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diff --git a/src/spacetimecorr.cpp b/src/spacetimecorr.cpp
index aa5fba4297f1d7f49442a4be929986590bdaab2c..c9fe008bfe5ad0699615ba3712ff9d1f89f5f902 100644 (file)
--- a/src/spacetimecorr.cpp
+++ b/src/spacetimecorr.cpp
@@ -280,7 +280,14 @@ SimpleCorr::initAfterFirstFrame(const TrajectoryAnalysisSettings       &settings
 {
 }
 
-// -s '/home/toluk/Develop/samples/reca_rd/reca_rd.mono.xtc' -f '/home/toluk/Develop/samples/reca_rd/reca_rd.mono.xtc' -n '/home/toluk/Develop/samples/reca_rd/test6.ndx' -sf '/home/toluk/Develop/samples/reca_rd/SelectionList5' -Window 1000
+// -s '/home/titov_ai/BioStore/titov_ai/trp_cage/fullTrj/kv1/trp-cage.pdb' -f '/home/titov_ai/BioStore/titov_ai/trp_cage/fullTrj/kv1/trp-cage.md_npt.no-sol.xtc' -n '/home/titov_ai/BioStore/titov_ai/trp_cage/fullTrj/kv1/CA.ndx' -sf '/home/titov_ai/BioStore/titov_ai/trp_cage/fullTrj/kv1/SLca' -Window 1000 -out_put '/home/titov_ai/BioStore/titov_ai/trp_cage/fullTrj/kv1/window'
+// -s '/home/titov_ai/BioStore/titov_ai/trp_cage/fullTrj/kv2/trp-cage.pdb' -f '/home/titov_ai/BioStore/titov_ai/trp_cage/fullTrj/kv2/trp-cage.md_npt.no-sol.xtc' -n '/home/titov_ai/BioStore/titov_ai/trp_cage/fullTrj/kv2/CA.ndx' -sf '/home/titov_ai/BioStore/titov_ai/trp_cage/fullTrj/kv2/SLca' -Window 1000 -out_put '/home/titov_ai/BioStore/titov_ai/trp_cage/fullTrj/kv2/window'
+
+// -s '/home/titov_ai/BioStore/titov_ai/trp_cage/fullTrj/kv1/trp-cage.pdb' -f '/home/titov_ai/BioStore/titov_ai/trp_cage/fullTrj/kv1/trp-cage.md_npt.no-sol.xtc' -n '/home/titov_ai/BioStore/titov_ai/trp_cage/fullTrj/kv1/CA.ndx' -sf '/home/titov_ai/BioStore/titov_ai/trp_cage/fullTrj/kv1/SLca' -Window 10000 -out_put '/home/titov_ai/BioStore/titov_ai/trp_cage/fullTrj/kv1/window10'
+// -s '/home/titov_ai/BioStore/titov_ai/trp_cage/fullTrj/kv2/trp-cage.pdb' -f '/home/titov_ai/BioStore/titov_ai/trp_cage/fullTrj/kv2/trp-cage.md_npt.no-sol.xtc' -n '/home/titov_ai/BioStore/titov_ai/trp_cage/fullTrj/kv2/CA.ndx' -sf '/home/titov_ai/BioStore/titov_ai/trp_cage/fullTrj/kv2/SLca' -Window 10000 -out_put '/home/titov_ai/BioStore/titov_ai/trp_cage/fullTrj/kv2/window10'
+
+// -s '/home/titov_ai/BioStore/titov_ai/trp_cage/fullTrj/kv1/trp-cage.pdb' -f '/home/titov_ai/BioStore/titov_ai/trp_cage/fullTrj/kv1/trp-cage.md_npt.no-sol.xtc' -n '/home/titov_ai/BioStore/titov_ai/trp_cage/fullTrj/kv1/CA.ndx' -sf '/home/titov_ai/BioStore/titov_ai/trp_cage/fullTrj/kv1/SLca' -Window 100000 -out_put '/home/titov_ai/BioStore/titov_ai/trp_cage/fullTrj/kv1/window100'
+// -s '/home/titov_ai/BioStore/titov_ai/trp_cage/fullTrj/kv2/trp-cage.pdb' -f '/home/titov_ai/BioStore/titov_ai/trp_cage/fullTrj/kv2/trp-cage.md_npt.no-sol.xtc' -n '/home/titov_ai/BioStore/titov_ai/trp_cage/fullTrj/kv2/CA.ndx' -sf '/home/titov_ai/BioStore/titov_ai/trp_cage/fullTrj/kv2/SLca' -Window 100000 -out_put '/home/titov_ai/BioStore/titov_ai/trp_cage/fullTrj/kv2/window100'
 
 void
 SimpleCorr::analyzeFrame(int frnr, const t_trxframe &fr, t_pbc *pbc,