Fix remaining copyright headers
[alexxy/gromacs.git] / src / gromacs / gmxana / gmx_ana.h
1 /*
2  * This file is part of the GROMACS molecular simulation package.
3  *
4  * Copyright (c) 1991-2000, University of Groningen, The Netherlands.
5  * Copyright (c) 2001-2008, The GROMACS development team.
6  * Copyright (c) 2013, by the GROMACS development team, led by
7  * Mark Abraham, David van der Spoel, Berk Hess, and Erik Lindahl,
8  * and including many others, as listed in the AUTHORS file in the
9  * top-level source directory and at http://www.gromacs.org.
10  *
11  * GROMACS is free software; you can redistribute it and/or
12  * modify it under the terms of the GNU Lesser General Public License
13  * as published by the Free Software Foundation; either version 2.1
14  * of the License, or (at your option) any later version.
15  *
16  * GROMACS is distributed in the hope that it will be useful,
17  * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
18  * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU
19  * Lesser General Public License for more details.
20  *
21  * You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
22  * License along with GROMACS; if not, see
23  * http://www.gnu.org/licenses, or write to the Free Software Foundation,
24  * Inc., 51 Franklin Street, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA.
25  *
26  * If you want to redistribute modifications to GROMACS, please
27  * consider that scientific software is very special. Version
28  * control is crucial - bugs must be traceable. We will be happy to
29  * consider code for inclusion in the official distribution, but
30  * derived work must not be called official GROMACS. Details are found
31  * in the README & COPYING files - if they are missing, get the
32  * official version at http://www.gromacs.org.
33  *
34  * To help us fund GROMACS development, we humbly ask that you cite
35  * the research papers on the package. Check out http://www.gromacs.org.
36  */
37
38 #ifndef _gmx_ana_h
39 #define _gmx_ana_h
40
41 #ifdef __cplusplus
42 extern "C" {
43 #endif
44
45 int
46 gmx_anadock(int argc, char *argv[]);
47
48 int
49 gmx_analyze(int argc, char *argv[]);
50
51 int
52 gmx_anaeig(int argc, char *argv[]);
53
54 int
55 gmx_g_angle(int argc, char *argv[]);
56
57 int
58 gmx_bar(int argc, char *argv[]);
59
60 int
61 gmx_bundle(int argc, char *argv[]);
62
63 int
64 gmx_chi(int argc, char *argv[]);
65
66 int
67 gmx_cluster(int argc, char *argv[]);
68
69 int
70 gmx_confrms(int argc, char *argv[]);
71
72 int
73 gmx_covar(int argc, char *argv[]);
74
75 int
76 gmx_current(int argc, char *argv[]);
77
78 int
79 gmx_density(int argc, char *argv[]);
80
81 int
82 gmx_densmap(int argc, char *argv[]);
83
84 int
85 gmx_densorder(int argc, char *argv[]);
86
87 int
88 gmx_dielectric(int argc, char *argv[]);
89
90 int
91 gmx_dipoles(int argc, char *argv[]);
92
93 int
94 gmx_disre(int argc, char *argv[]);
95
96 int
97 gmx_do_dssp(int argc, char *argv[]);
98
99 int
100 gmx_dos(int argc, char *argv[]);
101
102 int
103 gmx_dyecoupl(int argc, char *argv[]);
104
105 int
106 gmx_dyndom(int argc, char *argv[]);
107
108 int
109 gmx_editconf(int argc, char *argv[]);
110
111 int
112 gmx_eneconv(int argc, char *argv[]);
113
114 int
115 gmx_enemat(int argc, char *argv[]);
116
117 int
118 gmx_energy(int argc, char *argv[]);
119
120 int
121 gmx_lie(int argc, char *argv[]);
122
123 int
124 gmx_filter(int argc, char *argv[]);
125
126 int
127 gmx_genbox(int argc, char *argv[]);
128
129 int
130 gmx_genconf(int argc, char *argv[]);
131
132 int
133 gmx_genion(int argc, char *argv[]);
134
135 int
136 gmx_genpr(int argc, char *argv[]);
137
138 int
139 gmx_gyrate(int argc, char *argv[]);
140
141 int
142 gmx_h2order(int argc, char *argv[]);
143
144 int
145 gmx_hbond(int argc, char *argv[]);
146
147 int
148 gmx_helix(int argc, char *argv[]);
149
150 int
151 gmx_helixorient(int argc, char *argv[]);
152
153 int
154 gmx_hydorder(int argc, char *argv[]);
155
156 int
157 gmx_kinetics(int argc, char *argv[]);
158
159 int
160 gmx_make_edi(int argc, char *argv[]);
161
162 int
163 gmx_make_ndx(int argc, char *argv[]);
164
165 int
166 gmx_mindist(int argc, char *argv[]);
167
168 int
169 gmx_mk_angndx(int argc, char *argv[]);
170
171 int
172 gmx_msd(int argc, char *argv[]);
173
174 int
175 gmx_morph(int argc, char *argv[]);
176
177 int
178 gmx_nmeig(int argc, char *argv[]);
179
180 int
181 gmx_nmens(int argc, char *argv[]);
182
183 int
184 gmx_nmtraj(int argc, char *argv[]);
185
186 int
187 gmx_order(int argc, char *argv[]);
188
189 int
190 gmx_polystat(int argc, char *argv[]);
191
192 int
193 gmx_potential(int argc, char *argv[]);
194
195 int
196 gmx_principal(int argc, char *argv[]);
197
198 int
199 gmx_rama(int argc, char *argv[]);
200
201 int
202 gmx_rdf(int argc, char *argv[]);
203
204 int
205 gmx_rotmat(int argc, char *argv[]);
206
207 int
208 gmx_rms(int argc, char *argv[]);
209
210 int
211 gmx_rmsdist(int argc, char *argv[]);
212
213 int
214 gmx_rmsf(int argc, char *argv[]);
215
216 int
217 gmx_rotacf(int argc, char *argv[]);
218
219 int
220 gmx_saltbr(int argc, char *argv[]);
221
222 int
223 gmx_sas(int argc, char *argv[]);
224
225 int
226 gmx_sham(int argc, char *argv[]);
227
228 int
229 gmx_sigeps(int argc, char *argv[]);
230
231 int
232 gmx_sorient(int argc, char *argv[]);
233
234 int
235 gmx_spol(int argc, char *argv[]);
236
237 int
238 gmx_spatial(int argc, char *argv[]);
239
240 int
241 gmx_tcaf(int argc, char *argv[]);
242
243 int
244 gmx_traj(int argc, char *argv[]);
245
246 int
247 gmx_trjcat(int argc, char *argv[]);
248
249 int
250 gmx_trjconv(int argc, char *argv[]);
251
252 int
253 gmx_trjorder(int argc, char *argv[]);
254
255 int
256 gmx_tune_pme(int argc, char *argv[]);
257
258 int
259 gmx_velacc(int argc, char *argv[]);
260
261 int
262 gmx_clustsize(int argc, char *argv[]);
263
264 int
265 gmx_mdmat(int argc, char *argv[]);
266
267 int
268 gmx_vanhove(int argc, char *argv[]);
269
270 int
271 gmx_wham(int argc, char *argv[]);
272
273 int
274 gmx_wheel(int argc, char *argv[]);
275
276 int
277 gmx_xpm2ps(int argc, char *argv[]);
278
279 int
280 gmx_membed(int argc, char *argv[]);
281
282 int
283 gmx_pme_error(int argc, char *argv[]);
284
285 int
286 gmx_options(int argc, char *argv[]);
287
288 int
289 gmx_sans(int argc, char *argv[]);
290
291 int
292 gmx_saxs(int argc, char *argv[]);
293
294 #ifdef __cplusplus
295 }
296 #endif
297
298 #endif
299 /* _gmx_ana_h */