Merge release-5-0 into master
[alexxy/gromacs.git] / src / gromacs / mdlib /
drwxr-xr-x   ..
-rw-r--r-- 1882 CMakeLists.txt
-rw-r--r-- 19786 adress.c
-rw-r--r-- 8768 adress.h
-rw-r--r-- 3647 calcmu.c
-rw-r--r-- 8031 calcvir.c
-rw-r--r-- 52519 clincs.c
-rw-r--r-- 45966 constr.c
-rw-r--r-- 52964 coupling.c
-rw-r--r-- 21667 csettle.c
-rw-r--r-- 307002 domdec.c
-rw-r--r-- 9752 domdec_box.c
-rw-r--r-- 47989 domdec_con.c
-rw-r--r-- 9740 domdec_network.c
-rw-r--r-- 23539 domdec_setup.c
-rw-r--r-- 79552 domdec_top.c
-rw-r--r-- 8585 ebin.c
-rw-r--r-- 9209 ewald.c
-rw-r--r-- 47595 expanded.c
-rw-r--r-- 33635 force.c
-rw-r--r-- 111121 forcerec.c
-rw-r--r-- 56277 genborn.c
-rw-r--r-- 34239 genborn_allvsall.c
-rw-r--r-- 3285 genborn_allvsall.h
-rw-r--r-- 115325 genborn_allvsall_sse2_double.c
-rw-r--r-- 3697 genborn_allvsall_sse2_double.h
-rw-r--r-- 185928 genborn_allvsall_sse2_single.c
-rw-r--r-- 3697 genborn_allvsall_sse2_single.h
-rw-r--r-- 34489 genborn_sse2_double.c
-rw-r--r-- 2640 genborn_sse2_double.h
-rw-r--r-- 63264 genborn_sse2_single.c
-rw-r--r-- 2611 genborn_sse2_single.h
-rw-r--r-- 13578 groupcoord.c
-rw-r--r-- 10292 groupcoord.h
-rw-r--r-- 5310 init.c
-rw-r--r-- 9522 iteratedconstraints.c
-rw-r--r-- 25743 md_support.cpp
-rw-r--r-- 13854 mdatom.c
-rw-r--r-- 53092 mdebin.c
-rw-r--r-- 23538 mdebin_bar.c
-rw-r--r-- 8864 mdebin_bar.h
-rw-r--r-- 94660 minimize.c
-rw-r--r-- 4313 nb_verlet.h
-rw-r--r-- 53693 nbnxn_atomdata.c
-rw-r--r-- 5220 nbnxn_atomdata.h
-rw-r--r-- 4625 nbnxn_consts.h
drwxr-xr-x - nbnxn_cuda
-rw-r--r-- 12101 nbnxn_internal.h
drwxr-xr-x - nbnxn_kernels
-rw-r--r-- 13865 nbnxn_pairlist.h
-rw-r--r-- 191487 nbnxn_search.c
-rw-r--r-- 5999 nbnxn_search.h
-rw-r--r-- 9119 nbnxn_search_simd_2xnn.h
-rw-r--r-- 11238 nbnxn_search_simd_4xn.h
-rw-r--r-- 3298 nbnxn_simd.h
-rw-r--r-- 4726 nlistheuristics.c
-rw-r--r-- 97161 ns.c
-rw-r--r-- 27026 nsgrid.c
-rw-r--r-- 15349 perf_est.c
-rw-r--r-- 172188 pme.c
-rw-r--r-- 27505 pme_pp.c
-rw-r--r-- 11942 pme_simd4.h
-rw-r--r-- 10095 qm_gamess.c
-rw-r--r-- 34164 qm_gaussian.c
-rw-r--r-- 8015 qm_mopac.c
-rw-r--r-- 15573 qm_orca.c
-rw-r--r-- 41334 qmmm.c
-rw-r--r-- 10255 rf_util.c
-rw-r--r-- 17696 shakef.c
-rw-r--r-- 40787 shellfc.c
-rw-r--r-- 97868 sim_util.c
-rw-r--r-- 12707 stat.c
-rw-r--r-- 53574 tables.c
-rw-r--r-- 9932 tgroup.c
-rw-r--r-- 31583 tpi.c
-rw-r--r-- 71241 update.c
-rw-r--r-- 12977 vcm.c
-rw-r--r-- 59983 vsite.c
-rw-r--r-- 12516 wall.c
-rw-r--r-- 6633 wnblist.c