biod.pnpi.spb.ru
/
alexxy
/
gromacs.git
/ tree
commit
grep
author
committer
pickaxe
?
search:
re
summary
|
shortlog
|
log
|
commit
|
commitdiff
| tree
history
|
HEAD
|
snapshot
Merge release-5-0 into release-5-1
[alexxy/gromacs.git]
/
src
/
gromacs
/
mdlib
/
drwxr-xr-x
..
-rw-r--r--
2099
CMakeLists.txt
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
19786
adress.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
8768
adress.h
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
24683
broadcaststructs.cpp
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
41963
calc_verletbuf.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
4055
calc_verletbuf.h
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
3627
calcmu.cpp
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
8041
calcvir.cpp
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
87932
clincs.cpp
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
5278
compute_io.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
2187
compute_io.h
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
44725
constr.cpp
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
52951
coupling.cpp
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
20369
csettle.cpp
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
8566
ebin.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
47451
expanded.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
32866
force.cpp
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
2300
forcerec-threading.h
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
111101
forcerec.cpp
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
56292
genborn.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
34218
genborn_allvsall.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
3264
genborn_allvsall.h
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
115317
genborn_allvsall_sse2_double.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
3676
genborn_allvsall_sse2_double.h
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
185920
genborn_allvsall_sse2_single.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
3676
genborn_allvsall_sse2_single.h
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
34417
genborn_sse2_double.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
2619
genborn_sse2_double.h
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
63192
genborn_sse2_single.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
2590
genborn_sse2_single.h
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
13557
groupcoord.cpp
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
10341
groupcoord.h
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
26180
md_support.cpp
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
13839
mdatom.cpp
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
53104
mdebin.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
23519
mdebin_bar.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
8912
mdebin_bar.h
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
4632
mdrun_signalling.cpp
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
4327
mdrun_signalling.h
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
96530
minimize.cpp
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
4383
nb_verlet.h
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
53850
nbnxn_atomdata.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
5220
nbnxn_atomdata.h
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
4348
nbnxn_consts.h
blob
|
history
|
raw
drwxr-xr-x
-
nbnxn_cuda
tree
|
history
-rw-r--r--
4238
nbnxn_gpu.h
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
5636
nbnxn_gpu_data_mgmt.h
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
2283
nbnxn_gpu_jit_support.h
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
2135
nbnxn_gpu_types.h
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
12230
nbnxn_internal.h
blob
|
history
|
raw
drwxr-xr-x
-
nbnxn_kernels
tree
|
history
drwxr-xr-x
-
nbnxn_ocl
tree
|
history
-rw-r--r--
13599
nbnxn_pairlist.h
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
194319
nbnxn_search.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
6135
nbnxn_search.h
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
9133
nbnxn_search_simd_2xnn.h
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
10782
nbnxn_search_simd_4xn.h
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
3275
nbnxn_simd.h
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
94425
ns.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
27007
nsgrid.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
15456
perf_est.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
10054
qm_gamess.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
33962
qm_gaussian.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
7974
qm_mopac.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
15511
qm_orca.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
41207
qmmm.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
10233
rf_util.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
21414
shakef.cpp
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
40811
shellfc.cpp
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
95731
sim_util.cpp
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
12206
stat.cpp
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
53543
tables.c
blob
|
history
|
raw
drwxr-xr-x
-
tests
tree
|
history
-rw-r--r--
9912
tgroup.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
30871
tpi.cpp
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
70185
update.cpp
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
12906
vcm.cpp
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
60779
vsite.cpp
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
12494
wall.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
6606
wnblist.c
blob
|
history
|
raw