Тестовая, очень неправильная сборка дссп для трпкейджа
authorMax <Infinity2573@gmail.com>
Tue, 11 Oct 2022 21:18:16 +0000 (00:18 +0300)
committerMax <Infinity2573@gmail.com>
Tue, 11 Oct 2022 21:18:16 +0000 (00:18 +0300)
src/dssptools.cpp

index b50beef4d43bece63c73a6919c434b87ee652098..93063ea75d70310faf6ec0062692ffc146b0d9f0 100644 (file)
@@ -1017,7 +1017,7 @@ float DsspTool::CalculateAtomicDistances(const int &A, const int &B, const t_trx
 {
    gmx::RVec r{ 0, 0, 0 };
    pbc_dx(pbc, fr.x[A], fr.x[B], r.as_vec());
-   return r.norm() * gmx::c_nm2A; // НЕ ТРОГАТЬ
+   return r.norm() * gmx::c_nm2A * gmx::c_nm2A; // НЕ ТРОГАТЬ
 }
 
 /* Calculate Distance From B to A, where A is only fake coordinates */
@@ -1025,7 +1025,7 @@ float DsspTool::CalculateAtomicDistances(const rvec &A, const int &B, const t_tr
 {
    gmx::RVec r{ 0, 0, 0 };
    pbc_dx(pbc, A, fr.x[B], r.as_vec());
-   return r.norm() * gmx::c_nm2A; // НЕ ТРОГАТЬ
+   return r.norm() * gmx::c_nm2A * gmx::c_nm2A; // НЕ ТРОГАТЬ
 }
 
 void DsspTool::initAnalysis(/*const TrajectoryAnalysisSettings &settings,*/const TopologyInformation& top, const initParameters &initParamz)