share/top/gromos43a2.ff/aminoacids.n.tdb

   1 [ None ]
   2
   3 [ NH3+ ]
   4 [ replace ]
   5 N               NL      14.0067 0.129
   6 CA              CH1     13.019  0.127   0
   7 [ add ]
   8 3       4       H       N       CA      C
   9         H       1.008   0.248
  10 [ delete ]
  11 H
  12 [ bonds ]
  13 N       H1      gb_2
  14 N       H2      gb_2
  15 N       H3      gb_2
  16 [ angles ]
  17 H1      N       H2      ga_9
  18 H2      N       H3      ga_9
  19 H3      N       H1      ga_9
  20 CA      N       H1      ga_10
  21 CA      N       H2      ga_10
  22 CA      N       H3      ga_10
  23 [ dihedrals ]
  24 H1      N       CA      C       gd_19
  25
  26 [ NH2 ]
  27 [ replace ]
  28 N               NL      14.0067 -0.83
  29 [ add ]
  30 2       4       H       N       CA      C
  31         H       1.008   0.415
  32 [ delete ]
  33 H
  34 [ bonds ]
  35 N       H1      gb_2
  36 N       H2      gb_2
  37 [ angles ]
  38 H1      N       H2      ga_9
  39 CA      N       H1      ga_10
  40 CA      N       H2      ga_10
  41 [ dihedrals ]
  42 H1      N       CA      C       gd_19
  43
  44 [ PRO-NH2+ ]
  45 [ replace ]
  46 N               NT      14.0067 0.2
  47 [ add ]
  48 2       4       H       N       CA      C
  49         H       1.008   0.4
  50 [ bonds ]
  51 N       H1      gb_2
  52 N       H2      gb_2
  53 [ angles ]
  54 H1      N       H2      ga_9
  55 CA      N       H1      ga_10
  56 CA      N       H2      ga_10
  57 CD      N       H1      ga_10
  58 CD      N       H2      ga_10
  59 [ dihedrals ]
  60 CD      N       CA      C       gd_19
  61
  62 [ PRO-NH ]
  63 [ replace ]
  64 N               N       14.0067 -0.28
  65 [ add ]
  66 1       4       H       N       CA      C
  67         H       1.008   0.28
  68 [ bonds ]
  69 N       H       gb_2
  70 [ angles ]
  71 CA      N       H       ga_10
  72 CD      N       H       ga_10
  73 [ dihedrals ]
  74 CD      N       CA      C       gd_19
  75
  76 [ GLY-NH3+ ]
  77 [ replace ]
  78 N               NL      14.0067 0.129
  79 CA              CH2     14.027  0.127   0
  80 [ add ]
  81 3       4       H       N       CA      C
  82         H       1.008   0.248
  83 [ delete ]
  84 H
  85 [ bonds ]
  86 N       H1      gb_2
  87 N       H2      gb_2
  88 N       H3      gb_2
  89 [ angles ]
  90 H1      N       H2      ga_9
  91 H2      N       H3      ga_9
  92 H3      N       H1      ga_9
  93 CA      N       H1      ga_10
  94 CA      N       H2      ga_10
  95 CA      N       H3      ga_10
  96 [ dihedrals ]
  97 H1      N       CA      C       gd_19
  98