Code beautification with uncrustify
[alexxy/gromacs.git] / src / gromacs / legacyheaders / md_support.h
index 9e1a99330c0be701cc893c5b630773081675ffd0..47bb882eeda764acf7160db5769060bf28992487 100644 (file)
@@ -1,11 +1,11 @@
 /*
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  *                This source code is part of
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  *                 G   R   O   M   A   C   S
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  *          GROningen MAchine for Chemical Simulations
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  *                        VERSION 3.2.0
  * Written by David van der Spoel, Erik Lindahl, Berk Hess, and others.
  * Copyright (c) 1991-2000, University of Groningen, The Netherlands.
  * modify it under the terms of the GNU General Public License
  * as published by the Free Software Foundation; either version 2
  * of the License, or (at your option) any later version.
- * 
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  * If you want to redistribute modifications, please consider that
  * scientific software is very special. Version control is crucial -
  * bugs must be traceable. We will be happy to consider code for
  * inclusion in the official distribution, but derived work must not
  * be called official GROMACS. Details are found in the README & COPYING
  * files - if they are missing, get the official version at www.gromacs.org.
- * 
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  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  * the papers on the package - you can find them in the top README file.
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  * For more info, check our website at http://www.gromacs.org
- * 
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  * And Hey:
  * Gromacs Runs On Most of All Computer Systems
  */
@@ -76,59 +76,59 @@ extern "C" {
 
 
 /* return the number of steps between global communcations */
-int check_nstglobalcomm(FILE *fplog,t_commrec *cr,
-                        int nstglobalcomm,t_inputrec *ir);
+int check_nstglobalcomm(FILE *fplog, t_commrec *cr,
+                        int nstglobalcomm, t_inputrec *ir);
 
 /* check whether an 'nst'-style parameter p is a multiple of nst, and
    set it to be one if not, with a warning. */
-void check_nst_param(FILE *fplog,t_commrec *cr,
-                     const char *desc_nst,int nst,
-                     const char *desc_p,int *p);
+void check_nst_param(FILE *fplog, t_commrec *cr,
+                     const char *desc_nst, int nst,
+                     const char *desc_p, int *p);
 
 /* check which of the multisim simulations has the shortest number of
    steps and return that number of nsteps */
 gmx_large_int_t get_multisim_nsteps(const t_commrec *cr,
-                                    gmx_large_int_t nsteps);
+                                    gmx_large_int_t  nsteps);
 
-void rerun_parallel_comm(t_commrec *cr,t_trxframe *fr,
+void rerun_parallel_comm(t_commrec *cr, t_trxframe *fr,
                          gmx_bool *bNotLastFrame);
 
 /* get the conserved energy associated with the ensemble type*/
-real compute_conserved_from_auxiliary(t_inputrec *ir, t_state *state,           
+real compute_conserved_from_auxiliary(t_inputrec *ir, t_state *state,
                                       t_extmass *MassQ);
 
 /* set the lambda values at each step of mdrun when they change */
 void set_current_lambdas(gmx_large_int_t step, t_lambda *fepvals, gmx_bool bRerunMD,
                          t_trxframe *rerun_fr, t_state *state_global, t_state *state, double lam0[]);
 
-int multisim_min(const gmx_multisim_t *ms,int nmin,int n);
+int multisim_min(const gmx_multisim_t *ms, int nmin, int n);
 /* Set an appropriate value for n across the whole multi-simulation */
 
 int multisim_nstsimsync(const t_commrec *cr,
-                       const t_inputrec *ir,int repl_ex_nst);
+                        const t_inputrec *ir, int repl_ex_nst);
 /* Determine the interval for inter-simulation communication */
-                                  
-void init_global_signals(globsig_t *gs,const t_commrec *cr,
-                        const t_inputrec *ir,int repl_ex_nst);
+
+void init_global_signals(globsig_t *gs, const t_commrec *cr,
+                         const t_inputrec *ir, int repl_ex_nst);
 /* Constructor for globsig_t */
 
-void copy_coupling_state(t_state *statea,t_state *stateb,
-                        gmx_ekindata_t *ekinda,gmx_ekindata_t *ekindb, t_grpopts* opts);
+void copy_coupling_state(t_state *statea, t_state *stateb,
+                         gmx_ekindata_t *ekinda, gmx_ekindata_t *ekindb, t_grpopts* opts);
 /* Copy stuff from state A to state B */
 
 void compute_globals(FILE *fplog, gmx_global_stat_t gstat, t_commrec *cr, t_inputrec *ir,
-                    t_forcerec *fr, gmx_ekindata_t *ekind,
-                    t_state *state, t_state *state_global, t_mdatoms *mdatoms,
-                    t_nrnb *nrnb, t_vcm *vcm, gmx_wallcycle_t wcycle,
-                    gmx_enerdata_t *enerd,tensor force_vir, tensor shake_vir, tensor total_vir,
-                    tensor pres, rvec mu_tot, gmx_constr_t constr,
-                    globsig_t *gs,gmx_bool bInterSimGS,
-                    matrix box, gmx_mtop_t *top_global, real *pcurr,
-                    int natoms, gmx_bool *bSumEkinhOld, int flags);
+                     t_forcerec *fr, gmx_ekindata_t *ekind,
+                     t_state *state, t_state *state_global, t_mdatoms *mdatoms,
+                     t_nrnb *nrnb, t_vcm *vcm, gmx_wallcycle_t wcycle,
+                     gmx_enerdata_t *enerd, tensor force_vir, tensor shake_vir, tensor total_vir,
+                     tensor pres, rvec mu_tot, gmx_constr_t constr,
+                     globsig_t *gs, gmx_bool bInterSimGS,
+                     matrix box, gmx_mtop_t *top_global, real *pcurr,
+                     int natoms, gmx_bool *bSumEkinhOld, int flags);
 /* Compute global variables during integration */
 
 #ifdef __cplusplus
 }
 #endif
 
-#endif /* _md_support_h */
+#endif  /* _md_support_h */