
147 \dir src/testutils
148 \brief \ref module_testutils
149
150 \ingroup module_testutils
151  */
152
153 /*!
154 \libinternal
155 \dir src/testutils/tests
156 \brief Unit tests for \ref module_testutils
157
158 \ingroup module_testutils
159  */
160
161 /*!
162 \dir share
163 \brief Directory that contains installed data files.
164  */
165 /*!
166 \dir share/template
167 \brief Template code for writing analysis programs.
168  */
169
170 /*!
171 \file share/template/template.cpp
172 \brief Template code for writing analysis programs.
173
174 See \ref page_analysistemplate for more information.
175  */
176
177 /*!
178 \example template.cpp
179 \brief Template code for writing analysis programs.
180
181 See \ref page_analysistemplate for more information.
182  */