Code beautification with uncrustify
[alexxy/gromacs.git] / src / gromacs / legacyheaders / ns.h
index 1b40338e3ea940f37432100aa1bdd4e79b6321a2..0bc190fb38c82504e83a2107f85cf2634bb15e3d 100644 (file)
@@ -1,11 +1,11 @@
 /*
- * 
+ *
  *                This source code is part of
- * 
+ *
  *                 G   R   O   M   A   C   S
- * 
+ *
  *          GROningen MAchine for Chemical Simulations
- * 
+ *
  *                        VERSION 3.2.0
  * Written by David van der Spoel, Erik Lindahl, Berk Hess, and others.
  * Copyright (c) 1991-2000, University of Groningen, The Netherlands.
  * modify it under the terms of the GNU General Public License
  * as published by the Free Software Foundation; either version 2
  * of the License, or (at your option) any later version.
- * 
+ *
  * If you want to redistribute modifications, please consider that
  * scientific software is very special. Version control is crucial -
  * bugs must be traceable. We will be happy to consider code for
  * inclusion in the official distribution, but derived work must not
  * be called official GROMACS. Details are found in the README & COPYING
  * files - if they are missing, get the official version at www.gromacs.org.
- * 
+ *
  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  * the papers on the package - you can find them in the top README file.
- * 
+ *
  * For more info, check our website at http://www.gromacs.org
- * 
+ *
  * And Hey:
  * Gromacs Runs On Most of All Computer Systems
  */
@@ -54,15 +54,15 @@ extern "C" {
  *
  ****************************************************/
 
-void init_neighbor_list(FILE *log,t_forcerec *fr,int homenr);
-/* 
+void init_neighbor_list(FILE *log, t_forcerec *fr, int homenr);
+/*
  * nn is the number of energy terms in the energy matrix
  * (ngener*(ngener-1))/2
  * start is the first atom on this processor
  * homenr is the number of atoms on this processor
  */
-int calc_naaj(int icg,int cgtot);
+
+int calc_naaj(int icg, int cgtot);
 /* Calculate the number of charge groups to interact with for icg */
 
 /****************************************************
@@ -72,35 +72,35 @@ int calc_naaj(int icg,int cgtot);
  *    Calls either ns5_core (when grid selected in .mdp file)
  *    or ns_simple_core (when simple selected in .mdp file)
  *
- *    Return total number of pairs searched 
+ *    Return total number of pairs searched
  *
  ****************************************************/
-void init_ns(FILE *fplog,const t_commrec *cr,
-                   gmx_ns_t *ns,t_forcerec *fr,
-                   const gmx_mtop_t *mtop,
-                   matrix box);
-
-int search_neighbours(FILE *log,t_forcerec *fr,
-                            rvec x[],matrix box,
-                            gmx_localtop_t *top,
-                            gmx_groups_t *groups,
-                            t_commrec *cr,
-                            t_nrnb *nrnb,t_mdatoms *md,
-                            real *lambda,real *dvdlambda,
-                            gmx_grppairener_t *grppener,
-                            gmx_bool bFillGrid,
-                            gmx_bool bDoLongRangeNS,
-                 gmx_bool bPadListsForKernels);
+void init_ns(FILE *fplog, const t_commrec *cr,
+             gmx_ns_t *ns, t_forcerec *fr,
+             const gmx_mtop_t *mtop,
+             matrix box);
+
+int search_neighbours(FILE *log, t_forcerec *fr,
+                      rvec x[], matrix box,
+                      gmx_localtop_t *top,
+                      gmx_groups_t *groups,
+                      t_commrec *cr,
+                      t_nrnb *nrnb, t_mdatoms *md,
+                      real *lambda, real *dvdlambda,
+                      gmx_grppairener_t *grppener,
+                      gmx_bool bFillGrid,
+                      gmx_bool bDoLongRangeNS,
+                      gmx_bool bPadListsForKernels);
+
 
 /* Debugging routines from wnblist.c */
-void dump_nblist(FILE *out,t_commrec *cr,t_forcerec *fr,int nDNL);
+void dump_nblist(FILE *out, t_commrec *cr, t_forcerec *fr, int nDNL);
 
-int read_nblist(FILE *in,FILE *out,int **mat,int natoms,gmx_bool bSymm);
+int read_nblist(FILE *in, FILE *out, int **mat, int natoms, gmx_bool bSymm);
 /* Returns total number of neighbors. If bSymm the matrix is symmetrized. */
 
-int natoms_beyond_ns_buffer(t_inputrec *ir,t_forcerec *fr,t_block *cgs,
-                                  matrix scale_tot,rvec *x);
+int natoms_beyond_ns_buffer(t_inputrec *ir, t_forcerec *fr, t_block *cgs,
+                            matrix scale_tot, rvec *x);
 /* Returns the number of atoms that moved beyond the ns buffer */
 
 #ifdef __cplusplus
@@ -108,4 +108,4 @@ int natoms_beyond_ns_buffer(t_inputrec *ir,t_forcerec *fr,t_block *cgs,
 #endif
 
 
-#endif /* _ns_h */
+#endif  /* _ns_h */