Improved error message
authorMark Abraham <mark.j.abraham@gmail.com>
Tue, 31 Jan 2012 13:43:18 +0000 (00:43 +1100)
committerMark Abraham <mark.j.abraham@gmail.com>
Wed, 1 Feb 2012 01:56:29 +0000 (12:56 +1100)
commitdf3374101d5314fd9cb8afb49e4a6b6dfe1b320b
treeffb4d254971b8758650df2181f3ae74e7c31c22a
parent0456055cfabeec62a8c9e8d596fcb4f8daebdcf0
Improved error message

Users would be confused by "Atom N3 is used in an interaction of
type atom in the topology database..." so when "atom" is the
bondtype we don't mention the fact.

Also changed variable name from bDontQuit to bAllowMissing for
consistency with variable names used in pdb2gmx when calling
this code.

Change-Id: Ie8cb3ba64f39d3746b470fa6ae44f5a6f4b6a16c
src/kernel/pgutil.c
src/kernel/pgutil.h