Code beautification with uncrustify
[alexxy/gromacs.git] / src / tools / hxprops.h
index 6cee6965215c42d24c688c147c7e74aa8d99452e..48152b03066b22c5ffca592b87d53a905204fb1b 100644 (file)
@@ -1,11 +1,11 @@
 /*
- * 
+ *
  *                This source code is part of
- * 
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  *                 G   R   O   M   A   C   S
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  *          GROningen MAchine for Chemical Simulations
- * 
+ *
  *                        VERSION 3.2.0
  * Written by David van der Spoel, Erik Lindahl, Berk Hess, and others.
  * Copyright (c) 1991-2000, University of Groningen, The Netherlands.
  * modify it under the terms of the GNU General Public License
  * as published by the Free Software Foundation; either version 2
  * of the License, or (at your option) any later version.
- * 
+ *
  * If you want to redistribute modifications, please consider that
  * scientific software is very special. Version control is crucial -
  * bugs must be traceable. We will be happy to consider code for
  * inclusion in the official distribution, but derived work must not
  * be called official GROMACS. Details are found in the README & COPYING
  * files - if they are missing, get the official version at www.gromacs.org.
- * 
+ *
  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  * the papers on the package - you can find them in the top README file.
- * 
+ *
  * For more info, check our website at http://www.gromacs.org
- * 
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  * And Hey:
  * Green Red Orange Magenta Azure Cyan Skyblue
  */
 
 
 typedef struct {
-  real phi,psi,pprms2;
-  real jcaha;
-  real d3,d4,d5,rmsa;
-  gmx_bool bHelix;
-  int  nhx;
-  int  nrms,resno;
-  int  Cprev,N,H,CA,C,O,Nnext;
-  char label[32];
+    real     phi, psi, pprms2;
+    real     jcaha;
+    real     d3, d4, d5, rmsa;
+    gmx_bool bHelix;
+    int      nhx;
+    int      nrms, resno;
+    int      Cprev, N, H, CA, C, O, Nnext;
+    char     label[32];
 } t_bb;
 
-enum { 
-  efhRAD,  efhTWIST, efhRISE, efhLEN,  
-  efhDIP,  efhRMS,   efhRMSA, efhCD222,
-  efhPPRMS,efhCPHI,  efhPHI,  efhPSI,  
-  efhHB3,  efhHB4,   efhHB5,  efhJCA,
-  efhAHX,  efhNR 
+enum {
+    efhRAD,  efhTWIST, efhRISE, efhLEN,
+    efhDIP,  efhRMS,   efhRMSA, efhCD222,
+    efhPPRMS, efhCPHI,  efhPHI,  efhPSI,
+    efhHB3,  efhHB4,   efhHB5,  efhJCA,
+    efhAHX,  efhNR
 };
 
-extern real ahx_len(int gnx,atom_id index[],rvec x[],matrix box);
+extern real ahx_len(int gnx, atom_id index[], rvec x[], matrix box);
 /* Assume we have a list of Calpha atoms only! */
 
-extern real ellipticity(int nres,t_bb bb[]);
+extern real ellipticity(int nres, t_bb bb[]);
 
-extern real radius(FILE *fp,int nca,atom_id ca_index[],rvec x[]);
+extern real radius(FILE *fp, int nca, atom_id ca_index[], rvec x[]);
 /* Assume we have calphas */
 
-extern real twist(FILE *fp,int nca,atom_id caindex[],rvec x[]);
+extern real twist(FILE *fp, int nca, atom_id caindex[], rvec x[]);
 /* Calculate the twist of the helix */
 
-extern real pprms(FILE *fp,int nbb,t_bb bb[]);
+extern real pprms(FILE *fp, int nbb, t_bb bb[]);
 /* Calculate the average RMS from canonical phi/psi values
  * and the distance per residue
  */
-extern real ca_phi(int gnx,atom_id index[],rvec x[],matrix box);
+
+extern real ca_phi(int gnx, atom_id index[], rvec x[], matrix box);
 /* Assume we have a list of Calpha atoms only! */
 
-extern real dip(int nbb,atom_id bbind[],rvec x[],t_atom atom[]);
+extern real dip(int nbb, atom_id bbind[], rvec x[], t_atom atom[]);
 
-extern real rise(int gnx,atom_id index[],rvec x[]);
+extern real rise(int gnx, atom_id index[], rvec x[]);
 /* Assume we have a list of Calpha atoms only! */
 
-extern void av_hblen(FILE *fp3,FILE *fp3a,
-                    FILE *fp4,FILE *fp4a,
-                    FILE *fp5,FILE *fp5a,
-                    real t,int nres,t_bb bb[]);
-                    
-extern void av_phipsi(FILE *fphi,FILE *fpsi,FILE *fphi2,FILE *fpsi2,
-                     real t,int nres,t_bb bb[]);
-
-extern t_bb *mkbbind(const char *fn,int *nres,int *nbb,int res0,
-                    int *nall,atom_id **index,
-                    char ***atomname,t_atom atom[],
-                    t_resinfo *resinfo);
-                    
-extern void do_start_end(int nres,t_bb bb[],rvec x[],int *nbb,
-                        atom_id bbindex[],int *nca,atom_id caindex[],
-                        gmx_bool bRange,int rStart,int rEnd);
-                    
-extern void calc_hxprops(int nres,t_bb bb[],rvec x[],matrix box);
-
-extern void pr_bb(FILE *fp,int nres,t_bb bb[]);
+extern void av_hblen(FILE *fp3, FILE *fp3a,
+                     FILE *fp4, FILE *fp4a,
+                     FILE *fp5, FILE *fp5a,
+                     real t, int nres, t_bb bb[]);
+
+extern void av_phipsi(FILE *fphi, FILE *fpsi, FILE *fphi2, FILE *fpsi2,
+                      real t, int nres, t_bb bb[]);
+
+extern t_bb *mkbbind(const char *fn, int *nres, int *nbb, int res0,
+                     int *nall, atom_id **index,
+                     char ***atomname, t_atom atom[],
+                     t_resinfo *resinfo);
+
+extern void do_start_end(int nres, t_bb bb[], rvec x[], int *nbb,
+                         atom_id bbindex[], int *nca, atom_id caindex[],
+                         gmx_bool bRange, int rStart, int rEnd);
+
+extern void calc_hxprops(int nres, t_bb bb[], rvec x[], matrix box);
+
+extern void pr_bb(FILE *fp, int nres, t_bb bb[]);
 
 #endif