Fix remaining copyright headers
authorTeemu Murtola <teemu.murtola@gmail.com>
Mon, 2 Dec 2013 18:59:20 +0000 (20:59 +0200)
committerGerrit Code Review <gerrit@gerrit.gromacs.org>
Wed, 1 Jan 2014 11:23:26 +0000 (12:23 +0100)
commit7c2f8ee0ba7f7e464d83a55856a7ad3f8c6f36e9
tree9af98de62a18ef5b66925c9185516c42274d7644
parentac25fa90d70c18156f5eebf6d7aac29354873e40
Fix remaining copyright headers

Apply copyright to the remaining files, excluding thread_mpi, with the
copyright year as the year when the last change to that file was made
(excluding other copyright stuff and mass uncrustification).

Part of #818.

Change-Id: Ib70deb8a8e71b23511b68c91e05c1dee821a6d2c
361 files changed:
.gitattributes
src/gromacs/commandline/pargs.cpp
src/gromacs/fileio/timecontrol.c
src/gromacs/gmxana/addconf.c
src/gromacs/gmxana/addconf.h
src/gromacs/gmxana/anadih.c
src/gromacs/gmxana/autocorr.c
src/gromacs/gmxana/cmat.c
src/gromacs/gmxana/cmat.h
src/gromacs/gmxana/correl.c
src/gromacs/gmxana/correl.h
src/gromacs/gmxana/dlist.c
src/gromacs/gmxana/edittop.c
src/gromacs/gmxana/eigio.c
src/gromacs/gmxana/eigio.h
src/gromacs/gmxana/expfit.c
src/gromacs/gmxana/fitahx.c
src/gromacs/gmxana/fitahx.h
src/gromacs/gmxana/gmx_ana.h
src/gromacs/gmxana/gmx_anaeig.c
src/gromacs/gmxana/gmx_analyze.c
src/gromacs/gmxana/gmx_angle.c
src/gromacs/gmxana/gmx_bundle.c
src/gromacs/gmxana/gmx_chi.c
src/gromacs/gmxana/gmx_cluster.c
src/gromacs/gmxana/gmx_clustsize.c
src/gromacs/gmxana/gmx_confrms.c
src/gromacs/gmxana/gmx_covar.c
src/gromacs/gmxana/gmx_density.c
src/gromacs/gmxana/gmx_densmap.c
src/gromacs/gmxana/gmx_dielectric.c
src/gromacs/gmxana/gmx_dipoles.cpp
src/gromacs/gmxana/gmx_disre.c
src/gromacs/gmxana/gmx_dyndom.c
src/gromacs/gmxana/gmx_editconf.c
src/gromacs/gmxana/gmx_eneconv.c
src/gromacs/gmxana/gmx_enemat.c
src/gromacs/gmxana/gmx_energy.c
src/gromacs/gmxana/gmx_filter.c
src/gromacs/gmxana/gmx_genbox.cpp
src/gromacs/gmxana/gmx_genconf.c
src/gromacs/gmxana/gmx_genion.c
src/gromacs/gmxana/gmx_genpr.c
src/gromacs/gmxana/gmx_gyrate.c
src/gromacs/gmxana/gmx_h2order.c
src/gromacs/gmxana/gmx_hbond.c
src/gromacs/gmxana/gmx_helix.c
src/gromacs/gmxana/gmx_helixorient.c
src/gromacs/gmxana/gmx_kinetics.c
src/gromacs/gmxana/gmx_lie.c
src/gromacs/gmxana/gmx_mdmat.c
src/gromacs/gmxana/gmx_mindist.c
src/gromacs/gmxana/gmx_morph.c
src/gromacs/gmxana/gmx_msd.c
src/gromacs/gmxana/gmx_nmeig.c
src/gromacs/gmxana/gmx_nmens.c
src/gromacs/gmxana/gmx_nmtraj.c
src/gromacs/gmxana/gmx_options.c
src/gromacs/gmxana/gmx_order.c
src/gromacs/gmxana/gmx_polystat.c
src/gromacs/gmxana/gmx_potential.c
src/gromacs/gmxana/gmx_principal.c
src/gromacs/gmxana/gmx_rama.c
src/gromacs/gmxana/gmx_rdf.c
src/gromacs/gmxana/gmx_rms.c
src/gromacs/gmxana/gmx_rmsdist.c
src/gromacs/gmxana/gmx_rmsf.c
src/gromacs/gmxana/gmx_rotacf.c
src/gromacs/gmxana/gmx_saltbr.c
src/gromacs/gmxana/gmx_sas.c
src/gromacs/gmxana/gmx_sham.c
src/gromacs/gmxana/gmx_sorient.c
src/gromacs/gmxana/gmx_spol.c
src/gromacs/gmxana/gmx_tcaf.c
src/gromacs/gmxana/gmx_traj.c
src/gromacs/gmxana/gmx_trjcat.c
src/gromacs/gmxana/gmx_trjconv.c
src/gromacs/gmxana/gmx_trjorder.c
src/gromacs/gmxana/gmx_vanhove.c
src/gromacs/gmxana/gmx_velacc.c
src/gromacs/gmxana/gmx_wham.cpp
src/gromacs/gmxana/gmx_wheel.c
src/gromacs/gmxana/gmx_xpm2ps.c
src/gromacs/gmxana/hxprops.c
src/gromacs/gmxana/hxprops.h
src/gromacs/gmxana/levenmar.c
src/gromacs/gmxana/nsc.c
src/gromacs/gmxana/nsc.h
src/gromacs/gmxana/polynomials.c
src/gromacs/gmxana/pp2shift.c
src/gromacs/gmxlib/3dview.c
src/gromacs/gmxlib/atomprop.c
src/gromacs/gmxlib/bondfree.c
src/gromacs/gmxlib/calcgrid.c
src/gromacs/gmxlib/calch.c
src/gromacs/gmxlib/chargegroup.c
src/gromacs/gmxlib/cinvsqrtdata.c
src/gromacs/gmxlib/copyrite.cpp
src/gromacs/gmxlib/crecipdata.c
src/gromacs/gmxlib/disre.c
src/gromacs/gmxlib/dlb.h
src/gromacs/gmxlib/do_fit.c
src/gromacs/gmxlib/gbutil.c
src/gromacs/gmxlib/gmx_fatal.c
src/gromacs/gmxlib/gmx_random.c
src/gromacs/gmxlib/gmxcpp.c
src/gromacs/gmxlib/index.c
src/gromacs/gmxlib/inputrec.c
src/gromacs/gmxlib/invblock.c
src/gromacs/gmxlib/invsqrt_test.c
src/gromacs/gmxlib/main.cpp
src/gromacs/gmxlib/maths.c
src/gromacs/gmxlib/md_logging.c
src/gromacs/gmxlib/minvert.h
src/gromacs/gmxlib/mshift.c
src/gromacs/gmxlib/mvdata.c
src/gromacs/gmxlib/network.c
src/gromacs/gmxlib/nonbonded/nb_free_energy.h
src/gromacs/gmxlib/nonbonded/nb_generic.c
src/gromacs/gmxlib/nonbonded/nb_generic.h
src/gromacs/gmxlib/nonbonded/nb_generic_cg.c
src/gromacs/gmxlib/nonbonded/nb_generic_cg.h
src/gromacs/gmxlib/nonbonded/nonbonded.c
src/gromacs/gmxlib/nrama.c
src/gromacs/gmxlib/nrjac.c
src/gromacs/gmxlib/nrnb.c
src/gromacs/gmxlib/oenv.cpp
src/gromacs/gmxlib/orires.c
src/gromacs/gmxlib/pbc.c
src/gromacs/gmxlib/physics.c
src/gromacs/gmxlib/princ.c
src/gromacs/gmxlib/rando.c
src/gromacs/gmxlib/random.c
src/gromacs/gmxlib/rbin.c
src/gromacs/gmxlib/readinp.c
src/gromacs/gmxlib/rmpbc.c
src/gromacs/gmxlib/sfactor.c
src/gromacs/gmxlib/sighandler.c
src/gromacs/gmxlib/smalloc.c
src/gromacs/gmxlib/sortwater.c
src/gromacs/gmxlib/splitter.c
src/gromacs/gmxlib/statistics/gmx_statistics.c
src/gromacs/gmxlib/statistics/gmx_statistics_test.c
src/gromacs/gmxlib/strdb.c
src/gromacs/gmxlib/string2.c
src/gromacs/gmxlib/symtab.c
src/gromacs/gmxlib/topsort.c
src/gromacs/gmxlib/typedefs.c
src/gromacs/gmxlib/viewit.c
src/gromacs/gmxlib/warninp.c
src/gromacs/gmxlib/writeps.c
src/gromacs/gmxlib/xvgr.cpp
src/gromacs/gmxpreprocess/add_par.c
src/gromacs/gmxpreprocess/add_par.h
src/gromacs/gmxpreprocess/compute_io.c
src/gromacs/gmxpreprocess/compute_io.h
src/gromacs/gmxpreprocess/gen_ad.c
src/gromacs/gmxpreprocess/gen_vsite.c
src/gromacs/gmxpreprocess/gen_vsite.h
src/gromacs/gmxpreprocess/genhydro.c
src/gromacs/gmxpreprocess/genhydro.h
src/gromacs/gmxpreprocess/gpp_atomtype.c
src/gromacs/gmxpreprocess/gpp_bond_atomtype.c
src/gromacs/gmxpreprocess/gpp_bond_atomtype.h
src/gromacs/gmxpreprocess/h_db.c
src/gromacs/gmxpreprocess/h_db.h
src/gromacs/gmxpreprocess/hackblock.c
src/gromacs/gmxpreprocess/pdb2top.cpp
src/gromacs/gmxpreprocess/pgutil.c
src/gromacs/gmxpreprocess/pgutil.h
src/gromacs/gmxpreprocess/readir.h
src/gromacs/gmxpreprocess/readpull.c
src/gromacs/gmxpreprocess/readrot.c
src/gromacs/gmxpreprocess/resall.c
src/gromacs/gmxpreprocess/ter_db.c
src/gromacs/gmxpreprocess/ter_db.h
src/gromacs/gmxpreprocess/topdirs.c
src/gromacs/gmxpreprocess/topdirs.h
src/gromacs/gmxpreprocess/topexcl.c
src/gromacs/gmxpreprocess/topexcl.h
src/gromacs/gmxpreprocess/topio.c
src/gromacs/gmxpreprocess/topio.h
src/gromacs/gmxpreprocess/toppush.c
src/gromacs/gmxpreprocess/toppush.h
src/gromacs/gmxpreprocess/topshake.c
src/gromacs/gmxpreprocess/topshake.h
src/gromacs/gmxpreprocess/toputil.c
src/gromacs/gmxpreprocess/vsite_parm.c
src/gromacs/gmxpreprocess/vsite_parm.h
src/gromacs/legacyheaders/3dview.h
src/gromacs/legacyheaders/atomprop.h
src/gromacs/legacyheaders/bondf.h
src/gromacs/legacyheaders/calcgrid.h
src/gromacs/legacyheaders/calch.h
src/gromacs/legacyheaders/calcmu.h
src/gromacs/legacyheaders/chargegroup.h
src/gromacs/legacyheaders/checkpoint.h
src/gromacs/legacyheaders/constr.h
src/gromacs/legacyheaders/copyrite.h
src/gromacs/legacyheaders/disre.h
src/gromacs/legacyheaders/do_fit.h
src/gromacs/legacyheaders/ebin.h
src/gromacs/legacyheaders/edsam.h
src/gromacs/legacyheaders/force.h
src/gromacs/legacyheaders/gbutil.h
src/gromacs/legacyheaders/gen_ad.h
src/gromacs/legacyheaders/genborn.h
src/gromacs/legacyheaders/gmx_fatal.h
src/gromacs/legacyheaders/gmx_fatal_collective.h
src/gromacs/legacyheaders/gmx_ga2la.h
src/gromacs/legacyheaders/gmx_random.h
src/gromacs/legacyheaders/gmx_statistics.h
src/gromacs/legacyheaders/gmxcomplex.h
src/gromacs/legacyheaders/gmxcpp.h
src/gromacs/legacyheaders/gpp_atomtype.h
src/gromacs/legacyheaders/gpp_nextnb.h
src/gromacs/legacyheaders/grompp.h
src/gromacs/legacyheaders/gstat.h
src/gromacs/legacyheaders/hackblock.h
src/gromacs/legacyheaders/index.h
src/gromacs/legacyheaders/invblock.h
src/gromacs/legacyheaders/macros.h
src/gromacs/legacyheaders/main.h
src/gromacs/legacyheaders/maths.h
src/gromacs/legacyheaders/md_logging.h
src/gromacs/legacyheaders/md_support.h
src/gromacs/legacyheaders/mdatoms.h
src/gromacs/legacyheaders/mdebin.h
src/gromacs/legacyheaders/mdrun.h
src/gromacs/legacyheaders/mshift.h
src/gromacs/legacyheaders/mtop_util.h
src/gromacs/legacyheaders/mvdata.h
src/gromacs/legacyheaders/network.h
src/gromacs/legacyheaders/nonbonded.h
src/gromacs/legacyheaders/nrama.h
src/gromacs/legacyheaders/nrjac.h
src/gromacs/legacyheaders/nrnb.h
src/gromacs/legacyheaders/ns.h
src/gromacs/legacyheaders/nsgrid.h
src/gromacs/legacyheaders/oenv.h
src/gromacs/legacyheaders/orires.h
src/gromacs/legacyheaders/partdec.h
src/gromacs/legacyheaders/pbc.h
src/gromacs/legacyheaders/pdb2top.h
src/gromacs/legacyheaders/perf_est.h
src/gromacs/legacyheaders/physics.h
src/gromacs/legacyheaders/princ.h
src/gromacs/legacyheaders/pull.h
src/gromacs/legacyheaders/pull_rotation.h
src/gromacs/legacyheaders/qmmm.h
src/gromacs/legacyheaders/random.h
src/gromacs/legacyheaders/rbin.h
src/gromacs/legacyheaders/readinp.h
src/gromacs/legacyheaders/resall.h
src/gromacs/legacyheaders/rmpbc.h
src/gromacs/legacyheaders/sfactor.h
src/gromacs/legacyheaders/shellfc.h
src/gromacs/legacyheaders/shift.h
src/gromacs/legacyheaders/sighandler.h
src/gromacs/legacyheaders/sim_util.h
src/gromacs/legacyheaders/smalloc.h
src/gromacs/legacyheaders/sortwater.h
src/gromacs/legacyheaders/split.h
src/gromacs/legacyheaders/splitter.h
src/gromacs/legacyheaders/strdb.h
src/gromacs/legacyheaders/symtab.h
src/gromacs/legacyheaders/sysstuff.h
src/gromacs/legacyheaders/tgroup.h
src/gromacs/legacyheaders/toputil.h
src/gromacs/legacyheaders/txtdump.h
src/gromacs/legacyheaders/typedefs.h
src/gromacs/legacyheaders/types/atoms.h
src/gromacs/legacyheaders/types/block.h
src/gromacs/legacyheaders/types/constr.h
src/gromacs/legacyheaders/types/energy.h
src/gromacs/legacyheaders/types/fcdata.h
src/gromacs/legacyheaders/types/force_flags.h
src/gromacs/legacyheaders/types/genborn.h
src/gromacs/legacyheaders/types/globsig.h
src/gromacs/legacyheaders/types/graph.h
src/gromacs/legacyheaders/types/group.h
src/gromacs/legacyheaders/types/ifunc.h
src/gromacs/legacyheaders/types/ishift.h
src/gromacs/legacyheaders/types/iteratedconstraints.h
src/gromacs/legacyheaders/types/matrix.h
src/gromacs/legacyheaders/types/mdatom.h
src/gromacs/legacyheaders/types/nblist.h
src/gromacs/legacyheaders/types/nlistheuristics.h
src/gromacs/legacyheaders/types/nrnb.h
src/gromacs/legacyheaders/types/ns.h
src/gromacs/legacyheaders/types/nsgrid.h
src/gromacs/legacyheaders/types/oenv.h
src/gromacs/legacyheaders/types/pbc.h
src/gromacs/legacyheaders/types/qmmmrec.h
src/gromacs/legacyheaders/types/shellfc.h
src/gromacs/legacyheaders/types/simple.h
src/gromacs/legacyheaders/types/state.h
src/gromacs/legacyheaders/types/symtab.h
src/gromacs/legacyheaders/types/topology.h
src/gromacs/legacyheaders/update.h
src/gromacs/legacyheaders/vcm.h
src/gromacs/legacyheaders/vec.h
src/gromacs/legacyheaders/viewit.h
src/gromacs/legacyheaders/vsite.h
src/gromacs/legacyheaders/warninp.h
src/gromacs/legacyheaders/writeps.h
src/gromacs/legacyheaders/xvgr.h
src/gromacs/mdlib/calcmu.c
src/gromacs/mdlib/calcvir.c
src/gromacs/mdlib/clincs.c
src/gromacs/mdlib/constr.c
src/gromacs/mdlib/coupling.c
src/gromacs/mdlib/csettle.c
src/gromacs/mdlib/ebin.c
src/gromacs/mdlib/edsam.c
src/gromacs/mdlib/ewald.c
src/gromacs/mdlib/genborn.c
src/gromacs/mdlib/genborn_allvsall.c
src/gromacs/mdlib/genborn_allvsall.h
src/gromacs/mdlib/genborn_allvsall_sse2_double.c
src/gromacs/mdlib/genborn_allvsall_sse2_double.h
src/gromacs/mdlib/genborn_allvsall_sse2_single.c
src/gromacs/mdlib/genborn_allvsall_sse2_single.h
src/gromacs/mdlib/genborn_sse2_double.c
src/gromacs/mdlib/genborn_sse2_double.h
src/gromacs/mdlib/genborn_sse2_single.c
src/gromacs/mdlib/genborn_sse2_single.h
src/gromacs/mdlib/groupcoord.c
src/gromacs/mdlib/groupcoord.h
src/gromacs/mdlib/init.c
src/gromacs/mdlib/iteratedconstraints.c
src/gromacs/mdlib/md_support.c
src/gromacs/mdlib/mdatom.c
src/gromacs/mdlib/mdebin_bar.c
src/gromacs/mdlib/mdebin_bar.h
src/gromacs/mdlib/minimize.c
src/gromacs/mdlib/mvxvf.c
src/gromacs/mdlib/nlistheuristics.c
src/gromacs/mdlib/ns.c
src/gromacs/mdlib/nsgrid.c
src/gromacs/mdlib/partdec.c
src/gromacs/mdlib/perf_est.c
src/gromacs/mdlib/pull.c
src/gromacs/mdlib/pull_rotation.c
src/gromacs/mdlib/pullutil.c
src/gromacs/mdlib/qm_gamess.c
src/gromacs/mdlib/qm_gaussian.c
src/gromacs/mdlib/qm_mopac.c
src/gromacs/mdlib/qm_orca.c
src/gromacs/mdlib/qmmm.c
src/gromacs/mdlib/rf_util.c
src/gromacs/mdlib/shakef.c
src/gromacs/mdlib/shellfc.c
src/gromacs/mdlib/stat.c
src/gromacs/mdlib/tgroup.c
src/gromacs/mdlib/tpi.c
src/gromacs/mdlib/update.c
src/gromacs/mdlib/vcm.c
src/gromacs/mdlib/vsite.c
src/gromacs/mdlib/wall.c
src/gromacs/mdlib/wnblist.c