src/gromacs/legacyheaders/sortwater.h

   1 /*
   2  *
   3  *                This source code is part of
   4  *
   5  *                 G   R   O   M   A   C   S
   6  *
   7  *          GROningen MAchine for Chemical Simulations
   8  *
   9  *                        VERSION 3.2.0
  10  * Written by David van der Spoel, Erik Lindahl, Berk Hess, and others.
  11  * Copyright (c) 1991-2000, University of Groningen, The Netherlands.
  12  * Copyright (c) 2001-2004, The GROMACS development team,
  13  * check out http://www.gromacs.org for more information.
  14
  15  * This program is free software; you can redistribute it and/or
  16  * modify it under the terms of the GNU General Public License
  17  * as published by the Free Software Foundation; either version 2
  18  * of the License, or (at your option) any later version.
  19  *
  20  * If you want to redistribute modifications, please consider that
  21  * scientific software is very special. Version control is crucial -
  22  * bugs must be traceable. We will be happy to consider code for
  23  * inclusion in the official distribution, but derived work must not
  24  * be called official GROMACS. Details are found in the README & COPYING
  25  * files - if they are missing, get the official version at www.gromacs.org.
  26  *
  27  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
  28  * the papers on the package - you can find them in the top README file.
  29  *
  30  * For more info, check our website at http://www.gromacs.org
  31  *
  32  * And Hey:
  33  * Gromacs Runs On Most of All Computer Systems
  34  */
  35
  36 #ifndef _sortwater_h
  37 #define _sortwater_h
  38
  39 #include "typedefs.h"
  40
  41 #ifdef __cplusplus
  42 extern "C" {
  43 #endif
  44
  45 void randwater(int astart, int nwater, int nwatom,
  46                rvec x[], rvec v[], int *seed);
  47 /* Randomize the order of nwater molecules of length nwatom, the
  48  * first atom of which is at astart.
  49  * If v is not NULL it will be shuffled along
  50  * IS NOT THREAD SAFE
  51  */
  52
  53
  54 void sortwater(int astart, int nwater, int nwatom, rvec x[], rvec v[]);
  55 /* Sort the order of nwater molecules of length nwatom on X coordinate
  56  * If v is not NULL it will be shuffled along
  57  * IS NOT THREAD SAFE
  58  */
  59
  60 void mkcompact(int astart, int nwater, int nwatom, rvec x[], rvec v[],
  61                int nnode, matrix box);
  62 /* Make compact subboxes
  63  * IS NOT THREAD SAFE  */
  64
  65 #ifdef __cplusplus
  66 }
  67 #endif
  68
  69 #endif