Remove .tpa, .tpb, .tpx, .trj files. Part of #1500.
[alexxy/gromacs.git] / docs / old-html / online / getting_started.html
index d9de09fad5adeccebd88ba6de4ab6e03255378d8..fcaf75c72df573a62dd2a4911dda7b6882bc13e4 100644 (file)
@@ -183,8 +183,7 @@ not consider the use of index files.
 The next step is to combine the molecular structure (<TT><a href="gro.html">.gro</a></TT> file),
 topology (<TT><a href="top.html">.top</a></TT> file) MD-parameters (<TT><a href="mdp_opt.html">.mdp</a></TT> file) and 
 (optionally) the
-index file (<TT><a href="ndx.html">ndx</a></TT>) to generate a run input file (<TT><a href="tpr.html">.tpr</a></tt> extension or
-<TT><a href="tpb.html">.tpb</a></tt> if you don't have XDR).
+index file (<TT><a href="ndx.html">ndx</a></TT>) to generate a run input file (<TT><a href="tpr.html">.tpr</a></tt> extension.
 This file contains all information needed to start a simulation with GROMACS.
 The
 <a href="../programs/gmx-grompp.html">gmx grompp</a> program processes all
@@ -203,8 +202,7 @@ to start a run
 is the run input file (<TT><a href="tpr.html">.tpr</a></TT> file).
 The output files of 
 <TT><a href="../programs/gmx-mdrun.html">gmx mdrun</a></TT> are the
-trajectory file (<TT><a href="trr.html">.trr</a></TT> file
-or <TT><a href="trj.html">.trj</a></TT> if you don't have XDR) and a logfile (
+trajectory file (<TT><a href="trr.html">.trr</a></TT> file) and a logfile (
 <TT><a href="log.html">.log</A></TT> file).
 <P></P>