Misc. gmxpre.h-related changes
authorTeemu Murtola <teemu.murtola@gmail.com>
Wed, 20 Aug 2014 19:13:17 +0000 (22:13 +0300)
committerTeemu Murtola <teemu.murtola@gmail.com>
Wed, 20 Aug 2014 19:35:20 +0000 (22:35 +0300)
commit68213c93d07cd64770104e901b4a0ba4056a6b13
tree66befb53de969c1ac5493307cc905f257e14a964
parentb53fe549cf7fbb7fdd61ed5efd4e1c4e312c3879
Misc. gmxpre.h-related changes

Related to selection parser generated files:
- Add gmxpre.h to the generated selection parser files. parser.cpp and
  parser.h are now generated with a newer bison version, since that is
  what I happened to have available.
- Minor improvements to the regeneration script.

Related to the doc-check target:
- Make the doc-check target happy again by removing a check that is not
  valid in the current state.  Minor clean-up in the script.
- Add a checker for the presence of gmxpre.h in all files where it is
  expected to appear.
- Move one suppression from config.h to gmxpre.h, since that is where
  the code now is.
- Use consistent #include "config.h" in vec.h and remove blanket
  suppression for that issue in doc-check.

Change-Id: I1e803ef000c5b2c685532c9e47df534ef5b263bc
doxygen/doxygen-check.py
doxygen/suppressions.txt
src/gromacs/math/vec.h
src/gromacs/selection/parser.cpp
src/gromacs/selection/parser.h
src/gromacs/selection/parser.y
src/gromacs/selection/regenerate_parser.sh
src/gromacs/selection/scanner.cpp
src/gromacs/selection/scanner.l
src/gromacs/selection/scanner_flex.h