Sort all includes in src/gromacs
[alexxy/gromacs.git] / src / gromacs / gmxlib / main.cpp
index 5655d288df26041e34bded3a4486e3796c2eebfc..9a3078310dfad84821c6d5c76fc25737b80e5b87 100644 (file)
  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
  */
+#include "gmxpre.h"
+
+#include "gromacs/legacyheaders/main.h"
+
 #include "config.h"
 
+#include <limits.h>
 #include <stdio.h>
 #include <stdlib.h>
 #include <string.h>
-#include <limits.h>
 #include <time.h>
 
+#ifdef GMX_NATIVE_WINDOWS
+#include <process.h>
+#endif
 #ifdef HAVE_SYS_TIME_H
 #include <sys/time.h>
 #endif
 #ifdef HAVE_UNISTD_H
 #include <unistd.h>
 #endif
-#ifdef GMX_NATIVE_WINDOWS
-#include <process.h>
-#endif
 
-#include "types/commrec.h"
-#include "network.h"
-#include "main.h"
-#include "macros.h"
-#include "gromacs/utility/futil.h"
 #include "gromacs/fileio/filenm.h"
 #include "gromacs/fileio/gmxfio.h"
-#include "copyrite.h"
-
+#include "gromacs/legacyheaders/copyrite.h"
+#include "gromacs/legacyheaders/macros.h"
+#include "gromacs/legacyheaders/network.h"
+#include "gromacs/legacyheaders/types/commrec.h"
 #include "gromacs/utility/basenetwork.h"
 #include "gromacs/utility/cstringutil.h"
 #include "gromacs/utility/exceptions.h"
 #include "gromacs/utility/fatalerror.h"
+#include "gromacs/utility/futil.h"
 #include "gromacs/utility/gmxmpi.h"
 #include "gromacs/utility/programcontext.h"
 #include "gromacs/utility/smalloc.h"
@@ -99,7 +101,7 @@ static void par_fn(char *base, int ftp, const t_commrec *cr,
     strcat(buf, ".");
 
     /* Add extension again */
-    strcat(buf, (ftp == efTPX) ? "tpr" : (ftp == efEDR) ? "edr" : ftp2ext(ftp));
+    strcat(buf, (ftp == efTPR) ? "tpr" : (ftp == efEDR) ? "edr" : ftp2ext(ftp));
     if (debug)
     {
         fprintf(debug, "rank %d par_fn '%s'\n", cr->nodeid, buf);
@@ -394,7 +396,7 @@ void init_multisystem(t_commrec *cr, int nsim, char **multidirs,
              * at the actual file name
              */
             if (is_output(&fnm[i]) ||
-                fnm[i].ftp == efTPX || fnm[i].ftp == efCPT ||
+                fnm[i].ftp == efTPR || fnm[i].ftp == efCPT ||
                 strcmp(fnm[i].opt, "-rerun") == 0)
             {
                 ftp = fn2ftp(fnm[i].fns[0]);