Fix failing webpage build
authorPaul Bauer <paul.bauer.q@gmail.com>
Fri, 5 Jun 2020 09:27:31 +0000 (09:27 +0000)
committerArtem Zhmurov <zhmurov@gmail.com>
Fri, 5 Jun 2020 09:27:31 +0000 (09:27 +0000)
Change-Id: I09f0f0be0c055921e9e92adc424fce58ef2eb368

docs/dev-manual/gitlab.rst
src/gromacs/mdlib/vsite.cpp
src/gromacs/tools/convert_tpr.h

index 734f28b7b6efffb7f7b9e0fdcd6df173bdd34f53..12e6a6732930b4543a7b3b99bdbcb2d93b21ccb3 100644 (file)
@@ -157,9 +157,9 @@ basic job name from qualifiers or details. Also consider
 .. _variables:
 
 Updating regression tests
-~~~~~~~~~
+~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
 
-Changes in |GROMACS| that require changes in regression-tests are notoriously hard,
+Changes in |Gromacs| that require changes in regression-tests are notoriously hard,
 because a merge request that tests against the non-updated version of the
 regression tests will necessarily fail, while updating regression tests while
 the current change is not integrated into master, might cause other
@@ -238,9 +238,9 @@ Other important variable keys are as follows.
     ``BUILD_DIR``, ``INSTALL_DIR``, ``CACHE_FALLBACK_KEY``, ...
 
 Setting variables
-~~~~~~~~~
+~~~~~~~~~~~~~~~~~
 
 Variables for individual piplelines are set in the gitlab interface under 
-``CI/CD``&rarr;``Pipelines``. Then chose in the top right corner ``Run Piplelines``.
+``CI/CD````Pipelines``. Then chose in the top right corner ``Run Piplelines``.
 Under ``Run for``, the desired branch may be selected, and variables may be set
-in the fields below.
\ No newline at end of file
+in the fields below.
index b2da74223b8e5fcb5c23ec2856c1c898a6b158d9..f2c8b0ef666388eff2c6ea76dc6c5e5be4e588ab 100644 (file)
@@ -277,15 +277,15 @@ public:
                       gmx_wallcycle*       wcycle);
 
 private:
-    // The number of vsites that cross update groups, when =0 no PBC treatment is needed
+    //! The number of vsites that cross update groups, when =0 no PBC treatment is needed
     const int numInterUpdategroupVirtualSites_;
-    // PBC and DD information
+    //! PBC and DD information
     const DomainInfo domainInfo_;
-    // The interaction parameters
+    //! The interaction parameters
     const ArrayRef<const t_iparams> iparams_;
-    // The interaction lists
+    //! The interaction lists
     ArrayRef<const InteractionList> ilists_;
-    // Information for handling vsite threading
+    //! Information for handling vsite threading
     ThreadingInfo threadingInfo_;
 };
 
index f19cf70bfaa35cb6cc2c24e3d9268dd3f4cf0ae7..7af6d4e420254714b629fe635d8853cc7431b6f7 100644 (file)
@@ -44,8 +44,11 @@ namespace gmx
 class ConvertTprInfo
 {
 public:
-    static const char                       name[];
-    static const char                       shortDescription[];
+    //! Name of the module.
+    static const char name[];
+    //! Short description what the module does.
+    static const char shortDescription[];
+    //! Instantiatiates the module.
     static ICommandLineOptionsModulePointer create();
 };