Code beautification with uncrustify
[alexxy/gromacs.git] / src / gromacs / mdlib / nbnxn_search.h
index ddd87698318091eaad12cc9ffa7cf9c032bb03fe..e97218213ea16da5ab1df2a2d126c283ba84f9b8 100644 (file)
@@ -54,13 +54,13 @@ gmx_bool nbnxn_kernel_pairlist_simple(int nb_kernel_type);
 /* Due to the cluster size the effective pair-list is longer than
  * that of a simple atom pair-list. This function gives the extra distance.
  */
-real nbnxn_get_rlist_effective_inc(int cluster_size,real atom_density);
+real nbnxn_get_rlist_effective_inc(int cluster_size, real atom_density);
 
 /* Allocates and initializes a pair search data structure */
-void nbnxn_init_search(nbnxn_search_t * nbs_ptr,
-                       ivec *n_dd_cells,
+void nbnxn_init_search(nbnxn_search_t    * nbs_ptr,
+                       ivec               *n_dd_cells,
                        gmx_domdec_zones_t *zones,
-                       int nthread_max);
+                       int                 nthread_max);
 
 /* Put the atoms on the pair search grid.
  * Only atoms a0 to a1 in x are put on the grid.
@@ -72,14 +72,14 @@ void nbnxn_init_search(nbnxn_search_t * nbs_ptr,
  * Without domain decomposition move will be NULL.
  */
 void nbnxn_put_on_grid(nbnxn_search_t nbs,
-                       int ePBC,matrix box,
+                       int ePBC, matrix box,
                        int dd_zone,
-                       rvec corner0,rvec corner1,
-                       int a0,int a1,
+                       rvec corner0, rvec corner1,
+                       int a0, int a1,
                        real atom_density,
                        const int *atinfo,
                        rvec *x,
-                       int nmoved,int *move,
+                       int nmoved, int *move,
                        int nb_kernel_type,
                        nbnxn_atomdata_t *nbat);
 
@@ -87,22 +87,22 @@ void nbnxn_put_on_grid(nbnxn_search_t nbs,
  * with domain decomposition. Should be called after calling
  * nbnxn_search_put_on_grid for the local atoms / home zone.
  */
-void nbnxn_put_on_grid_nonlocal(nbnxn_search_t nbs,
+void nbnxn_put_on_grid_nonlocal(nbnxn_search_t            nbs,
                                 const gmx_domdec_zones_t *zones,
-                                const int *atinfo,
-                                rvec *x,
-                               int nb_kernel_type,
-                                nbnxn_atomdata_t *nbat);
+                                const int                *atinfo,
+                                rvec                     *x,
+                                int                       nb_kernel_type,
+                                nbnxn_atomdata_t         *nbat);
 
 /* Add simple grid type information to the local super/sub grid */
-void nbnxn_grid_add_simple(nbnxn_search_t nbs,
-                          nbnxn_atomdata_t *nbat);
+void nbnxn_grid_add_simple(nbnxn_search_t    nbs,
+                           nbnxn_atomdata_t *nbat);
 
 /* Return the number of x and y cells in the local grid */
-void nbnxn_get_ncells(nbnxn_search_t nbs,int *ncx,int *ncy);
+void nbnxn_get_ncells(nbnxn_search_t nbs, int *ncx, int *ncy);
 
 /* Return the order indices *a of the atoms on the ns grid, size n */
-void nbnxn_get_atomorder(nbnxn_search_t nbs,int **a,int *n);
+void nbnxn_get_atomorder(nbnxn_search_t nbs, int **a, int *n);
 
 /* Renumber the atom indices on the grid to consecutive order */
 void nbnxn_set_atomorder(nbnxn_search_t nbs);
@@ -119,15 +119,15 @@ void nbnxn_init_pairlist_set(nbnxn_pairlist_set_t *nbl_list,
  * When set >0 ci lists will be chopped up when the estimate
  * for the number of equally sized lists is below min_ci_balanced.
  */
-void nbnxn_make_pairlist(const nbnxn_search_t nbs,
-                         nbnxn_atomdata_t *nbat,
-                         const t_blocka *excl,
-                         real rlist,
-                         int min_ci_balanced,
+void nbnxn_make_pairlist(const nbnxn_search_t  nbs,
+                         nbnxn_atomdata_t     *nbat,
+                         const t_blocka       *excl,
+                         real                  rlist,
+                         int                   min_ci_balanced,
                          nbnxn_pairlist_set_t *nbl_list,
-                         int iloc,
-                         int nb_kernel_type,
-                         t_nrnb *nrnb);
+                         int                   iloc,
+                         int                   nb_kernel_type,
+                         t_nrnb               *nrnb);
 
 #ifdef __cplusplus
 }