src/programs/grompp/convparm.c

   1 /*
   2  *
   3  *                This source code is part of
   4  *
   5  *                 G   R   O   M   A   C   S
   6  *
   7  *          GROningen MAchine for Chemical Simulations
   8  *
   9  *                        VERSION 3.2.0
  10  * Written by David van der Spoel, Erik Lindahl, Berk Hess, and others.
  11  * Copyright (c) 1991-2000, University of Groningen, The Netherlands.
  12  * Copyright (c) 2001-2004, The GROMACS development team,
  13  * check out http://www.gromacs.org for more information.
  14
  15  * This program is free software; you can redistribute it and/or
  16  * modify it under the terms of the GNU General Public License
  17  * as published by the Free Software Foundation; either version 2
  18  * of the License, or (at your option) any later version.
  19  *
  20  * If you want to redistribute modifications, please consider that
  21  * scientific software is very special. Version control is crucial -
  22  * bugs must be traceable. We will be happy to consider code for
  23  * inclusion in the official distribution, but derived work must not
  24  * be called official GROMACS. Details are found in the README & COPYING
  25  * files - if they are missing, get the official version at www.gromacs.org.
  26  *
  27  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  28  * the papers on the package - you can find them in the top README file.
  29  *
  30  * For more info, check our website at http://www.gromacs.org
  31  *
  32  * And Hey:
  33  * Gallium Rubidium Oxygen Manganese Argon Carbon Silicon
  34  */
  35 /* This file is completely threadsafe - keep it that way! */
  36 #ifdef HAVE_CONFIG_H
  37 #include <config.h>
  38 #endif
  39
  40 #include <math.h>
  41 #include "sysstuff.h"
  42 #include "physics.h"
  43 #include "vec.h"
  44 #include "smalloc.h"
  45 #include "typedefs.h"
  46 #include "gmx_fatal.h"
  47 #include "topio.h"
  48 #include "toputil.h"
  49 #include "convparm.h"
  50 #include "names.h"
  51 #include "gpp_atomtype.h"
  52 #include "maths.h"
  53
  54 static int round_check(real r, int limit, int ftype, const char *name)
  55 {
  56     int i;
  57
  58     if (r >= 0)
  59     {
  60         i = (int)(r + 0.5);
  61     }
  62     else
  63     {
  64         i = (int)(r - 0.5);
  65     }
  66
  67     if (r-i > 0.01 || r-i < -0.01)
  68     {
  69         gmx_fatal(FARGS, "A non-integer value (%f) was supplied for '%s' in %s",
  70                   r, name, interaction_function[ftype].longname);
  71     }
  72
  73     if (i < limit)
  74     {
  75         gmx_fatal(FARGS, "Value of '%s' in %s is %d, which is smaller than the minimum of %d",
  76                   name, interaction_function[ftype].longname, i, limit);
  77     }
  78
  79     return i;
  80 }
  81
  82 static void set_ljparams(int comb, double reppow, real v, real w,
  83                          real *c6, real *c12)
  84 {
  85     if (comb == eCOMB_ARITHMETIC || comb == eCOMB_GEOM_SIG_EPS)
  86     {
  87         if (v >= 0)
  88         {
  89             *c6  = 4*w*pow(v, 6.0);
  90             *c12 = 4*w*pow(v, reppow);
  91         }
  92         else
  93         {
  94             /* Interpret negative sigma as c6=0 and c12 with -sigma */
  95             *c6  = 0;
  96             *c12 = 4*w*pow(-v, reppow);
  97         }
  98     }
  99     else
 100     {
 101         *c6  = v;
 102         *c12 = w;
 103     }
 104 }
 105
 106 /* A return value of 0 means parameters were assigned successfully,
 107  * returning -1 means this is an all-zero interaction that should not be added.
 108  */
 109 static int
 110 assign_param(t_functype ftype, t_iparams *newparam,
 111              real old[MAXFORCEPARAM], int comb, double reppow)
 112 {
 113     int      i, j;
 114     real     tmp;
 115     gmx_bool all_param_zero = TRUE;
 116
 117     /* Set to zero */
 118     for (j = 0; (j < MAXFORCEPARAM); j++)
 119     {
 120         newparam->generic.buf[j] = 0.0;
 121         /* If all parameters are zero we might not add some interaction types (selected below).
 122          * We cannot apply this to ALL interactions, since many have valid reasons for having
 123          * zero parameters (e.g. an index to a Cmap interaction, or LJ parameters), but
 124          * we use it for angles and torsions that are typically generated automatically.
 125          */
 126         all_param_zero = (all_param_zero == TRUE) && fabs(old[j]) < GMX_REAL_MIN;
 127     }
 128
 129     if (all_param_zero == TRUE)
 130     {
 131         if (IS_ANGLE(ftype) || IS_RESTRAINT_TYPE(ftype) || ftype == F_IDIHS ||
 132             ftype == F_PDIHS || ftype == F_PIDIHS || ftype == F_RBDIHS || ftype == F_FOURDIHS)
 133         {
 134             return -1;
 135         }
 136     }
 137
 138     switch (ftype)
 139     {
 140         case F_G96ANGLES:
 141             /* Post processing of input data: store cosine iso angle itself */
 142             newparam->harmonic.rA  = cos(old[0]*DEG2RAD);
 143             newparam->harmonic.krA = old[1];
 144             newparam->harmonic.rB  = cos(old[2]*DEG2RAD);
 145             newparam->harmonic.krB = old[3];
 146             break;
 147         case F_G96BONDS:
 148             /* Post processing of input data: store square of length itself */
 149             newparam->harmonic.rA  = sqr(old[0]);
 150             newparam->harmonic.krA = old[1];
 151             newparam->harmonic.rB  = sqr(old[2]);
 152             newparam->harmonic.krB = old[3];
 153             break;
 154         case F_FENEBONDS:
 155             newparam->fene.bm = old[0];
 156             newparam->fene.kb = old[1];
 157             break;
 158         case F_RESTRBONDS:
 159             newparam->restraint.lowA = old[0];
 160             newparam->restraint.up1A = old[1];
 161             newparam->restraint.up2A = old[2];
 162             newparam->restraint.kA   = old[3];
 163             newparam->restraint.lowB = old[4];
 164             newparam->restraint.up1B = old[5];
 165             newparam->restraint.up2B = old[6];
 166             newparam->restraint.kB   = old[7];
 167             break;
 168         case F_TABBONDS:
 169         case F_TABBONDSNC:
 170         case F_TABANGLES:
 171         case F_TABDIHS:
 172             newparam->tab.table = round_check(old[0], 0, ftype, "table index");
 173             newparam->tab.kA    = old[1];
 174             newparam->tab.kB    = old[3];
 175             break;
 176         case F_CROSS_BOND_BONDS:
 177             newparam->cross_bb.r1e = old[0];
 178             newparam->cross_bb.r2e = old[1];
 179             newparam->cross_bb.krr = old[2];
 180             break;
 181         case F_CROSS_BOND_ANGLES:
 182             newparam->cross_ba.r1e = old[0];
 183             newparam->cross_ba.r2e = old[1];
 184             newparam->cross_ba.r3e = old[2];
 185             newparam->cross_ba.krt = old[3];
 186             break;
 187         case F_UREY_BRADLEY:
 188             newparam->u_b.thetaA  = old[0];
 189             newparam->u_b.kthetaA = old[1];
 190             newparam->u_b.r13A    = old[2];
 191             newparam->u_b.kUBA    = old[3];
 192             newparam->u_b.thetaB  = old[4];
 193             newparam->u_b.kthetaB = old[5];
 194             newparam->u_b.r13B    = old[6];
 195             newparam->u_b.kUBB    = old[7];
 196             break;
 197         case F_QUARTIC_ANGLES:
 198             newparam->qangle.theta = old[0];
 199             for (i = 0; i < 5; i++)
 200             {
 201                 newparam->qangle.c[i] = old[i+1];
 202             }
 203             break;
 204         case F_LINEAR_ANGLES:
 205             newparam->linangle.aA    = old[0];
 206             newparam->linangle.klinA = old[1];
 207             newparam->linangle.aB    = old[2];
 208             newparam->linangle.klinB = old[3];
 209             break;
 210         case F_BONDS:
 211         case F_ANGLES:
 212         case F_HARMONIC:
 213         case F_IDIHS:
 214             newparam->harmonic.rA  = old[0];
 215             newparam->harmonic.krA = old[1];
 216             newparam->harmonic.rB  = old[2];
 217             newparam->harmonic.krB = old[3];
 218             break;
 219         case F_MORSE:
 220             newparam->morse.b0A    = old[0];
 221             newparam->morse.cbA    = old[1];
 222             newparam->morse.betaA  = old[2];
 223             newparam->morse.b0B    = old[3];
 224             newparam->morse.cbB    = old[4];
 225             newparam->morse.betaB  = old[5];
 226             break;
 227         case F_CUBICBONDS:
 228             newparam->cubic.b0    = old[0];
 229             newparam->cubic.kb    = old[1];
 230             newparam->cubic.kcub  = old[2];
 231             break;
 232         case F_CONNBONDS:
 233             break;
 234         case F_POLARIZATION:
 235             newparam->polarize.alpha = old[0];
 236             break;
 237         case F_ANHARM_POL:
 238             newparam->anharm_polarize.alpha = old[0];
 239             newparam->anharm_polarize.drcut = old[1];
 240             newparam->anharm_polarize.khyp  = old[2];
 241             break;
 242         case F_WATER_POL:
 243             newparam->wpol.al_x   = old[0];
 244             newparam->wpol.al_y   = old[1];
 245             newparam->wpol.al_z   = old[2];
 246             newparam->wpol.rOH    = old[3];
 247             newparam->wpol.rHH    = old[4];
 248             newparam->wpol.rOD    = old[5];
 249             break;
 250         case F_THOLE_POL:
 251             newparam->thole.a      = old[0];
 252             newparam->thole.alpha1 = old[1];
 253             newparam->thole.alpha2 = old[2];
 254             if ((old[1] > 0) && (old[2] > 0))
 255             {
 256                 newparam->thole.rfac = old[0]*pow(old[1]*old[2], -1.0/6.0);
 257             }
 258             else
 259             {
 260                 newparam->thole.rfac = 1;
 261             }
 262             break;
 263         case F_BHAM:
 264             newparam->bham.a = old[0];
 265             newparam->bham.b = old[1];
 266             newparam->bham.c = old[2];
 267             break;
 268         case F_LJ14:
 269             set_ljparams(comb, reppow, old[0], old[1], &newparam->lj14.c6A, &newparam->lj14.c12A);
 270             set_ljparams(comb, reppow, old[2], old[3], &newparam->lj14.c6B, &newparam->lj14.c12B);
 271             break;
 272         case F_LJC14_Q:
 273             newparam->ljc14.fqq = old[0];
 274             newparam->ljc14.qi  = old[1];
 275             newparam->ljc14.qj  = old[2];
 276             set_ljparams(comb, reppow, old[3], old[4], &newparam->ljc14.c6, &newparam->ljc14.c12);
 277             break;
 278         case F_LJC_PAIRS_NB:
 279             newparam->ljcnb.qi = old[0];
 280             newparam->ljcnb.qj = old[1];
 281             set_ljparams(comb, reppow, old[2], old[3], &newparam->ljcnb.c6, &newparam->ljcnb.c12);
 282             break;
 283         case F_LJ:
 284             set_ljparams(comb, reppow, old[0], old[1], &newparam->lj.c6, &newparam->lj.c12);
 285             break;
 286         case F_PDIHS:
 287         case F_PIDIHS:
 288         case F_ANGRES:
 289         case F_ANGRESZ:
 290             newparam->pdihs.phiA = old[0];
 291             newparam->pdihs.cpA  = old[1];
 292
 293             /* Change 20100720: Amber occasionally uses negative multiplicities (mathematically OK),
 294              * so I have changed the lower limit to -99 /EL
 295              */
 296             newparam->pdihs.phiB = old[3];
 297             newparam->pdihs.cpB  = old[4];
 298             /* If both force constants are zero there is no interaction. Return -1 to signal
 299              * this entry should NOT be added.
 300              */
 301             if (fabs(newparam->pdihs.cpA) < GMX_REAL_MIN && fabs(newparam->pdihs.cpB) < GMX_REAL_MIN)
 302             {
 303                 return -1;
 304             }
 305
 306             newparam->pdihs.mult = round_check(old[2], -99, ftype, "multiplicity");
 307
 308             break;
 309         case F_POSRES:
 310             newparam->posres.fcA[XX]   = old[0];
 311             newparam->posres.fcA[YY]   = old[1];
 312             newparam->posres.fcA[ZZ]   = old[2];
 313             newparam->posres.fcB[XX]   = old[3];
 314             newparam->posres.fcB[YY]   = old[4];
 315             newparam->posres.fcB[ZZ]   = old[5];
 316             newparam->posres.pos0A[XX] = old[6];
 317             newparam->posres.pos0A[YY] = old[7];
 318             newparam->posres.pos0A[ZZ] = old[8];
 319             newparam->posres.pos0B[XX] = old[9];
 320             newparam->posres.pos0B[YY] = old[10];
 321             newparam->posres.pos0B[ZZ] = old[11];
 322             break;
 323         case F_FBPOSRES:
 324             newparam->fbposres.geom     = round_check(old[0], 0, ftype, "geometry");
 325             if (!(newparam->fbposres.geom > efbposresZERO && newparam->fbposres.geom < efbposresNR))
 326             {
 327                 gmx_fatal(FARGS, "Invalid geometry for flat-bottomed position restraint.\n"
 328                           "Expected number between 1 and %d. Found %d\n", efbposresNR-1,
 329                           newparam->fbposres.geom);
 330             }
 331             newparam->fbposres.r        = old[1];
 332             newparam->fbposres.k        = old[2];
 333             newparam->fbposres.pos0[XX] = old[3];
 334             newparam->fbposres.pos0[YY] = old[4];
 335             newparam->fbposres.pos0[ZZ] = old[5];
 336             break;
 337         case F_DISRES:
 338             newparam->disres.label = round_check(old[0], 0, ftype, "label");
 339             newparam->disres.type  = round_check(old[1], 1, ftype, "type'");
 340             newparam->disres.low   = old[2];
 341             newparam->disres.up1   = old[3];
 342             newparam->disres.up2   = old[4];
 343             newparam->disres.kfac  = old[5];
 344             break;
 345         case F_ORIRES:
 346             newparam->orires.ex    = round_check(old[0], 1, ftype, "experiment") - 1;
 347             newparam->orires.label = round_check(old[1], 1, ftype, "label");
 348             newparam->orires.power = round_check(old[2], 0, ftype, "power");
 349             newparam->orires.c     = old[3];
 350             newparam->orires.obs   = old[4];
 351             newparam->orires.kfac  = old[5];
 352             break;
 353         case F_DIHRES:
 354             newparam->dihres.phiA   = old[0];
 355             newparam->dihres.dphiA  = old[1];
 356             newparam->dihres.kfacA  = old[2];
 357             newparam->dihres.phiB   = old[3];
 358             newparam->dihres.dphiB  = old[4];
 359             newparam->dihres.kfacB  = old[5];
 360             break;
 361         case F_RBDIHS:
 362             for (i = 0; (i < NR_RBDIHS); i++)
 363             {
 364                 newparam->rbdihs.rbcA[i] = old[i];
 365                 newparam->rbdihs.rbcB[i] = old[NR_RBDIHS+i];
 366             }
 367             break;
 368         case F_FOURDIHS:
 369             /* Read the dihedral parameters to temporary arrays,
 370              * and convert them to the computationally faster
 371              * Ryckaert-Bellemans form.
 372              */
 373             /* Use conversion formula for OPLS to Ryckaert-Bellemans: */
 374             newparam->rbdihs.rbcA[0] = old[1]+0.5*(old[0]+old[2]);
 375             newparam->rbdihs.rbcA[1] = 0.5*(3.0*old[2]-old[0]);
 376             newparam->rbdihs.rbcA[2] = 4.0*old[3]-old[1];
 377             newparam->rbdihs.rbcA[3] = -2.0*old[2];
 378             newparam->rbdihs.rbcA[4] = -4.0*old[3];
 379             newparam->rbdihs.rbcA[5] = 0.0;
 380
 381             newparam->rbdihs.rbcB[0] = old[NR_FOURDIHS+1]+0.5*(old[NR_FOURDIHS+0]+old[NR_FOURDIHS+2]);
 382             newparam->rbdihs.rbcB[1] = 0.5*(3.0*old[NR_FOURDIHS+2]-old[NR_FOURDIHS+0]);
 383             newparam->rbdihs.rbcB[2] = 4.0*old[NR_FOURDIHS+3]-old[NR_FOURDIHS+1];
 384             newparam->rbdihs.rbcB[3] = -2.0*old[NR_FOURDIHS+2];
 385             newparam->rbdihs.rbcB[4] = -4.0*old[NR_FOURDIHS+3];
 386             newparam->rbdihs.rbcB[5] = 0.0;
 387             break;
 388         case F_CONSTR:
 389         case F_CONSTRNC:
 390             newparam->constr.dA = old[0];
 391             newparam->constr.dB = old[1];
 392             break;
 393         case F_SETTLE:
 394             newparam->settle.doh = old[0];
 395             newparam->settle.dhh = old[1];
 396             break;
 397         case F_VSITE2:
 398         case F_VSITE3:
 399         case F_VSITE3FD:
 400         case F_VSITE3OUT:
 401         case F_VSITE4FD:
 402         case F_VSITE4FDN:
 403             newparam->vsite.a = old[0];
 404             newparam->vsite.b = old[1];
 405             newparam->vsite.c = old[2];
 406             newparam->vsite.d = old[3];
 407             newparam->vsite.e = old[4];
 408             newparam->vsite.f = old[5];
 409             break;
 410         case F_VSITE3FAD:
 411             newparam->vsite.a = old[1] * cos(DEG2RAD * old[0]);
 412             newparam->vsite.b = old[1] * sin(DEG2RAD * old[0]);
 413             newparam->vsite.c = old[2];
 414             newparam->vsite.d = old[3];
 415             newparam->vsite.e = old[4];
 416             newparam->vsite.f = old[5];
 417             break;
 418         case F_VSITEN:
 419             newparam->vsiten.n = round_check(old[0], 1, ftype, "number of atoms");
 420             newparam->vsiten.a = old[1];
 421             break;
 422         case F_CMAP:
 423             newparam->cmap.cmapA = old[0];
 424             newparam->cmap.cmapB = old[1];
 425             break;
 426         case F_GB12:
 427         case F_GB13:
 428         case F_GB14:
 429             newparam->gb.sar  = old[0];
 430             newparam->gb.st   = old[1];
 431             newparam->gb.pi   = old[2];
 432             newparam->gb.gbr  = old[3];
 433             newparam->gb.bmlt = old[4];
 434             break;
 435         default:
 436             gmx_fatal(FARGS, "unknown function type %d in %s line %d",
 437                       ftype, __FILE__, __LINE__);
 438     }
 439     return 0;
 440 }
 441
 442 static int enter_params(gmx_ffparams_t *ffparams, t_functype ftype,
 443                         real forceparams[MAXFORCEPARAM], int comb, real reppow,
 444                         int start, gmx_bool bAppend)
 445 {
 446     t_iparams newparam;
 447     int       type;
 448     int       rc;
 449
 450     if ( (rc = assign_param(ftype, &newparam, forceparams, comb, reppow)) < 0)
 451     {
 452         /* -1 means this interaction is all-zero and should not be added */
 453         return rc;
 454     }
 455
 456     if (!bAppend)
 457     {
 458         for (type = start; (type < ffparams->ntypes); type++)
 459         {
 460             if (ffparams->functype[type] == ftype)
 461             {
 462                 if (F_GB13 == ftype)
 463                 {
 464                     /* Occasionally, the way the 1-3 reference distance is
 465                      * computed can lead to non-binary-identical results, but I
 466                      * don't know why. */
 467                     if ((gmx_within_tol(newparam.gb.sar,  ffparams->iparams[type].gb.sar,  1e-6)) &&
 468                         (gmx_within_tol(newparam.gb.st,   ffparams->iparams[type].gb.st,   1e-6)) &&
 469                         (gmx_within_tol(newparam.gb.pi,   ffparams->iparams[type].gb.pi,   1e-6)) &&
 470                         (gmx_within_tol(newparam.gb.gbr,  ffparams->iparams[type].gb.gbr,  1e-6)) &&
 471                         (gmx_within_tol(newparam.gb.bmlt, ffparams->iparams[type].gb.bmlt, 1e-6)))
 472                     {
 473                         return type;
 474                     }
 475                 }
 476                 else
 477                 {
 478                     if (memcmp(&newparam, &ffparams->iparams[type], (size_t)sizeof(newparam)) == 0)
 479                     {
 480                         return type;
 481                     }
 482                 }
 483             }
 484         }
 485     }
 486     else
 487     {
 488         type = ffparams->ntypes;
 489     }
 490     if (debug)
 491     {
 492         fprintf(debug, "copying newparam to ffparams->iparams[%d] (ntypes=%d)\n",
 493                 type, ffparams->ntypes);
 494     }
 495     memcpy(&ffparams->iparams[type], &newparam, (size_t)sizeof(newparam));
 496
 497     ffparams->ntypes++;
 498     ffparams->functype[type] = ftype;
 499
 500     return type;
 501 }
 502
 503 static void append_interaction(t_ilist *ilist,
 504                                int type, int nral, atom_id a[MAXATOMLIST])
 505 {
 506     int i, where1;
 507
 508     where1     = ilist->nr;
 509     ilist->nr += nral+1;
 510
 511     ilist->iatoms[where1++] = type;
 512     for (i = 0; (i < nral); i++)
 513     {
 514         ilist->iatoms[where1++] = a[i];
 515     }
 516 }
 517
 518 static void enter_function(t_params *p, t_functype ftype, int comb, real reppow,
 519                            gmx_ffparams_t *ffparams, t_ilist *il,
 520                            int *maxtypes,
 521                            gmx_bool bNB, gmx_bool bAppend)
 522 {
 523     int     k, type, nr, nral, delta, start;
 524
 525     start = ffparams->ntypes;
 526     nr    = p->nr;
 527
 528     for (k = 0; k < nr; k++)
 529     {
 530         if (*maxtypes <= ffparams->ntypes)
 531         {
 532             *maxtypes += 1000;
 533             srenew(ffparams->functype, *maxtypes);
 534             srenew(ffparams->iparams, *maxtypes);
 535             if (debug)
 536             {
 537                 fprintf(debug, "%s, line %d: srenewed idef->functype and idef->iparams to %d\n",
 538                         __FILE__, __LINE__, *maxtypes);
 539             }
 540         }
 541         type = enter_params(ffparams, ftype, p->param[k].c, comb, reppow, start, bAppend);
 542         /* Type==-1 is used as a signal that this interaction is all-zero and should not be added. */
 543         if (!bNB && type >= 0)
 544         {
 545             nral  = NRAL(ftype);
 546             delta = nr*(nral+1);
 547             srenew(il->iatoms, il->nr+delta);
 548             append_interaction(il, type, nral, p->param[k].a);
 549         }
 550     }
 551 }
 552
 553 void convert_params(int atnr, t_params nbtypes[],
 554                     t_molinfo *mi, int comb, double reppow, real fudgeQQ,
 555                     gmx_mtop_t *mtop)
 556 {
 557     int             i, j, maxtypes, mt;
 558     unsigned long   flags;
 559     gmx_ffparams_t *ffp;
 560     gmx_moltype_t  *molt;
 561     t_params       *plist;
 562
 563     maxtypes = 0;
 564
 565     ffp           = &mtop->ffparams;
 566     ffp->ntypes   = 0;
 567     ffp->atnr     = atnr;
 568     ffp->functype = NULL;
 569     ffp->iparams  = NULL;
 570     ffp->reppow   = reppow;
 571
 572     enter_function(&(nbtypes[F_LJ]),  (t_functype)F_LJ,    comb, reppow, ffp, NULL,
 573                    &maxtypes, TRUE, TRUE);
 574     enter_function(&(nbtypes[F_BHAM]), (t_functype)F_BHAM,  comb, reppow, ffp, NULL,
 575                    &maxtypes, TRUE, TRUE);
 576
 577     for (mt = 0; mt < mtop->nmoltype; mt++)
 578     {
 579         molt = &mtop->moltype[mt];
 580         for (i = 0; (i < F_NRE); i++)
 581         {
 582             molt->ilist[i].nr     = 0;
 583             molt->ilist[i].iatoms = NULL;
 584
 585             plist = mi[mt].plist;
 586
 587             flags = interaction_function[i].flags;
 588             if ((i != F_LJ) && (i != F_BHAM) && ((flags & IF_BOND) ||
 589                                                  (flags & IF_VSITE) ||
 590                                                  (flags & IF_CONSTRAINT)))
 591             {
 592                 enter_function(&(plist[i]), (t_functype)i, comb, reppow,
 593                                ffp, &molt->ilist[i],
 594                                &maxtypes, FALSE, (i == F_POSRES  || i == F_FBPOSRES));
 595             }
 596         }
 597     }
 598     if (debug)
 599     {
 600         fprintf(debug, "%s, line %d: There are %d functypes in idef\n",
 601                 __FILE__, __LINE__, ffp->ntypes);
 602     }
 603
 604     ffp->fudgeQQ = fudgeQQ;
 605 }