biod.pnpi.spb.ru
/
alexxy
/
gromacs.git
/ tree
commit
grep
author
committer
pickaxe
?
search:
re
summary
|
shortlog
|
log
|
commit
|
commitdiff
| tree
history
|
HEAD
|
snapshot
Merge release-4-6 into master
[alexxy/gromacs.git]
/
src
/
gromacs
/
mdlib
/
drwxr-xr-x
..
-rw-r--r--
404
CMakeLists.txt
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
19285
adress.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
8306
adress.h
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
3161
calcmu.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
7365
calcvir.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
53352
clincs.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
44442
constr.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
56949
coupling.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
21262
csettle.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
300663
domdec.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
8534
domdec_box.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
46519
domdec_con.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
8125
domdec_network.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
22430
domdec_setup.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
79001
domdec_top.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
8194
ebin.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
108895
edsam.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
8663
ewald.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
46787
expanded.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
42145
fft5d.cpp
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
4518
fft5d.h
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
31755
force.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
94247
forcerec.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
58853
genborn.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
34082
genborn_allvsall.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
3016
genborn_allvsall.h
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
115100
genborn_allvsall_sse2_double.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
3304
genborn_allvsall_sse2_double.h
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
185701
genborn_allvsall_sse2_single.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
3304
genborn_allvsall_sse2_single.h
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
34282
genborn_sse2_double.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
2278
genborn_sse2_double.h
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
62931
genborn_sse2_single.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
2248
genborn_sse2_single.h
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
8353
gmx_fft.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
12168
gmx_fft_fftpack.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
18374
gmx_fft_fftw3.cpp
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
17012
gmx_fft_mkl.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
5912
gmx_parallel_3dfft.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
23321
gmx_wallcycle.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
12615
groupcoord.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
9322
groupcoord.h
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
5945
init.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
9103
iteratedconstraints.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
25240
md_support.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
11712
mdatom.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
51993
mdebin.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
23167
mdebin_bar.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
8549
mdebin_bar.h
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
91455
minimize.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
9612
mvxvf.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
41101
nbnxn_atomdata.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
4700
nbnxn_atomdata.h
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
3710
nbnxn_consts.h
blob
|
history
|
raw
drwxr-xr-x
-
nbnxn_cuda
tree
|
history
-rw-r--r--
10306
nbnxn_internal.h
blob
|
history
|
raw
drwxr-xr-x
-
nbnxn_kernels
tree
|
history
-rw-r--r--
162617
nbnxn_search.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
5602
nbnxn_search.h
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
9112
nbnxn_search_simd_2xnn.h
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
10937
nbnxn_search_simd_4xn.h
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
4329
nlistheuristics.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
97390
ns.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
27256
nsgrid.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
28557
partdec.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
12762
perf_est.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
141940
pme.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
18346
pme_pp.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
10768
pme_sse_single.h
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
41312
pull.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
144541
pull_rotation.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
16272
pullutil.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
9522
qm_gamess.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
33450
qm_gaussian.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
7453
qm_mopac.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
15247
qm_orca.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
40589
qmmm.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
9716
rf_util.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
16453
shakef.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
39806
shellfc.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
88474
sim_util.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
21782
stat.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
45476
tables.c
blob
|
history
|
raw
drwxr-xr-x
-
tests
tree
|
history
-rw-r--r--
8852
tgroup.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
29216
tpi.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
67756
update.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
12428
vcm.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
64092
vsite.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
12028
wall.c
blob
|
history
|
raw
-rw-r--r--
5995
wnblist.c
blob
|
history
|
raw