Added mdp option 'calc-lambda-neighbors'.
authorSander Pronk <pronk@kth.se>
Tue, 15 Jan 2013 12:19:23 +0000 (13:19 +0100)
committerGerrit Code Review <gerrit@gerrit.gromacs.org>
Thu, 17 Jan 2013 15:40:49 +0000 (16:40 +0100)
commit46bc0def055dc0b69ce2d15b12ee0f6baf21c4f0
treeae3f1f72f9848d2ab34b74133152045d79a8ac32
parent23eb71d14195e494f215bca1115bdb0b47bd5cf7
Added mdp option 'calc-lambda-neighbors'.

Added an option 'calc-lambda-neighbors' to limit the number of free
energy delta H evaluations and output operations: this value sets the
amount of neighboring lambda points to calculate and print the energy
for. If it's 1, it will only calculate directly adjacent lambda points'
energies (if it's -1, it will calculate all points). This tremendously
cuts down the number of (expensive) energy calculations done without
impacting the results for most users

Note that this commit only limits the number of outputs, not the number
of calculations. That is left for a later commit.

Change-Id: I10590dd1a2036b529946da86b414c2561d14bda1
include/types/inputrec.h
share/html/online/mdp_opt.html
src/gmxlib/tpxio.c
src/gmxlib/txtdump.c
src/kernel/readir.c
src/kernel/tpbcmp.c
src/mdlib/mdebin.c
src/mdlib/mdebin_bar.c