share/top/gromos53a5.ff/aminoacids.n.tdb

   1 [ None ]
   2
   3 [ NH3+ ]
   4 [ replace ]
   5 N               NL      14.0067 0.129
   6 CA              CH1     13.019  0.127   0
   7 [ add ]
   8 3       4       H       N       CA      C
   9         H       1.008   0.248
  10 [ delete ]
  11 H
  12 [ bonds ]
  13 N       H1      gb_2
  14 N       H2      gb_2
  15 N       H3      gb_2
  16 [ angles ]
  17 H1      N       H2      ga_10
  18 H2      N       H3      ga_10
  19 H3      N       H1      ga_10
  20 CA      N       H1      ga_11
  21 CA      N       H2      ga_11
  22 CA      N       H3      ga_11
  23 [ dihedrals ]
  24 H1      N       CA      C       gd_39
  25
  26 [ NH2 ]
  27 [ replace ]
  28 N               NL      14.0067 -0.83
  29 [ add ]
  30 2       4       H       N       CA      C
  31         H       1.008   0.415
  32 [ delete ]
  33 H
  34 [ bonds ]
  35 N       H1      gb_2
  36 N       H2      gb_2
  37 [ angles ]
  38 H1      N       H2      ga_10
  39 CA      N       H1      ga_11
  40 CA      N       H2      ga_11
  41 [ dihedrals ]
  42 H1      N       CA      C       gd_39
  43
  44 [ PRO-NH2+ ]
  45 [ replace ]
  46 N               NT      14.0067 0.128
  47 CA              CH1     13.019  0.188
  48 CD              CH2r    14.027  0.188
  49 [ add ]
  50 2       4       H       N       CA      C
  51         H       1.008   0.248
  52 [ bonds ]
  53 N       H1      gb_2
  54 N       H2      gb_2
  55 [ angles ]
  56 H1      N       H2      ga_10
  57 CA      N       H1      ga_11
  58 CA      N       H2      ga_11
  59 CD      N       H1      ga_11
  60 CD      N       H2      ga_11
  61 [ dihedrals ]
  62 CD      N       CA      C       gd_39
  63
  64 [ PRO-NH ]
  65 [ replace ]
  66 N               N       14.0067 -0.31
  67 [ add ]
  68 1       4       H       N       CA      C
  69         H       1.008   0.31
  70 [ bonds ]
  71 N       H       gb_2
  72 [ angles ]
  73 CA      N       H       ga_11
  74 CD      N       H       ga_11
  75 [ dihedrals ]
  76 CD      N       CA      C       gd_39
  77
  78 [ GLY-NH3+ ]
  79 [ replace ]
  80 N               NL      14.0067 0.129
  81 CA              CH2     14.027  0.127   0
  82 [ add ]
  83 3       4       H       N       CA      C
  84         H       1.008   0.248
  85 [ delete ]
  86 H
  87 [ bonds ]
  88 N       H1      gb_2
  89 N       H2      gb_2
  90 N       H3      gb_2
  91 [ angles ]
  92 H1      N       H2      ga_10
  93 H2      N       H3      ga_10
  94 H3      N       H1      ga_10
  95 CA      N       H1      ga_11
  96 CA      N       H2      ga_11
  97 CA      N       H3      ga_11
  98 [ dihedrals ]
  99 H1      N       CA      C       gd_39
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