Update doc to clarify that Amber nucleic params are from Amber94 (recommendation...
authorErik Lindahl <lindahl@cbr.su.se>
Thu, 5 May 2011 10:57:41 +0000 (11:57 +0100)
committerErik Lindahl <lindahl@cbr.su.se>
Thu, 5 May 2011 10:57:41 +0000 (11:57 +0100)
share/top/amber03.ff/forcefield.doc
share/top/amber96.ff/forcefield.doc
share/top/amber99.ff/forcefield.doc
share/top/amber99sb-ildn.ff/forcefield.doc
share/top/amber99sb.ff/forcefield.doc

index c87b62f6e2973c710b508e6214ac2a5684c0b85e..897a9b4e8e1ef45cd6267c5ec1a5d175e577b4eb 100644 (file)
@@ -1,4 +1,4 @@
-AMBER03 force field (Duan et al., J. Comp. Chem. 24, 1999-2012, 2003)
+AMBER03 protein, nucleic AMBER94 (Duan et al., J. Comp. Chem. 24, 1999-2012, 2003)
 
 ********************************************************************
 * The original ffamber ports were written by Eric J. Sorin,        *
index b6716fd40ec5a733053c83d726cad48189128f6c..d02e85ebc9d4ae4c9c19093fc448a8880fff6ca4 100644 (file)
@@ -1,4 +1,4 @@
-AMBER96 force field (Kollman et al., Acc. Chem. Res. 29, 461-469, 1996)
+AMBER96 protein, nucleic AMBER94 (Kollman et al., Acc. Chem. Res. 29, 461-469, 1996)
 
 ********************************************************************
 * The original ffamber ports were written by Eric J. Sorin,        *
index bb0de58521aeea93c320a3d0dd0f970686dd0f7d..72fcb0870017dbc27aa748d0018578061fc5beb5 100644 (file)
@@ -1,4 +1,4 @@
-AMBER99 force field (Wang et al., J. Comp. Chem. 21, 1049-1074, 2000)
+AMBER99 protein, nucleic AMBER94 (Wang et al., J. Comp. Chem. 21, 1049-1074, 2000)
 
 ********************************************************************
 * The original ffamber ports were written by Eric J. Sorin,        *
index 628657d072e0f7ccc621d63c3a1bc8322c956ab1..39f5316c805c688b549075f287c8a9e67a5afe6b 100644 (file)
@@ -1,4 +1,4 @@
-AMBER99SB-ILDN force field (Lindorff-Larsen et al., Proteins 78, 1950-58, 2010)
+AMBER99SB-ILDN protein, nucleic AMBER94 (Lindorff-Larsen et al., Proteins 78, 1950-58, 2010)
 
 ********************************************************************
 * Amber99sb-ildn is an improvement to Amber99SB by                 *
index a215227f77afac265ebe167363882cdd59e23227..d310e82f457b98585f4a649c9fa6b4a50273e9c0 100644 (file)
@@ -1,4 +1,4 @@
-AMBER99SB force field (Hornak et al., Proteins 65, 712-725, 2006)
+AMBER99SB protein, nucleic AMBER94 (Hornak et al., Proteins 65, 712-725, 2006)
 
 ********************************************************************
 * The original ffamber ports were written by Eric J. Sorin,        *