Sort all includes in src/gromacs
[alexxy/gromacs.git] / src / gromacs / gmxpreprocess / topshake.c
index cee95306e8f63e36ac681063503a1dd07dafdfb2..bd2662df2ad09d93914160f2a698f7c199a1dec8 100644 (file)
@@ -3,7 +3,7 @@
  *
  * Copyright (c) 1991-2000, University of Groningen, The Netherlands.
  * Copyright (c) 2001-2004, The GROMACS development team.
- * Copyright (c) 2013, by the GROMACS development team, led by
+ * Copyright (c) 2013,2014, by the GROMACS development team, led by
  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  */
 /* This file is completely threadsafe - keep it that way! */
-#ifdef HAVE_CONFIG_H
-#include <config.h>
-#endif
-
-#include <ctype.h>
+#include "gmxpre.h"
 
-#include "sysstuff.h"
-#include "physics.h"
-#include "macros.h"
-#include "readir.h"
-#include "typedefs.h"
 #include "topshake.h"
-#include "toppush.h"
-#include "toputil.h"
-#include "topdirs.h"
-#include "smalloc.h"
-#include "gmx_fatal.h"
+
+#include <ctype.h>
+#include <math.h>
+
+#include "gromacs/gmxpreprocess/readir.h"
+#include "gromacs/gmxpreprocess/topdirs.h"
+#include "gromacs/gmxpreprocess/toppush.h"
+#include "gromacs/gmxpreprocess/toputil.h"
+#include "gromacs/legacyheaders/typedefs.h"
+#include "gromacs/math/units.h"
+#include "gromacs/utility/fatalerror.h"
+#include "gromacs/utility/smalloc.h"
 
 static void copy_bond (t_params *pr, int to, int from)
 /* copies an entry in a bond list to another position.